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AI科研绘图--DNA双螺旋
2020-9-16 08:16
上一期我们学习了如何用AI绘制细胞膜,大家掌握的如何? 今天我们的AI小课堂又开课了,来教大家DNA双螺旋的画法。 第一步:画出DNA的两条链; 波浪型线条可以由AI的效果工具中的 波纹效果 实现 (高级玩家也可直接使用“钢笔工具”进行绘制) DNA的另一条链,采用之前 ...
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AI科研绘图—细胞膜速成大法
热度 1 2020-9-14 09:43
不知大家是否有这样的体验? 科研之初阅读文献时,惊艳于高分文章中的漂亮精美的流程图、模式图; 在发表文章时,却为了能画出上述模式图而焦头烂额。 在组学研究中,当涉及到RNA调控、分子机制时,经常会以细胞模式图的形式展现分子的作用机制,如下图所示: ( Manvati M K S, Khan J, ...
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高颜值多维venn图——你学会了吗?
2020-9-12 10:17
维恩图(Venn diagram),也称韦恩图、文氏图、温氏图,是利用集合分类的原理将特定的数据进行分类或归类。 在生信分析中,Venn图可用于统计多组或多个样本中共有和独有的物种的(OUT、Gene)数目,可以比较直观的展现不同环境样本中物种的OTU或者样本之间的Gene组成相似性及重叠情况,一般用于2~7组数据的比较分 ...
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一个从FASTA文件中提取特定序列的脚本
2020-9-11 08:23
最近有个老师在做基于十多个保守基因的进化树分析,需要从几十个基因组中分别提取出特定的基因序列,如果对于每个基因都是“查找基因ID→复制基因序列→粘贴到文档中”这么一个循环,不仅仅是工作量极大,还非常容易出错。基于这类需求,我们今天分享一种快速提取序列的方法:一个从FASTA文件中提取特定序列的脚本。 ...
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一文学会质粒图谱绘制软件——SnapGene viewer
2020-9-11 08:17
SnapGene viewer 是SnapGene 的免费版本,虽然它删减了一些功能,但对于初学者来说依然很实用哦。SnapGene Viewer包含与完全启用的SnapGene软件相同的丰富可视化,注释和共享功能。 https://www.snapgene.com/ 这是软件简单的介绍哦!Map:显示图谱;Sequence:显示序列信息;F ...
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使用SnapGene viewer绘制比较基因簇结构图
2020-9-10 08:17
前期介绍了如何使用SnapGene viewer 寻找酶切位点和设计引物 , SnapGene viewer是一款专业的质粒图谱绘制软件,也可以绘制比较基因簇结构图。今天以基因组里的 原噬菌体 为例,在这里教大家使用SnapGene viewer绘制比较基因簇结构图,想要学习 ...
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Fastaq——fasta文件转化为fastq文件
2020-9-9 08:19
分析背景 FASTQ: Fastq是Solexa测序技术中一种反映测序序列的碱基质量的文件格式。每条read包含4 行信息。第一行以“@”开头,随后是序列标示和相关的描述信息,第三行以“+” 开头,随后是序列描述信息或者什么都不加;第二行为碱基序列,第四行是质量信息,与第二行中的碱基序列一一对应,如下图所示: FAST ...
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UpSet——可视化的集合图
2020-9-4 08:55
分析背景      集合的可视化,首先想到的肯定是venn图绘制方法。此绘制方法基于R语言,并根据项目经验,将常规的代码语句进行封装。然后将整理好的数据传入到函数中,即可得到高质量的Venn图。但是,当集合数较多如出现7个以上的时候,再使用Venn图就会显得多而散。    &# ...
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AI科研绘图--常见问题汇总
2020-8-26 08:47
AI科研绘图--常见问题汇总 做科研工作者在使用AI绘图软件时,经常会被一些 小问题、小功能 难住,今天为大家总结了 常用AI小知识点 ,希望对大家有所帮助。 1、黑白箭头傻傻分不清 有的同学在用PS处理实验图像时,通过选择箭头可实现对于图片的处理 ...
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