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数说新冠:辽宁省新型冠状病毒肺炎疫情统计分析

已有 17573 次阅读 2020-2-21 11:39 |个人分类:科研笔记|系统分类:科研笔记

辽宁省新型冠状病毒肺炎疫情统计分析

郭崇慧1,2,左玉倩1,2

(1.大连理工大学 大数据与智能决策研究中心, 辽宁 大连, 116024)

(2.大连理工大学 经济管理学院 系统工程研究所, 辽宁 大连, 116024)

摘要:本文对辽宁省2020122日至220日期间公开报导的121例新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例进行了疫情统计分析,基于统计结果对疫情防控提出建议。分析包括每日新增及累计确诊患者数目、患者性别年龄分布、患者武汉旅行史和接触史分析、患者家族聚集性网络分析、病毒潜伏期和患者由暴露到患病的转移情况。研究结果表明,辽宁省确诊患者每日新增数量在131日达到峰值,而后逐渐下降;确诊患者中男性占比54%,数量多于女性,患者年龄基本呈现正态分布,处于31-40岁区间人数最多;患者发病具有家族聚集性的特点,与确诊患者有接触史(亲属或朋友)更易患病,相关系数为0.9099。辽宁省COVID-19的平均潜伏期约为7.767天,潜伏期大于等于8天的患者占比55.8%,数据结果比真实情况偏大。该研究基于官方报导的实际数据,以期为辽宁省积极应对疫情提供依据和参考。

关键词:新型冠状病毒肺炎;流行病学分析;统计分析

引言

流行病学调查研究显示,2019年底爆发于湖北省武汉市的新型冠状病毒肺炎(简称“新冠肺炎”)与武汉市华南海鲜市场有关,伴随着春运期间中国大范围的人口流动,该病情在全国范围内蔓延,同时,涉及全球多个国家[1-3]。新冠肺炎的传染性不亚于SARS-CoVMERS-CoV,该特性通过确诊患者数量和确诊患者间亲属关系得到印证[4-5]2020130日,世界卫生组织总干事宣布2019年新型冠状病毒的爆发构成了国际关注突发公共卫生事件[6]。因此,及时有效地对疫情数据进行流行病学统计分析,对于疫情防控具有重大意义。目前,广东省、河南省、重庆市等地区已经对新型冠状病毒肺炎疫情情况进行了研究。广东省相关研究针对广东省卫健委公布的数据对新型冠状病毒肺炎的流行趋势[7]和时空分布情况进行了探索[8],分别采取构建传染病动力学SIR模型和描述性统计分析的方式进行疫情预测和统计性分析。河南省相关研究针对河南省卫健委公布的数据采取统计分析的方式,对河南省1105例病例的确诊数量、性别、年龄、接触史、发病规律等进行了分析[9],为了解河南省疫情规律提供依据。重庆市相关研究针对重庆市卫健委披露的数据应用SIR传染病模型对疫情发展情况进行预测[10]

本文收集辽宁省122日至220日期间各地卫健委公布的确诊患者病例及确诊前行程轨迹进行流行病学统计分析,有助于了解辽宁省疫情发展规律。

截至202022024时,根据辽宁省卫生健康委员会公布的数据显示,辽宁省累计报告新型冠状病毒肺炎确诊病例121例,治愈出院61例,死亡1[11]121例确诊病例中,沈阳市28例、大连市19例、鞍山市4例、本溪市3例、丹东市7例、锦州市12例、营口市1例、阜新市8例、辽阳市3例、铁岭市7例、朝阳市6例、盘锦市11例、葫芦岛市12[11]。辽宁省新型冠状病毒肺炎疫情分布如下图1所示[12]

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           (a) 累计确诊人数分布                    (b)现存确诊人数分布

1  辽宁省新型冠状病毒肺炎疫情分布(数据来源:丁香园)

