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iMeta——国人的微生物组、生物信息国际顶刊
- Publons：文章审稿、编辑工作认证平台
- 如何投稿iMeta期刊？ScholarOne投审稿系统作者使用教程
- 高影响力期刊iMeta扬帆起航(微生物组&生物信息)
- iMeta期刊投审稿系统ScholarOne正式上线
- iMeta期刊12名编委入选科睿唯安2021年度高被引学者
- iMeta宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介
- iMeta期刊顾问James M Tiedje当选中国科学院外籍院士
- 报告视频录制：腾讯会议录屏+人像画中画特效
- 中国大陆SCIE收录期刊分析：多少本刊？发文多少？解决了多大内卷？未来在哪里
- 微生物领域SCIE期刊分析(英美各40本，中国大陆0本)
《微生物组数据分析》专著
- 众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人(目录)
- 编者序：初衷、计划、要求、优势、目标和展望
- 111.Protein Cell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南
- 112.CMJ：人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南
- 121.个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)
- 122.Linux系统和Shell命令行简介，走上数据分析之路
- 123.R简介和统计绘图
- 211.Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)
- 212.样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线
- 213.维恩图和集合图(Venn&Upset)
- 221.Beta多样性PCoA和NMDS排序
- 222.Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA
- 223.主成分分析PCA
- 231.菌群物种组成堆叠柱状图、弦图、词云
- 245.热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵
- 246.三元图的应用与绘图实战
- 251.全网最简单的网络图画法，小白福音包学包会
- 252.体现组间差异OTU模块的微生物网络图
- 341.基于高通量测序的微生物组研究技术简介
- 342.基于高通量技术的微生物组研究实验设计
- 343.微生物组研究写作的一般思路
- 西湖大学鞠峰组：环境宏病毒组学分析思路与常用工具
- 西湖大学鞠峰组：环境微生物的宏基因组学实例与新发现
- ggClusterNet—-一条代码完成全内容微生物网络
- Windows10安装Linux子系统Ubuntu 20.04LTS，轻松使用生信软件，效率秒杀虚拟机
- 宏基因组领域杂志简介及最新影响因子
《微生物组实验手册(MPB)》专著
- 125家单位联合完成微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)第1版
- 352位华人学者联合发布《微生物组实验手册》
- MPB：北林张静等-丛枝菌根真菌(AMF)孢子、菌丝密度及侵染率定量测定方法
- MPB：地大郭东毅等-一种针对重金属污染土壤的高效DNA提取方法
- MPB：西农焦硕组-土壤微生物响应环境变化的系统发育保守性和环境阈值
- MPB：农科院牧医所赵圣国组-基于GraftM对功能基因进行物种注释
- MPB：农科院牧医所赵圣国组-微生物超高分子量DNA提取方法
- MPB：山大倪金凤组-培菌白蚁肠道簇虫分离与分子鉴定的方法
- MPB：沈阳生态所李琪组-土壤线虫群落DNA提取、扩增及高通量测序
- MPB：中大李文均组-河口水体和沉积物中微生物的分离培养与鉴定
- MPB：上海巴斯德所崔杰组-RNA病毒组与生物信息学分析
- MPB：中科院城环所杨军组-淡水浮游动物的采集及鉴定
- MPB：甘肃省科学院祝英等-药用植物地下茎内生真菌的分离纯化及鉴定
- MPB：农科院牧医所赵圣国组-微生物DNA、RNA和蛋白质共提取方法
- MPB：林科院袁志林组-利用acdSf3/acdSr4引物快速鉴定产ACC脱氨酶细菌
- MPB：遗传发育所白洋组-高通量分离培养和鉴定植物根系细菌
- MPB：清华杨云锋组-利用GeoChip分析环境微生物功能基因群落结构
- MPB：西农焦硕组-微生物生物地理学研究方法
