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NBT:Rob Knight团队发表微生物组数据降维新方法
2020-9-2 21:58
上下文感知的降维解卷积肠道微生物群落动态 Context-aware dimensionality reduction deconvolutes gut microbial community dynamics Nature Biotechnology https://doi.org/10.1038/s41587-020-0660-7 发表日期:2018-05-23 中文版更新时间:2018-03-30 第一作者:Cameron Martino, 1,2,3 , Lia ...
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Nature子刊:机器学习方法扩展了anti-CRISPR蛋白家族的所有成员
2020-8-20 22:29
机器学习方法扩展了anti-CRISPR蛋白家族的成员 Machine-learning approach expands the repertoire of anti-CRISPR protein families 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41467-020-17652-0 Nature Communicaton 发表时间: 2020-07-29 第一作者:Ayal B. Gussow 1 通讯作者:Eugene V. Koonin 1 ( ...
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Nature:Rob Knight团队发现血液和组织微生物组可诊断癌症
2020-8-14 19:35
Nature:血液和组织中的微生物组分析可作为癌症的诊断方法 Nature 全文链接 : https://doi.org/10.1038/s41586-020-2095-1 发表日期 :2020-03-11 第一作者 :Gregory D. Poore 1 Evguenia Kopylova 2 通讯作者 :Rob Knight(robknight@ucsd.edu) 1,2,3,4 主要单位 : 1 美国加州大学圣地 ...
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ISME:二型糖尿病患者中与牙周炎相关的龈下菌群
2020-8-4 20:51
二型糖尿病患者中牙周炎相关的龈下菌群 The ISME Journal DOI: https://doi.org/10.1038/s41396-019-0544-3 发表日期:2020-02-01 第一作者:Baochen Shi 1 通讯作者:Huiying Li 1,3 其他作者:Renate Lux 2 , Perry Klokkevold 2 , Michaela Chang 2 , Emma Barnard 1 , Susan Haake 2 主要单位: ...
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Nature:依靠锰的氧化实现细菌的化能自养生长
2020-7-28 15:36
依靠锰的氧化实现细菌的化能自养生长 Bacterial chemolithoautotrophy via manganese oxidation Nature DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2468-5 发表日期:2020-07-15 第一作者:Hang Yu 1 通讯作者:Jared R. Leadbetter (jleadbetter@caltech.edu) 1,2 主要单位: 1 美国加利福尼亚理 ...
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IBD:5-氨基水杨酸治疗后溃疡性结肠炎患者真菌菌群的变化
2020-7-4 23:36
5-氨基水杨酸(5-ASA)治疗后UC患者真菌菌群的变化 Alteration of Fungal Microbiota After 5-ASA Treatment in UC Patients Inflammatory bowel disease 【 Impact Factor 4.261 】 DOI: https://doi.org/10.1093/ibd/izz207 发表日期:2020-03 第一作者:Xu Jun(徐俊) 1,2,3 通讯作者:Liu Yulan(刘玉兰 ...
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Microbiome:微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式
2020-7-4 21:11
微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式 Microbial succession during the transition from active to inactive stages of deep-sea hydrothermal vent sulfide chimneys Microbiome DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00851-8 发表日期:2020-06-30 第一作者:Ji ...
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BBI:在微生物组研究中使用宏转录组
2020-6-27 19:53
在微生物组研究中使用宏转录组 Use of Metatranscriptomics in Microbiome Research https://doi.org/10.4137/BBI.S34610 Bioinformatics and Biology Insights 2016-04-20 Review Article DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaa254 第一作者:Stavros Bashiardes 通讯作者: Eran Elinav(er ...
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NBT:PICRUSt2预测宏基因组功能
2020-6-27 11:24
PICRUSt2预测宏基因组功能 PICRUSt2 for prediction of metagenome functions Nature Biotechnology 2020-06-01 Correspondence DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-020-0548-6 第一作者:Gavin M. Douglas 1 通讯作者:Morgan G. I. Langille 1,7 (morgan.langille@dal.ca) 其他作者:Vince ...
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EI:南土所褚海燕组发现农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能
2020-6-26 00:07
农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能 Abundance of kinless hubs within soil microbial networks are associated with high functional potential in agricultural ecosystems Environment International Impact Factor 7.943 DOI: https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.105869 发表日期:202 ...
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