博文
- GB：香港城市大学孙燕妮组发表高准确度病毒株识别工具VirStrain
- VirStrain：RNA病毒的菌株识别工具 VirStrain: a strain identification tool for RNA viruses Genome Biology DOI： https://doi.org/10.1186/s13059-022-02609-x 发表日期：2022-01-31 第一作者: Herui LIAO(廖和睿) 1 通讯作者：Yanni SUN(孙燕妮)(yannisun@cityu.edu.hk) 1 合作作者: Dehan Cai ...
- Nature子刊：宏基因组组装基因组实现谱系解析
- 宏基因组组装基因组实现谱系解析 MAGs achieve lineage resolution Nature Microbiology DOI： https://doi.org/10.1038/s41564-021-01027-2 发表日期：2022-01-03 第一作者：Taylor E. Reiter 1 通讯作者：C. Titus Brown (ctbrown@ucdavis.edu) 1 主要单位： 1 美国加州大学戴维斯分校(Department ...
- ISME：林科院袁志林等-冷杉优势真菌共生发育的基因家族趋同演化及平衡选择机制
- ISME：林科院袁志林等-冷杉优势真菌共生发育的基因家族趋同演化及平衡选择机制 百山祖冷杉相关真菌的基因组概况揭示了对内生菌的快速收敛适应 Genomic landscape of a relict fir-associated fungus reveals rapid convergent adaptation towards endophytism The ISME Journal DOI： https://doi.org/10.10 ...
- 微生物组数据揭示中国稻谷产毒真菌分布及仓储动态变化
- 中国水稻主产区产毒真菌的分布 Distribution of mycotoxin-producing fungi across major rice production areas of China Food Control DOI： https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2021.108572 发表日期：2021-11-12 中国两大仓库稻谷中微生物群落的时空变化 Temporal and spatial variation of micr ...
- mSystems：“地球第四极”马里亚纳海沟极端环境中神秘的底栖病毒群落及其生态功能
- 新型病毒群落可能有助于马里亚纳海沟上坡沉积物中的碳、氮和硫代谢 Novel Viral Communities Potentially Assisting in Carbon, Nitrogen, and Sulfur Metabolism in the Upper Slope Sediments of Mariana Trench mSystems DOI： https://doi.org/10.1128/msystems.01358-21 发表日期：2022-01-04 第一作 ...
- Science：无氧世界的古菌氨氧化
- 无氧世界的古菌氨氧化(古菌通过自身产氧维持其在无氧环境中好氧氨氧化) Archaeal nitrification without oxygen(The single-cell organism can self-produce oxygen for ammonia oxidation) Science DOI： https://DOI.org/10.1126/science.abn0373 发表日期：2022-01-06 第一作者：Willm Martens-Habbena ...
- Bioinformatics：吉林大学刘富组-深度学习从宏基因组序列中识别短病毒序列Virtifier
- Virtifier: 基于深度学习方法的宏基因组病毒序列分类方法 Virtifier: a deep learning-based identifier for viral sequences from metagenomes Bioinformatics DOI： https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab845 发表日期：2021-12-15 第一作者：Yan Miao(苗岩) (miaoyan17@mails.jlu.edu.cn) 1 ...
- Cell子刊：源自微生物群的醋酸盐能够在健康和疾病期间促进大脑先天免疫系统的代谢适应性
- 源自微生物群的醋酸盐能够在健康和疾病期间促进大脑先天免疫系统的代谢适应性 Microbiota-derived acetate enables the metabolic fitness of the brain innate immune system during health and disease Cell Metabolism DOI： https://doi.org/10.1016/j.cmet.2021.10.010 发表日期：2021-11-02 第一作 ...
- CB：中国农大胡永飞组构建整合的鸡肠道微生物组的参考基因和基因组集
- 鸡肠道微生物组的宏基因组组装基因组和基因集助力破译耐药基因组 Metagenome-assembled genomes and gene catalog from the chicken gut microbiome aid in deciphering antibiotic resistomes Communications Biology DOI： http://doi.org/10.1038/s42003-021-02827-2 发表日期：2021-11-18 第一作者：Y ...
- Nature子刊：微生物系统中的功能与功能冗余
- 翻译：周之超@UW-Madison 编辑注：该文章发表于2018年的Perspective，目前被引405次。其作者Stilianos Louca大家并不陌生，正是常用微生物物种功能注释软件FAPROTAX的作者，详见 《元素循环FAPROTAX》 。 微生物系统中的功能与功能冗余 Function and functional redundancy in microbial systems Nature Ecolog ...
