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找到了motif,怎样展示结果?

已有 10694 次阅读 2018-1-31 15:55 |个人分类:转录调控|系统分类:科研笔记| motif

 本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome

作者:小丫  来源:嘉因

motif系列问题答疑:

  1. 去哪找motif?

    史上最全物种转录因子、motif数据库footprintDB

  2. 这段DNA上有我关心的motif吗?

    点鼠标就能找启动子区的motif | meme-FIMO

  3. motif scan结果怎样看?

    互补链上的motif有意义吗?

  4. motif结果怎样展示到文章里?

    今天回答这个问题


依稀记得Y叔介绍过一个工具,能用关键字搜到research paper里的图,我当初还收藏了,可是收藏的文章太多,找不到哇!翻biobabble历史消息,用了几个词搜也没搜到。想起有一次Y叔说在公众号后台回复“目录”,就能看所有文章的目录。其中有个“神器系列”看起来像是汇总工具的,其中第二个就是:在这个看脸(哦不对,看图)的时代,做科研的你怎么能错过这个帮你找一张漂亮脸蛋的神器!


经常浏览优质公众号,平时看的帖子当时未必需要,需要的时候能想起来去哪找。嘉因的技术贴,最近我整理了一些,放在左下角阅读原文的目录里,或者加最熟悉嘉因技术贴的嘉因表观小助手,她的微信ID:epigenomics


http://www.viziometrics.org/

搜motif,没有我喜欢的


搜ChIP-seq motif


这样展示就很好


它的原理是给图加标签,用户还能帮忙校对。


2016年发表的paper,code都给你了。





https://wap.sciencenet.cn/blog-3372875-1097832.html

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