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他中了国自然，因为最后一周补了这张图

热度 1 2018-2-8 15:13

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 国自然倒计时1个月，想挖机制，还想加个图，体现工作量，显得基础扎实，怎么办？ 比如说基因已经做了功能研究，需要挖机制，完善故事；再比如说lncRNA KO/KD已经看出表型，可是 ...

个人分类: 转录调控|3240 次阅读|1 个评论 热度 1

Plan A详细步骤1234 | 哪个转录因子调控我的基因？

2018-2-8 11:03

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1 》一文讲了找上游转录因子的策略： Plan A：基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B：motif分析 ...

个人分类: 转录调控|7284 次阅读|没有评论

TCGA，她已经用了七年 | 资深用户深度点评

热度 1 2018-1-31 16:05

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丸子和小丫 来源: 嘉因 不知道该选哪个工具的时候，怎么办？ 最省力的办法就是 问前辈 ，包括问师兄师姐、去群里问、搜论坛。前辈用的不一定是最好的，甚至是错的，所以这个方法省力但 ...

个人分类: 表观遗传|18194 次阅读|1 个评论 热度 1

找到了motif，怎样展示结果？

2018-1-31 15:55

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 motif系列问题答疑： 去哪找motif？ 史上最全物种转录因子、motif数据库footprintDB 这段DNA上有我关心的motif吗？ 点鼠标就能找启动子区的motif | meme-FIMO mo ...

个人分类: 转录调控|10503 次阅读|没有评论

史上最全物种转录因子、motif数据库footprintDB

热度 1 2018-1-25 17:39

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 点鼠标就能找启动子区的motif》， 给出了7种 从一段DNA上找某个motif 的方法。前提是找到这个转录因子的motif文件，如果在 JASPAR里查不到，就去 footprintDB试试 ...

个人分类: 数据库|17115 次阅读|1 个评论 热度 1

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