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BraveZhao

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Tcl language ---foreach 与for command: 赵志强 2020-5-9 21:01; foreach命令实现一个循环，其中循环变量采用一个或多个列表中的值。在最简单的情况下，有一个循环变量varname和一个列表list，这是要分配给varname的值的列表。body参数是Tcl脚本。对于列表中的每个元素（从头到尾的顺序），foreach都将元素的内容分配给varname，就像使用lindex命令提取元素一样，然后调用Tcl解释器执行主 ...; 个人分类: MD|3183 次阅读|没有评论

Molecules (Mol) Form--VMD: 赵志强 2020-5-8 20:04; Mol或者 Molecules样式显示了加载分子的整体状态。VMD可以同时显示任意数量的分子。每个分子都可以单独隐藏起来，固定在适当的位置（例如，避免受到鼠标旋转命令的影响）。Form包含用于改变分子（单独或成组）状态的控件。位于中心的browser显示有关每个分子的信息。The Name 是包含拓扑信息的 ...; 个人分类: MD|2088 次阅读|没有评论

[转载]LAMMPS-用fix nve一定表示NVE系综的模拟么: 赵志强 2019-6-26 08:59; 首先要声明的是，或者要强调的是：命令和系综没有直接联系，除非你的in文件里只有一个和系综相关的fix. 我们知道，按统计物理的概念来讲，我们常用的模拟系综分NVE（表示系统粒子数、体积、总能量保持不变，是为微正则系综），NVT（表示，粒子数、体积、温度保持不变，是正则系综，大多数体系都会用此系综进行抽样），NPT ...; 个人分类: MD|5944 次阅读|没有评论

水分子模拟之TIP4P/2005: 热度 1 赵志强 2019-6-17 17:13; 参考资料： http://www.orsi.sems.qmul.ac.uk/downloads.html Tip4p2005 data文件格式: LAMMPS'data.'description 3atoms 2bonds 1&n ...; 个人分类: MD|6458 次阅读|2 个评论热度 1

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