- MPB：湖南农大尹杰组-猪粪便来源乳酸菌分离技术
- MPB：川农罗玉衡组-猪肠道食糜和血清中短链脂肪酸浓度的测定
- MPB：青岛大学苏晓泉组-使用Meta-Apo对16S扩增子的微生物组功能信息进行校正
- MPB：南土所褚海燕组-利用种分布模型绘制微生物分布图谱
- MPB：林科院袁志林组-一种简易的植物组织表面消毒装置
- MPB：林科院袁志林组-内生镰刀菌基因组染色体级别组装和注释
- MPB：林科院袁志林组-毛白杨根系内生真菌互作体系构建方法
- MPB：青岛大学苏晓泉组-全球微生物组整体结构和功能的搜索
- MPB：中大李文均组-热泉高温细菌分离培养方法
- MPB：水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA基因扩增子文库制备方法
- MPB：中科院城环所杨军组-淡水浮游细菌群落采集、过滤与保存
- MPB：利用无菌植物和可培养细菌体系研究根系微生物组功能
- MPB：南京湖泊所王建军组-群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
- MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫的分离培养与形态学分析
- MPB：使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据(视频)
- MPB：林科院袁志林组-树木共生真菌菌株纯化及快速鉴定方法
- MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌对酸和胆碱盐的耐受能力
- MPB：中科院城环所杨军组-基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法
- MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌益生菌表面粘附能力的检测
- MPB：华大孙海汐等-从细菌基因组中预测活性前噬菌体工具Prophage Hunter的使用流程和常见问题
- MPB：生态环境中心陈保冬组-基于高通量测序技术的丛枝菌根真菌多样性研究方法
- MPB：农科院田健、韩东飞等-水稻根系互作功能微生物的筛选方法
- MPB：南农成艳芬组-瘤胃厌氧真菌代谢产物的检测方法
- MPB：扬大林淼组-瘤胃混合细菌连续传代培养技术
- MPB：扬大林淼组-瘤胃内容物样本中有机酸的定量分析 (高效液相色谱)
- MPB：陈同等-ImageGP在微生物组可视化中的应用 视频
- MPB：林科院袁志林组-原生质体法制备根系腐生型共生菌(伞菌目)单核化菌丝
- MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫与细菌微循环测定方法
- MPB：遗传发育所刘永鑫等-易扩增子：易用、可重复和跨平台的扩增子分析流程
- MPB：亚热带生态所葛体达组-原位酶谱法高分辨率实时检测土壤微界面酶活分布
- MPB：亚热带生态所谭支良组-基于微生物成分数据的差异zOTU分析流程
- MPB：生态环境中心张丽梅组-植物微生物组DNA提取扩增及溯源分析(视频)
- MPB：微生物所东秀珠组-基于16S rRNA基因和基因组序列对细菌物种的初步鉴定
- MPB：白酒酒醅非破坏性连续采集与核酸提取
- MPB：中大魏泓组-无菌小鼠肠道粪菌移植(视频)
- MPB：北林袁峥嵘组-16S扩增子分析中常用软件及数据库应用现状
- MPB：南土所褚海燕组-小麦相关微生物的野外采样与样品保存
- MPB：南土所褚海燕组-小麦相关微生物的野外采样与样品保存
- MPB：上海交大肖湘组-海洋微生物的厌氧高压培养实验
- MPB：上海交大王风平组-海洋沉积物样品细胞提取及荧光显微镜计数法
- MPB：南京湖泊所王建军组-湖泊沉积物的野外采集方法
- MPB：南京湖泊所王建军组-溪流底栖附着生物膜的野外采集方法
- MPB：中科院生态环境中心邓晔组-从环境样本中提取高质量DNA-研磨加DNeasy试剂盒方法
- MPB：林科院袁志林组-巢式PCR检测植物组织痕量内生真菌的方法及其引物
- MPB：中农冯固组-研究菌丝际微生物互作的胡萝卜根器官-丛枝菌根真菌双重培养体系
- MPB：西农郑伟-土壤水稳性团聚体微生物组样品制备方法
- MPB：山大倪金凤组-白蚁肠道微生物样品收集与制备
- MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌的耐热实验
- MPB：中科院城环所杨军组-水体浮游植物采集与鉴定
- MPB：中科院城环所杨军组-基于DNA宏条形码的水体微型真核生物群落18S测序建库方法
- MPB：中农戴兆来组-猪肠道微生物样品的采集与核酸提取
- MPB：南农成艳芬组-瘤胃体外发酵过程中产气量与甲烷产量的检测
