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- 错过它就像错失了一个亿！研究转录调控，比ENCODE更实用
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 今天遇到小伙伴要 找转录因子A的靶基因 ，我顺理成章的打开 史上 最全 的 ChIP-seq数据库cistromeDB ，查看里面有没有转录因子A的ChIP-seq数据。 咦？右侧出现 ...
- Y叔又炫技了！有啥用？还真能发CNS！
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 姥姥跟妈妈告娃的状：“到家就画画，画起来就没完，10点还不睡！画画有啥用？能当画家啊？” 妈妈心疼娃1秒钟。没关系，妈妈从小就是这么锻炼出来的，所以内心无比强大。 ...
- 神技能！转录调控必读
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 转录调控的经典问题： 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？ 为了帮助小伙伴儿解决这个问题，小丫写了系列技术贴： ChIP系列Plan A：点鼠标就能实现的 1234 、用代码实现的 56 ...
- 我画的图只能发Plos One？Genome Research的图长啥样？
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 小哈组会因heatmap受挫，老板说：“有些图一看就只能发PLOS ONE，多学学Genome Research的配色。” 那就看看Genome Research的配色方案。检索策略：在Genome Research网站https:/ ...
- 等我有钱了，我也这样研究一个基因
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丸子和小丫 来源： 嘉因 大家好，我是让每一位实验猫都能享用生信福利的嘉因小丫，以及她的朋友们。 读paper时，我们总要问：有什么思路和方法，能用到我的课题里？ 好多 ...
- 哪个转录因子调控你的基因？Plan C，不需要那么多ChIP-seq
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- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？ 》一文讲了找上游转录因子的三种策略： Plan A： 基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B： motif分析预测 Plan C：DNase ...
- 国自然爱明星，拉你的基因进明星通路，一图搞定
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 明星人人爱，我家小汪也想跟明星攀亲戚。 这里有个 神图 看到明星通路中的小紫结合在小汪转录起始位点附近，推测小汪被小紫调控，从而参 ...
- 他中了国自然，因为最后一周补了这张图
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- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 国自然倒计时1个月，想挖机制，还想加个图，体现工作量，显得基础扎实，怎么办？ 比如说基因已经做了功能研究，需要挖机制，完善故事；再比如说lncRNA KO/KD已经看出表型，可是 ...
- Plan A详细步骤1234 | 哪个转录因子调控我的基因？
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1 》一文讲了找上游转录因子的策略： Plan A：基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B：motif分析 ...
- 找到了motif，怎样展示结果？
- 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 motif系列问题答疑： 去哪找motif？ 史上最全物种转录因子、motif数据库footprintDB 这段DNA上有我关心的motif吗？ 点鼠标就能找启动子区的motif | meme-FIMO mo ...
