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ubuntu中安装tqDist

已有 1261 次阅读 2018-7-28 15:15 |个人分类:生物统计软件|系统分类:科研笔记| ubuntu, tqDist, cmake, make, cmake, make

 安装教程及其他参考http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/

具体如下:


wget http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/files/tqDist-1.0.1.tar.gz
cd <path-to-file>
tar -xvf tqDist-1.0.1.tar.gz

cd ./tqDist-1.0.1/
cmake .
make
make test
make install


若没有安装cmake,参考http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=3388297&do=blog&quickforward=1&id=1126252


在make时出现错误 error: ‘strcmp’ was not declared in this scope

具体解决方法是在/tqDist-1.0.1/tqDist/中找到如下程序,在源代码开头加上下面的内容即可

#include <cstring>

需要修改的程序代码:

pairs_quartet_distance.cpp

triplet_dist.cpp

pairs_triplet_distance.cpp

quartet_dist.cpp


参考:http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/

          https://blog.csdn.net/dragoo1/article/details/9415379


若在 make install 时出现错误 CMake Error at tqDist/cmake_install.cmake:47 (file):

      file INSTALL cannot copy file "/tqDist-1.0.1/bin/triplet_dist" to "/usr/local/bin/triplet_dist".

则使用命令 sudo make install



https://wap.sciencenet.cn/blog-3388297-1126344.html

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