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miRBase物种名缩写速查表 | 分享解决问题的过程,包治百病
热度 1 王程扬 2017-12-19 12:56
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 先吐槽!最近做非模式生物的项目,miRBase一点也不友好,我只能猜出人和小鼠,其他的缩写都是什么鬼?去哪找缩写跟物种名字对应的list? 打开微信,搜一搜,还 ...
个人分类: 物种速查|17353 次阅读|2 个评论 热度 1
水生生物的ATAC-seq数据和文章都在这里
王程扬 2017-12-19 12:37
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源:嘉因 这次小丫汇总了 各物种的ATAC-seq数据 ,水里的有海胆、斑马鱼、文昌鱼、青鱂鱼。做了哪些数据?发表了哪些文章? 斑马鱼 有25套ATAC-seq数据,出自10项研究。貌似ATAC-s ...
个人分类: ATAC-seq|3789 次阅读|没有评论
做过ChIP-seq或ATAC-seq的物种速查
王程扬 2017-12-19 12:28
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 上周分享了各物种ATAC-seq数据统计,有小伙伴儿问ChIP-seq都做过哪些物种,其实我也好奇。 粗略检索了一下,居然有 285个物种有ChIP-seq数据 。下次再有人问某某物种做没做 ...
个人分类: 表观遗传|3710 次阅读|没有评论
ChIP-seq和RNA-seq整合分析,BETA最擅长
王程扬 2017-12-18 15:36
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 如 何 用自己的双手,分析自己的数据? 文末有 完美 解决方案 用BETA能get到哪些生物学特征? 预测转录因子的功能是激活还是抑制; 识别转录因子的 ...
个人分类: Chip-seq、ATAC-seq实验分析|11643 次阅读|没有评论

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