mRNA 的 3'UTR 在基因转录后调控中起着重要作用，如稳定性、翻译和定位。大部分稳定性和翻译调节功能是通过嵌入的序列和结构基序介导的，如miRNA 靶点和各种富含AU和GU的元件。此外，越来越多的研究发现3'UTR 在mRNA 定位中发挥作用，尤其是在极化细胞中 。

APA的调控是基因表达的一个重要环节。大多数哺乳动物基因转录本具有多个多聚腺苷酸化位点 (PAS)，不同多聚腺苷酸化位点被使用导致产生具有不同 3'UTR 大小的转录本。基因的APA亚型表达谱在细胞类型之间存在明显差异，并且在各种条件下动态调节，如细胞增殖、分化和发育，肿瘤发生，细胞活化和细胞应激。

编码膜蛋白和分泌蛋白的转录本通常在内质网 (ER) 上进行翻译。信号识别颗粒 (SRP) 与新生多肽结合，将mRNA引导至内质网的胞浆表面。因此，该mRNA与 内质网的关联是翻译依赖性的。同时，越来越多的证据表明，一些mRNA与 内质网的关联，与翻译无关。除此之外，发现mRNA也与内体、线粒体和核糖体等其他细胞器相关联。

不同转录本特征（尤其是3'UTR）究竟在多大程度上介导了与细胞器的关联性，目前尚不清楚。

非翻译依赖性的内质网关联模型示意图

内质网是一个庞大而复杂的亚细胞网络，与细胞核和其他细胞器均有密切联系。编码非分泌蛋白质或非膜蛋白的mRNA，具有较高的TiERA倾向，导致 mRNA 翻译和降解的局部调节。课题组发现具有高TiERA倾向的转录本往往在信号通路中具有功能。

相反，具有较低 TiERA 倾向的转录本，富集代谢过程功能，定位于线粒体和其他亚细胞区，可能通过避免与内质网关联而获得了在自由移动的能力。如在蛋白质修饰、免疫系统和肿瘤发生过程中起重要功能的NMT1，其长3'UTR比短3'UTR的mRNA更倾向于内质网关联。

研究人员最近发现与其前体细胞相比，具有高蛋白质生产活性的分泌细胞更倾向于表达具有较短 3'UTR的转录本。一种可能性是表达较短的 3'UTR 可以避免与内质网关联，从而减轻内质网上转录物拥挤，从而避免内质网压力和相关的 mRNA 降解途径的激活。相反，某些细胞（如神经元细胞）倾向于表达长 3'UTR的转录本。TiERA 机制如何在这些细胞中参与局部翻译和降解需要进一步研究。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109407