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三年孕育出一个R包,用代码画蛋白结构域和突变位点

已有 5595 次阅读 2018-5-9 10:52 |个人分类:生信画图|系统分类:科普集锦

 

本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome

作者:小丫  来源: 嘉因

小丫画图群里有位小伙伴想众筹画这种图的代码:希望能显示蛋白结构域和突变位点。



这种图的用途很广泛,没有R包吗?这不科学


google搜“draw protein domain r”:


搜索结果第一条,英国Cardiff University的Paul Brennan于2015年画蛋白结构域的代码,画出的图长这样:




经历了多次升级,最新一篇刚好符合小伙伴的需求,R for Biochemists,http://rforbiochemists.blogspot.com/

而且drawProteins包被bioconductor接收,用起来更方便了。

Plotting disease causing myosin variants using drawProteins




代码都在网页上,你只需要复制粘贴,小丫亲测有效。





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