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heatmap画不好会得出错误结论

2017-12-18 12:22

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 大家都会做方便面，有人做辛拉面，有人做三鲜伊面，工艺有何不同？ 大家都会做RNA-seq，有人能筛出有意义的基因，有人能找出有价值的线索，有人。。。差别在哪？ ...

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同一套RNA-seq，公司筛出的差异基因跟师兄筛出的为什么不一样？

2017-12-15 15:17

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 在 同一套RNA-seq，为什么公司做的跟师兄跑的结果不一样？ | TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗？ 一文，聊了怎样做RNA-seq数据预处理：把samples拉到同一起跑线。 ...

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TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗？

2017-12-15 15:04

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 在 RNA测序分析，哪家公司适合我 一文中，聊过类似的问题。 这次小哈搬来了statQuest的3个最新视频，https://statquest.org/video-index/，点击左下角“阅读原文”直达statQuest ...

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同样用Ensembl算TPM，结果还是不一样？ | Ensembl的注意事项

2017-12-15 14:53

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 大家都会做方便面，有人做辛拉面，有人做三鲜伊面，工艺有何不同？ 大家都会做RNA-seq，有人能筛出有意义的基因，有人能找出有价值的线索，有人。。。差别在哪？ 前五期 ...

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Ensembl、UCSC、Refseq，该用哪个

2017-12-15 14:42

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 大家都会做方便面，有人做辛拉面，有人做三鲜伊面，工艺有何不同？ 大家都会做RNA-seq，有人能筛出有意义的基因，有人能找出有价值的线索，有人。。。差别在哪？ ...

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欲哭无泪的p-value = 0.051 | 做几次重复能得到较低的p-value

2017-12-15 14:12

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小哈 来源： 嘉因 60分万岁，多1分浪费 p-value = 0.051。。。。。。 场景一：做RNA-seq，做几次重复？应该做几次？发paper时认可几次重复？ 场景二：RNA-seq做了3次重复，用p-v ...

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