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Striped UniFrac

已有 1943 次阅读 2018-11-8 09:38 |个人分类:生物统计软件|系统分类:科研笔记| UniFrac, QIIME

参考:https://www.nature.com/articles/s41592-018-0187-8#MOESM6

          https://github.com/biocore/unifrac


这是一种更快速,占用内存更少的计算UniFrac距离矩阵的方法,支持unweighted UniFrac, weighted UniFrac, generalized UniFrac, variance adjusted weighted UniFrac, 和meta UniFrac.


有多种方式来安装库,最常使用的是两种,一种是QIIME2,一种是pip。最简单的方式是QIIME2,默认安装此模块。


QIIME2的安装见https://docs.qiime2.org/2018.2/install/



(未完)



https://wap.sciencenet.cn/blog-3388297-1145144.html

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