ISME：Micrarchaeota和Parvarchaeota古菌门的代谢多样性

刘永鑫 2019-10-15 09:31

Micrarchaeota和Parvarchaeota古菌门的代谢多样性 撰文：August 中南大学 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 The ISME Journal Chen LX, Méndez-García C, Dombrowski N, et al. Metabolic versatility of small archaea Micrarchaeota and Parvarchaeota. ISME J. 2018;12(3):756–775. doi:10.1038/s41396 ...

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Nature子刊：Salmon不比对快速宏基因组基因定量

刘永鑫 2019-10-12 09:42

Salmon：使用双阶段推理对转录本表达进行快速且有偏差意识的量化 Salmon: fast and bias-aware quantification of transcript expression using dual-phase inference Nature Methods 2017-03-06 Brief Communication （短通讯） DOI: https://doi.org/10.1038/nmeth.4197 第一作者：R ...

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嗜酸古菌的代谢和进化模式——单菌基因组和功能研究

刘永鑫 2019-10-8 16:59

极端嗜酸古菌嗜酸性铁质体的代谢和进化模式 Metabolic and evolutionary patterns in the extremely acidophilic archaeon Ferroplasma acidiphilum Y T 撰文：August 中南大学 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 Scientific Reports Published online 2017 Jun 16. doi: https://doi.org/10.1038/s41598-01 ...

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ISME：污水厂抗性组受细菌组成和基因交换驱动且出水中抗性表达活跃(一作解读)

刘永鑫 2019-10-7 11:11

污水厂抗性组受细菌组成和基因交换驱动且出水中抗性表达活跃 原英文标题：Wastewater treatment plant resistomes are shaped by bacterial composition, genetic exchange, and upregulated expression in the effluent microbiomes The ISME Journal, volume 13, pages346-360 (2019) DOI: https://doi.org/10.10 ...

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NC：你觉得你吃的是草，其实你还是吃的土(遗传发育所朱峰)

刘永鑫 2019-9-24 09:06

食叶昆虫微生物群落来源于土壤而不是取食植物 Foliar-feeding insects acquire microbiomes from the soil rather than the host plant Nature Communications， doi.org/10.1038/s41467-019-09284-w Published online 19 March 2019 第一作者：S. Emilia Hannula 1 ，Feng Zhu(朱峰) 1，2 ， Robin Heinen ...

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NC：多样性激发的确定性细菌装配过程限制了群落功能

刘永鑫 2019-9-19 19:16

多样性激发的确定性细菌装配过程限制了群落功能 翻译：马腾飞 南京农业大学 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 导读 由于土壤微生物的复杂性和难培养性，长期以来人类对土壤微生物的多样性及其生态功能认识不深，只能用“黑箱”来概括。土壤微生物活动是实现土壤物质循环和养分转化的功能基础，不同的微生物具有不同 ...

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Nature综述：鸟枪法宏基因组-从取样到数据分析——2万字带你系统入门宏基因组实验和分析

刘永鑫 2019-9-17 18:38

NBT：鸟枪法宏基因组-从取样到数据分析 Shotgun metagenomics, from sampling to analysis Nature Biotechnology 2017-09-12 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/nbt.3935 第一作者：Christopher Quince 1,7 ，Alan W Walker 1,7 通讯作者：Nicola Segata 6 其它作者：Jared T Simpson, ...

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Genome Biology：人体各部位微生物组时间序列分析

刘永鑫 2019-9-1 14:53

人体各部位微生物组初探 Moving pictures of the human microbiome Genome Biology, 2011-05-30 Articles DOI: https://doi.org/10.1186/gb-2011-12-5-r50 第一作者J Gregory Caporaso 1 通讯作者：Rob Knight 1,8* 其它作者： Christian L Lauber, Elizabeth K Costello, Donna Berg-Lyons, ...

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NBT：设计稳定无毒的抗菌肽杀灭耐药菌

刘永鑫 2019-9-1 14:47

设计稳定无毒并在小鼠中杀死抗生素抗性细菌的广谱抗菌肽 Design of stapled antimicrobial peptides that are stable, nontoxic and kill antibiotic-resistant bacteria in mice Nature Biotechnology 2019-08-19 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0222-z 第一作者：Rida M ...

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