李泽旭
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教育情况:北京化工大学,化学工程学院,硕士在读
研究领域:化学科学->物理化学->化学科学
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[转载]如何设置环境变量
右击 我的电脑 ——高级系统设置——环境 变量 ——在 系统变量 里有path选项——双击打开——在原有变量的基础上添加英文状态下的分号——然后将路径名输入即可。(切记,不要删除原先的 系统变量 ,只要用分号隔开,然后添加,最后也要加上分号)
2020-7-14 23:18
sed 批量固定原子
当我们做过渡态时可能生成很多POSCAR 这些POSCAR 都需要去固定 一个一个去固定很麻烦 比如你查15个点 有15个文件夹里的POSCAR 去固定。 我找了一天,找到了用sed 命令去批量固定原子,等操作 指定行尾添加F F F for i in {1..16} ;do cd $i ; sed -i '10,63s/$/ F F F/g' POSCAR ; cd .. ; done 指 ...
2020-7-6 22:28
ase 查看vasp 结构优化OUTCAR 文件
使用ase -T gui OUTCAR 命令 可以打开结构优化的OUTCAR 文件 点击左上角的播放可以显示整个优化过程 Frame rate 可以调节播放速度 右上角的图像可以显示整个优化过程能量随离子步降低的图像 ase 万岁!
2020-6-27 09:54
使用ase 建模 ,切晶面
ase 可以建模 ,切晶面 ,扩胞等一系列操作十分方便 第一步建模 通过ase 可以读取POSCAR xyz 等文件, 就直接建模了,十分方便。也可以自己搭建模型。也可写出文件,这个功能可以转换文件格式 ase.visualize 可以查看原子结构 import ase from ase.io import read ,write from ase.visualize import view ti ...
2020-5-30 22:18
ase gui 查看过渡态图像
我们可以使用ase gui 命令查看 idpp.py 插的点 ase -T gui 00/POSCAR 01/POSCAR 02/POSCAR 03/POSCAR 04/POSCAR 05/POSCAR 06/POSCAR 07/POSCAR 打开后可以得到如下 按play 可以播放,可以很方便的查看过度态找的对不对。 个人觉得idpp.py 找的比nebmake.pl 准
2020-5-26 16:31