STAMP：扩增子、宏基因组统计分析神器(中文帮助文档)

刘永鑫 2018-5-25 23:19

之前本平台分享过STAMP的使用： 微生物组间差异分析神器-STAMP 今天带来了更详细、深入的讲解和高级玩法。 简介 软件简介 STAMP是一款用于分析微生物分类和功能谱的软件，不仅可以做统计，更能绘制多种图形，方便发表使用。 1.0于2010年发表于Bioinformatics，被引493次；2.0于2014年1月发表于Bioinf ...

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宏基因组教程Metagenomics Tutorial (HUMAnN2)

刘永鑫 2018-5-22 23:02

之前我们介绍了 microbiome_helper 提供众多宏基因组学相关的实验、分析教程。 微生物组助手——最易学的扩增子、宏基因组分析流程 今天我们先详细讲解基于HUMAnN2的有参宏基因组分析流程 Metagenomics Tutorial (HUMAnN2) https://github.com/LangilleLab/microbiome_helper/wiki/Metagenomics-Tutorial-(H ...

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HUMAnN2：人类微生物组统一代谢网络分析2

刘永鑫 2018-5-17 12:59

关于宏基因组常用的有参分析流程，主要是快速获得物种组成和功能组成，之前分享了 MetaPhlAn2一条命令获得宏基因组物种组成 今天再介绍来自同一作者的另一个软件，可以一步完成功能和代谢组成。 HUMAnN2: The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2，它在宏基因组研究中非常有用，通过这个分析，不仅能获得微 ...

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微生物组——宏基因组分析专题培训开课啦！！！

刘永鑫 2018-4-23 23:22

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在 2018年7月北京鼓楼 推出《 宏基因组分析专题培训 》，大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天三段式教学，真正实现独立分析大 ...

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