确诊病例时间序列分析

122日至22024时期间,辽宁省每日增加及累计确诊患者数量如下图2-4所示。

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2  1月22日-2月20日期间每日新增患者数量

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3  1月22日-2月20日期间累计确诊患者数量走势图

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            (a) 每日新增患者数量热图            (b) 累计确诊患者数量热图

4  辽宁省14个地区每日新增患者数量及累计确诊患者数量热图

   由图可知,辽宁省每日新增确诊患者数量在1月31日达到峰值,随后整体呈现下降趋势,由于每日新增患者数量较31日下降,累计确诊患者数量走势图逐渐趋于平缓,从图3可以看出目前全省新增确诊患者数量呈现减少趋势,截至2月20日已连续四天无新增确诊患者。该现象表明自新型冠状病毒爆发以来,辽宁省采取的阻断交通、隔离、加强提高居民意识等积极防控手段取得了良好的成效。

确诊病例性别及年龄分布

    根据辽宁省各地区卫健委公布的患者信息,统计得到患者性别和年龄数据。其中,性别数据中沈阳市2例病例无相关信息;年龄数据中沈阳市2例、朝阳市1例、盘锦市5例无相关信息,剔除缺失数据得到下图5-7统计结果。   

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5  辽宁省14地区确诊病例男女对比

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6  辽宁省确诊病例各年龄段分布

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7  辽宁省14地区确诊病例年龄分布

      在辽宁省确诊病例中,男性整体占比54%,女性占比46%,男性比例偏高。从各地区来看,沈阳、大连、锦州、葫芦岛患者数目居于省前四名,在这四个地区中,沈阳、大连、葫芦岛男性比例大于女性,锦州男女比例相同,男性患者较多可能由于其活动范围广所致。同时,沈阳、大连、锦州、葫芦岛等大城市人员流动性较大,有较大的感染风险,是确诊患者数量相对较多的一个原因。

患者年龄基本呈正态分布。其中,21-60岁区间患者数目占比78.2%,该部分患者活动能力较强,有强烈的社交需求,外出务工、求学或旅游等活动均增加了感染风险。患者人数在31-40岁区间最多,是感染的重点人群,此年龄范围居民建议着重加强防护。

确诊病例武汉旅行史及接触史分析

根据患者是否有武汉(湖北)旅行史和确诊病例(或武汉人员)接触史,将患者分为四类:有武汉旅行史(无接触史)、无武汉旅行史(无接触史)、有确诊患者接触史(有旅行史)和无武汉旅行史有接触史,统计得到相关数据。

对于已公布但未详细说明是否有武汉(湖北)旅行史的患者将其认定为无武汉旅行史人员,剔除沈阳市未披露信息的病例28,统计得到14地区确诊病例分类。

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8  辽宁省14地区确诊病例武汉旅行史及接触情况统计

     目前,121名确诊患者中120名披露了相关信息,确诊患者出行方式涉及私家车、火车、出租车、飞机、摆渡车。其中55名存在武汉旅行史,65名存在接触史。下面分别分析有武汉旅行史和有接触史的确诊患者与当前各地区确诊人数的关系,建立线性回归方程,计算相关系数从而分析相关性,用于指导实践。 

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                          (a)有武汉旅行史人数分析          (b)有接触史人数分析

9  各地区有武汉旅行史、有接触史人数与当前确诊人数分析

9a)拟合直线方程为y = 1.7386x + 1.6169x为各地区确诊人员中有武汉旅行史人数,y为各地区当前确诊人数,相关系数为0.8587,二者呈现相关性,说明有武汉旅行史是影响患者患病的一个因素[13]。图中数据显示大连市当前确诊人数与有武汉市旅行史人数比值最大,说明大连市对排查有无武汉返乡或接触人员采取了较大的力度并使患者及时得到医治[9]

9b)拟合直线方程为y = 1.6737x + 0.8007x为各地区确诊人员中有接触史的人数,y为各地区当前确诊人数,皮尔逊相关系数为0.9099,二者呈现较高相关性。结果表明有接触史的人更容易患病,官方报告的病例中确诊患者多倾向于其他已确诊患者的朋友、亲属等与其有密切接触的人,与统计结果相一致。因此,分析结果表明:人群聚集、与他人接触会增加患病的风险,居家隔离可以降低风险。

