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python 输出到文件不缓存,即时输出
赵志强 2021-4-25 22:34
在linux中使用python xxx.py out.log会出现文件不实时输出,缓存很久才输出的现象,解决这个问题的办法如下: 1.使用-u参数,即python -u xxx.py out.log 參考:https://blog.csdn.net/weixin_41712499/article/details/102976706 2.如何python程序中使用了write向文件中写入数据,避免缓存 ...
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[转载]VASP固定晶轴优化
赵志强 2021-4-9 09:07
转自: http://bbs.keinsci.com/thread-9494-1-6.html SUBROUTINE CONSTR_CELL_RELAX(FCELL) USE prec REAL(q) FCELL(3,3) DO I=1,3 FCELL(3,I)=0 FCELL(I,3)=0 ...
个人分类: VASP|3057 次阅读|没有评论
为什么反应力场中不能使用neigh_modify exclude排除掉一种原子类型与另一种原子类型的相互作用
赵志强 2021-1-8 15:57
参考: https://lammps.sandia.gov/threads/msg62050.html
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分子力场下载
赵志强 2021-1-4 22:46
http://kiff.vfab.org/
个人分类: MD|1582 次阅读|没有评论
TabError: Inconsistent use of tabs and spaces in indentation
赵志强 2020-10-10 16:59
Python对行与行之间的缩进要求比较严格,如果空格与制表符混用经常会出现: TabError: Inconsistent use of tabs and spaces in indentation 解决办法用notepad++把制表符全部替换为空格 具体请参考: https://www.cnblogs.com/doublesnow/p/8654882.html
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模仿LAMMPS fix ave/time的时间平均代码
赵志强 2020-6-29 09:40
LAMMPS fix ave/time的用法如下,模仿这个平均规则写了个python小脚本(见附件) TimeMean.py
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使用VMD渲染高分辨率的图片
热度 1 赵志强 2020-6-8 19:20
参考: http://bbs.keinsci.com/thread-9178-1-1.html 使用VMD渲染高分辨率图片的步骤如下: VMD Main中选择File----Render,然后选择Tachyon作为渲染器,然后点击Start Rendering会在VMD的目录中生成vmdscene.dat文件(里面包含了绘制图像所需要的信息) Windows下使用xxx.bat文件进行将vmdscene.dat中 ...
个人分类: MD|19211 次阅读|1 个评论 热度 1
能量单位换算
赵志强 2020-5-26 21:15
图片来自于: http://web.utk.edu/~rcompton/constants
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LAMMPS error的解决
赵志强 2020-5-26 20:51
最近用LAMMPS的时候遇到一个非常boring的错误: ERROR: Expected floating point parameter in input script or data file (../pair_lj_cut_coul_long.cpp:630) 最终还是在Google上面找到了解决办法: https://lammps.sandia.gov/threads/msg73070.html
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Pair_style lj/cut command
赵志强 2020-5-25 21:24
本文参考自:LAMMPS-mannual LAMMPS mannual中包含一系列的pair_style lj/cut command,比如我经常使用的: pair_style lj/cut command pair_style lj/cut/coul/cut command pair_style lj/cut/tip4p/long command 对于Tip4p的水模型:
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