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置顶 · 用AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接
热度 1 2017-12-20 20:58
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! Autodock 分子对接教程 First release:2017-12-20 Last update: 2018-07-24 Autodock 是一款分子对接软件包,开源且免费,官方网址是 http://autodock.scripps.edu/ ,目前最新的版本是 AutoDock 4.2.6 ,包括 ...
个人分类: 软件学习|26453 次阅读|3 个评论 热度 1
批量下载Zinc数据库中小分子
杜文义 2018-1-31 15:19
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! 批量下载Zinc数据库中小分子的方法 First release:2017-01-31 Last update: 2018-01-31 Zinc数据库 不用多说,大多数化学研究的工作者都“如雷贯耳”,但是真正使用过的人却很少,本文为大家介绍下载Zinc数据库中的小分 ...
个人分类: 软件学习|10615 次阅读|没有评论
用AutoDock进行分子对接教程——柔性对接
杜文义 2018-1-31 11:29
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! Autodock 分子对接教程 First release:2017-01-31 Last update: 2018-01-31 Autodock 是一款分子对接软件包,开源且免费,官方网址是 http://autodock.scripps.edu/ ,目前最新的版本是 AutoDock 4.2.6 ,包括 Aut ...
个人分类: 软件学习|9281 次阅读|没有评论
如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript
杜文义 2017-12-16 20:57
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! 如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript First release:2017-12-16 Last update: 2018-03-17 大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图,现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享,希望对大家的科研 ...
个人分类: 软件学习|21085 次阅读|没有评论
采用Modeller进行同源建模_单模板建模
杜文义 2017-12-14 21:00
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! First release:2017-12-14 Last update: 2018-01-11 Modeller是一款比较优秀的同源建模软件,包括单模板和多模板建模,Discovery Studio软件中就是采用的Modeller建模模块。Modeller目前最新的版本是9.19,下载网 ...
个人分类: 软件学习|7275 次阅读|没有评论
计算表面静电势_APBS工具
热度 1 杜文义 2017-12-14 20:59
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正! First release:2017-12-14 Last update: 2018-03-17 APBS工具是一种可以绘制表面静电势的工具,目前在多个软件中均有APBS的插件,如VMD、PyMOL等,但是笔者都使用过这些工具,发现Chimera软件的APBS工具是最方便的,效果图 ...
个人分类: 软件学习|6602 次阅读|1 个评论 热度 1

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GMT+8, 2021-12-2 18:43

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