- MPB：南农金巍等-瘤胃甲烷菌的分离培养与保存
- MPB：南农韦中组-根际细菌产铁载体能力的高通量检测
- MPB：中农戴兆来组-猪肠道微生物的体外培养与功能研究
- MPB：中科院植物所杨文强组-莱茵衣藻遗传连锁分析方法
- MPB：中南大学刘学端、马丽媛组-基于16S测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析
- MPB：山大倪金凤组-黄翅大白蚁后肠几丁质降解微生物的分离与培养
- MPB：中科院南土所褚海燕组-结构方程模型在土壤微生态中的应用
- MPB：南农成艳芬组-瘤胃厌氧真菌的分离培养与保存
- MPB：南农成艳芬组-瘤胃微生物体外发酵过程与注意事项
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- MPB：西湖大学鞠峰组微生物群落胞内胞外吸附胞外游离水环境DNA的分离提取
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- MPB：东林牛犇组玉米根系简化细菌群落的定量与其生物防治效果的评价方法(视频)
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- MPB：原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
- MPB：青岛大学苏晓泉组分享基于分类学和系统发育的宏基因组比较DMS算法
- MPB：中科院王光华组土壤和水体环境T4型细菌病毒g23基因多样性研究
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- MPB：河湖着生硅藻样品采集、永久玻片制作及鉴定
- MPB：上海交大肖湘组分享基于基因芯片的海洋微生物转录组学分析技术
- MPB：随机宏基因组测序数据质量控制和去宿主的分析流程和常见问题
- 微生物组实验手册：中科院、北大和清华等52家单位的74个团队的153篇方法正在创作中
- 微生物组实验手册计划正式启动、诚邀同行共同打造本领域方法百科全书
- 实验室管理好助手——Bio-lab
学术报告录播、PPT分享
- 75分钟入门微生物组数据分析和结果解读—刘永鑫(合肥，2021年6月23日)
- 青年生命科学论坛报告：扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程—刘永鑫(北京210606)
- 宏基因组数据分析的机遇与挑战—刘永鑫(北京，2020年12月8日)
- 刘永鑫：20分钟讲解微生物组数据分析与可视化实战
- 南京袁军/文涛ISME：基于大数据整合准确预测土壤的枯萎病发生
- 北生院王金峰Gut：时序微生物组数据重现生物膜装配的动态过程 PPT+视频
- 西湖大学鞠峰：环境微生物宏基因组学(报告视频+PPT,11月23日)
- 2020年12月8日中科院刘永鑫报告：宏基因组数据分析的机遇与挑战
- 扩增子和宏基因组数据分析流程和可视化方案—刘永鑫(南京，2020年10月27日)
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会议、专刊、招聘
培训会议
- Nature会议：驾驭植物微生物组(21年10月22-24，在线，优惠截止9月24日)
- 6月4-6日，第三届青年生命科学论坛
- 6月20-23日，合肥，土壤生物多样性与生物化学过程研讨会
- 7月23-25日，微生物组-扩增子16S分析第12期
- 7月30-8月1日，高级转录组分析和R语言数据可视化第12期
- 8月20-22日，微生物组-宏基因组分析
- 上传数据，直接分析，这才是真正的生物云
专刊征稿
- mSystems和Microbiology Spectrum杂志“肠道微生态专题”论文征稿
- Medicine in Microecology：医学微生态中的大数据专刊征稿(宁康、苏晓泉)
- Medicine in Microecology：母婴微生物组专刊征稿(陈廷涛、王金锋)
- JOVE征稿：植物微生物组学方法专刊(牛犇、韦中、高峥、王蒙岑)
- SEL专题征稿：Microplastics in agroecosystems
- JoVE微生物组专刊征稿，写方法拍视频教程发SCI
- 《微生物学报》“微生物大数据资源”专刊邀稿函
- 生物工程学报-微生物组测序与分析专刊
- 生物工程学报-“微生物与生命健康”专刊征稿通知
人才招聘
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- 芬兰阿尔托大学人工智能实验室程路组博士生招聘-肠道菌群进化与人类疾病等方向