确诊人员场所聚集性及家族聚集性网络分析

截至220日,辽宁省已成立沈阳、大连、锦州三个省集中救治中心,分别依托于沈阳市第六人民医院、大连市第六人民医院和锦州市传染病院[11],其中,沈阳救治中心覆盖沈阳、鞍山、抚顺、本溪、阜新、辽阳、铁岭、盘锦等8市;大连救治中心覆盖大连、丹东、营口等3市;锦州救治中心覆盖锦州、朝阳、葫芦岛等3[14]

分析已确诊患者之间的亲属或朋友关系、患者在医院的就诊情况以及患者在医院间的转院情况得到如图10所示的网络图。image.png

10  辽宁省14地区医院及确诊患者聚集性网络分析 

图10中节点分别表示患者(红色)和医院(蓝色)。医院间的连接关系表示患者的转院情况,患者与医院间的指向关系表示患者的就诊情况,患者之间的连接关系表示亲属或朋友关系。图中节点大小与医院接诊人数或与确诊患者有亲属(朋友)关系的人数成正比。医院治疗患者人数(度)=医院接诊人数+转至此医院的患者人数,患者的度=与该患者有关的确诊人数(亲属或朋友)+就诊医院数目[9]。医院间可能存在多个患者转院,两医院间边的粗细与转院的患者数目成正比,根据转移的患者数量将权重设定为相应的数值,其余权重默认为1

在患者转院关系中,依据国家提出的“四集中”[14]工作原则,患者在本地确诊后多转院至省集中救治中心治疗。依据官方公布的数据可以明确知道患者在地区内部的转院情况以及各地区转移至省集中救治中心的患者数目,但是无法建立具体病例及其就诊医院与省集中救治中心的转院关系。因此,图10建立的聚集性网络时对各地区医院向省集中救治中心转移患者的情况不做分析。

图10聚集性网络分析结果表明:在本地的确诊患者救治中,鞍山市“台安县恩良医院和“鞍山市传染病医院”间患者转院次数最多,对应图中边最粗;由图中确诊患者间连接关系可以看出此次传染病存在明显的聚集特点[15],多地区确诊患者之间多存在亲属或朋友关系,其中,鞍山市和盘锦市的确诊患者具有亲属关系,出现跨地区感染的情况,具体为鞍山市病例2、病例3为夫妻关系,盘锦市病例9、病例10为夫妻关系且为鞍山市病例2、3的儿子儿媳,盘锦市病例10为病例9、10的儿子。除上述在辽宁省内跨地区感染的情况外,其余均为地区内部感染,说明政府在患者确诊后其密切接触人员及时隔离和交通管控等方面取得了很好的效果。

从图10中分别抽取出沈阳市、大连市的数据,得到图11沈阳市、大连市确诊患者聚集性网络分析图。其中,大连市确诊病例3、4、5、6、8、9、10、11、18病例信息显示收治于“某定点医院”。根据“四集中”工作原则,省集中救治大连中心覆盖范围的患者转院至大连市第六医院集中救治,因此,数据分析时将大连市收治于“某定点医院”的患者确定为大连市第六人民医院就诊患者。

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               (a)沈阳市确诊人数聚集性网络     (b)大连市确诊患者聚集性网络

11  沈阳市、大连市医院及确诊患者聚集性网络分析 

沈阳市和大连市是辽宁省规模较大的地区,确诊患者人数居于全省第一、二名。图11分析结果显示,沈阳市沈阳第六人民医院首次收治患者数目最多,其次为中国医科大学附属第一医院,患者就诊后共发生三次转院;确诊患者中具有亲属(或朋友)关系的病例为:确诊病例6、7、8,确诊病例18、19、20,确诊病例4、5、9,确诊病例16、17,确诊病例24、15。大连市第六人民医院收治患者数目最多,其次为大连医科大学附属第一医院,确诊患者中具有亲属(或朋友)关系的病例为:确诊病例3、5、8,确诊病例6、9、10、12,确诊病例7、11,确诊病例17、18、19。

