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缺血性脑卒中关键基因的筛选及治疗药物的预测
王玥1,2,周玥1,2,赵丽3
1. 首都医科大学附属北京安定医院,国家精神心理疾病临床医学研究中心,精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室,北京100088
2. 首都医科大学人脑保护高精尖创新中心,北京100069
3. 首都医科大学基础医学院神经生物学系,北京100069
摘要 运用生物信息学方法初步筛选缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和关键基因(hub genes),进而预测潜在的IS治疗药物。对正常组和双侧颈内动脉闭塞(bilateral internal carotid artery occlusion,BICAO)组的大鼠皮层进行转录组测序(RNA-sequencing,RNA-Seq),对筛选得到的DEGs进行GO和KEGG富集分析,并构建DEGs的蛋白互作网络,获得关键基因,根据关键基因预测IS相关药物。本研究共得到197个显著DEGs,这些基因主要参与代谢、神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联反应、类固醇激素生物合成等途径。DEGs间有着紧密的相互关系,相互关系最为密切的基因中,ORM1、SERPINA1、GC 都参加炎症、氧化应激和凋亡过程,是IS发病过程的关键基因。因此,炎症、氧化应激和凋亡在IS的发生发展中起重要作用,针对IS的关键基因如ORM1、SERPINA1、GC 进行药物治疗有潜在的临床意义。
关键词 缺血性脑卒中;转录组测序;生物信息学;差异表达基因;药物预测
(责任编辑 徐丽娇)
http://www.kjdb.org/CN/Y2023/V41/I9/89
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