GO/KEGG富集分析图是测序公司分析报告里的标配，大家都习以为常，如果想自己操作，怎么办呢？

1. 拿到公司的GO/KEGG背景文件，将自己筛选到的差异基因在各个公司云平台上运行，例如基迪奥和欧易云平台。

2. DAVID与KOBAS在线分析，参考https://www.jianshu.com/p/85ff36fae727，最好再看一下介绍DAVID的视频http://www.360doc.com/content/19/0225/22/17259149_817530011.shtml

3. 利用string数据库（string-db.org/）和Metascape数据库（metascape.org/），这两个数据库高大上，功能也很丰富，遗憾的是Metascape只针对模式动物。操作简单，可参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/95883272

4. 另外据说还有GOEAST（参考https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/78041296）和专门针对农业动植物的AgriGO（http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/c_SEA.php，可通过标题栏的CUSTOM TOOL-SEA进入）。

以上几款工具笔者都尝试过，除了GOEAST和AgriGO可能因为运行太慢没有获得结果外，其他表现都很不错。需要注意的是，从非模式动物获得的差异基因因为名称不统一，在运行的时候或多或少会出现比对不上的情况，因此，要注意GO/KEGG富集分析覆盖面的问题，不要遗漏GO term或KEGG pathway之外的基因。