沈阳市和大连市新冠肺炎的传播均表现出家族聚集性的特点,印证了其有人传人的特性,这提示我们疫情期间减少聚集,一旦家庭成员或所接触人员发生病情,自身应及时隔离,提高防范意识。

在提升患者治愈水平及有效管控疫情上,除去转院至省集中救治中心的患者,我们分析各地区医院接诊患者人数,得到图12所示结果。 

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12  辽宁省收治病人前10的医院人数 

图12中的分析结果表明沈阳市第六人民医院、盘锦市传染病医院和大连市第六人民医院收治患者人数最多,其次为中国医科大学附属第一医院、葫芦岛市中心医院和大连医科大学附属第一医院,沈阳市和大连市收治患者数量整体较多。在资源调配上,除了将资源分配至省集中救治中心外,还需关注各地区患者确诊及其初步治疗的医院,做到资源有效配置。

确诊病例潜伏期分布

病毒潜伏期是指从病原体侵入人体到最初出现临床症状的一段时期[12]。根据国家公布的信息显示,新型冠状病毒的潜伏期为14天。随着新型冠状病毒有潜伏期感染、无症状感染等情况,我们难以准确得到新型冠状病毒的潜伏期。

本文假定将患者到达武汉(或返程)时间、与有武汉旅行史人员接触时间、与所接触确诊患者的首次接触时间确诊时间均定义为“病原体侵入人体的时间,取三者最早者,应用该时间多存在误差;将患者发病时间确定为出现临床症状的时间,二者之间的时间间隔定为病毒潜伏期。同时去除潜伏期大于14天及无相关信息披露的患者,得到86例患者数据,分析结果如表1和图13、图14所示。 

1  86例确诊患者潜伏期统计信息

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                                 图 13  不同病毒潜伏期确诊患者人数分布

辽宁省有数据可查的86例确诊患者中,病毒潜伏期均值为7.767天,潜伏期大于等于8天的患者人数为48人,占比55.8%。患者出临床反映的时间是确定的,但是感染病毒的时间是不确定的,用患者到达武汉(或返程)时间、与有武汉旅行史人员接触时间、与所接触确诊患者的首次接触时间确诊时间定义为感染时间会使统计的潜伏期大于实际潜伏期,使得分析结果偏大。 

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14  患者1月9日至2月20日期间转入转出人数分布 

图14为患者1月9日至2月20日期间转入转出人数分布,转入对应患者出现临床症状,转出对应于暴露,即患者到达武汉、与有武汉旅行史人员接触或与确诊患者首次接触的时间。图14数据表明在1月25日前有临床症状患者占比低于暴露患者,之后这些潜伏期人员逐渐出现临床症状,疾病爆发,确诊人员数目逐渐增加。若及时采取有效的手段控制疫情传播,则1月27日之后几乎不再有人员处于潜伏期,这时前期潜伏期患者逐渐发病,这批确诊患者若同时采取有效的医疗手段得到治疗,则疫情传播会逐渐被控制。 

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15  1月9日-2月20日患者由暴露到患病人数转移图 

图15为截至2月20日确诊患者由暴露到患病人数转移网络分析图,图中节点为日期,节点大小与当日暴露和有临床症状的患者之和成正比,节点间指向关系为患者由暴露转移到患病的时间间隔,图15结果显示1月19日至1月24日期间人数最多,暴露和患病人数之和随时间呈现先增加后减少的趋势。

结论

本文对辽宁省公布的121例新型冠状肺炎确诊患者进行了统计性分析。数据表明辽宁省患者日增加量在1月31日达到峰值,之后确诊患者数量逐渐下降,说明疫情防控取得了成效;14地中沈阳(28例)和大连(19例)确诊患者人数较多,确诊患者数量可能与城市规模和人员流动性有一定联系;全省确诊患者中,男性占比54%,数量多于女性;患者年龄基本呈现正态分布,处于31岁-40岁区间人数最多,这可能与患者活动能力较强,有强烈的社交需求,需要外出务工、求学或旅游等活动有关,是易感染人群,需要重点防护[16]

分析确诊患者之间的联系我们发现,与确诊患者有接触史的人员更易患病,有无武汉旅行史均会导致患病。辽宁省14地区的新冠病毒发病具有家族聚集性的特点,一般情况下病人确诊后,其亲属关系人员比朋友关系人员有更高的感染风险。

对辽宁省86例患者的潜伏期数据分析得到COVID-19的平均潜伏期约为7.767天,潜伏期大于等于8天的患者占比55.8%。潜伏期根据不同省份、地区报导的数据有不同[9],因此,确定病原体的潜伏期对疾病发现和防控有重要的意义。

辽宁省新型冠状病毒肺炎自2月17日以来,已连续四天无新增确诊患者,疫情形势出现积极变化,防控工作取得积极成效[17]。自疫情爆发以来,全省社会经济活动停滞,连续四天无新增确诊患者的态势为尽快恢复辽宁省社会经济秩序提供了支持。目前,辽宁省不同市、县疫情防控情况不同,推动复工复产不能一概而论。相关文件指出,辽宁省将以县(市、区)为单位,科学研判风险,实施差异化防控,将全省划分为低风险、中风险、高风险地区,分别采取“外防输入”、 “外防输入、内防扩散”、“内防扩散、外防输出、严格管控”的策略[17]。逐步推进复工复产首先要求交通畅通,其次为企业资源配置问题。人员流动会增加疫情传播的风险,这就需要政府结合各地区疫情情况,在恢复人民生产生活秩序和减少疫情传播层面做到平衡,加强易感人群管理,同时要求复工员工提高防控意识,减少聚集,这样才能逐步消灭疫情,使社会生活秩序恢复。

上文分析的数据来自辽宁省卫健委和其下辖14个地区卫健委公布的病例信息,数据收集力求全面但难免存在误差,部分分析数据剔除了无效信息,结果可能存在偏差,但能从整体上反映发病趋势,为了解辽宁省疫情情况作参考。 

参 考 文 献

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[10]杨雨琦,孙琦,王悦欣,等.重庆市新型冠状病毒肺炎(NCP)疫情分析与趋势预测[J/OL].重庆师范大学学报(自然科学版):1-6[2020-02-21]. http://kns.cnki.net/kcms/detail/50.1165.n.20200218.0746.002.html.

[11]辽宁省卫生健康委员会. 2020年2月20日0时至24时辽宁新型冠状病毒肺炎疫情情况[EB/OL]. 2020-02-20[2020-02-21].http://wsjk.ln.gov.cn/wst_wsjskx/202002/t20200221_3746048.html

[12]丁香园. 新冠病毒最新实时疫情地图. 2020-02-21[2020-02-21]. https://ncov.dxy.cn/ncovh5/view/pneumonia

[13]Chan J F W, Kok K H, Zhu Z, et al. Genomiccharacterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from apatient with atypical pneumonia after visiting Wuhan[J]. Emerging Microbes& Infections, 2020, 9(1): 221-236.

[14]辽沈晚报. 辽宁3个集中救治中心全部启用,3支省市联合医疗队进驻[EB/OL]. 2020-02-09[2020-2-20]. https://baijiahao.baidu.com/s?id=1658036273096031419&wfr=spider&for=pc

[15]Chan J F W, Yuan S, Kok K H, et al. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster[J]. The Lancet, 2020, doi:10.1016/S0140-6736(20)30154-9.

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[17]辽宁省新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控指挥部. 辽宁省新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控指挥部令(第6号). 2020-02-19[2020-02-21]. http://wsjk.ln.gov.cn/wst_wsjskx/202002/t20200219_3744888.html

 




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