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- 南方科技大学宋毅课题组招聘启事
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- 南科大海洋系侯圣伟组博后招聘(视频)
- 中农王金锋组诚聘微生物组学方向博士后
- The Innovation: 青年编委招募
- 中科院城环所朱永官组博后招聘
- 纽约伊坎医学院房刚组诚聘博士后: 表观基因组, 宏基因组, 精准医疗
- 华岩资本—微生物领域项目投递通道
- 北京大学吴华君课题组多组学数据分析方向博士后和技术员招聘启示
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分箱/MAG专题
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统计分析及可视化
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细菌基因组
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研究热点
绝对定量
参考基因(组)集
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培养组
历史经典
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- PNAS2016：土壤氮循环微生物功能特征的全球生物地理学
- NBT2014：人类微生物组千万基因的参考基因集
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病毒组
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- PhiSpy：在细菌基因组中识别噬菌体
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- 病毒组研究的挑战-相关的新兴技术
- SCLS：巴斯德所崔杰组揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样
三代测序专题
- AS：中科院微生物所王军课题组建立靶向RNA的病原检测新方法mtNGS和mtTGS
- Nature 子刊：三代测序的DNA提取和宏基因组学分析
- NanoPlot：三代纳米孔测序数据质量评估
- NBT：宏基因组二、三代混合组装软件OPERA-MS文章解读 软件使用
- Nature方法 | 三代长读长宏基因组组装软件metaFlye
- Nature子刊：三代Nonopore测序数据耐药性分析软件NanoOK RT
- Nature子刊：使用MinION快速分析早产儿肠道菌群谱并鉴定抗生素抗性致病菌
- Nature子刊：三代Nanopore测序检测细菌和菌群多种DNA甲基化类型的新方法
- NBT封面：纳米孔宏基因组6小时识别下呼吸道病原体
- 纳米孔测序揭示冻土冻融对土壤微生物群落变化的影响
- 2019新型冠状病毒Nanopore测序标准操作流程
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新冠病毒专题
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- Nature：人体菌群研究的25个里程碑
- Nature：首个肠道微生物对药物代谢影响的系统性研究
- Nature：TEDDY计划中幼儿肠道微生物组随时间的发育
- Nature: 来自细菌的通告——群体感知效应
- Nature：皮肤微生物群-宿主相互作用
- Nature：真菌由肠道入侵胰腺定植富集Malassezia菌
- Nature：肠道菌如何影响大脑，帮助消除恐惧相关的行为
- Nature：微生物的胆汁酸代谢物调节宿主肠道特异Treg细胞的稳态
- Nature专题：肠道菌群研究的现在和未来
- Nature：在人类肠道营菌群中发现获得性细菌防御基因
- Nature：依靠锰的氧化实现细菌的化能自养生长
- Nature综述：肠道菌群与结直肠癌的研究进展
- Nature分享：如何写好高被引综述论文？
Scinece
- Science：纽约西奈山医学院房刚组定量分析真核生物DNA 6mA解析细菌污染的影响
- Science：无氧世界的古菌氨氧化
- Science：豆科植物如何建造“固氮工厂”？Murray组在根瘤共生机制取得重要进展
- Science：中科院微生物所向华/李明组揭示护卫CRISPR-Cas的全新毒素-抗毒素RNA系统
- Science：拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组* 专家点评
- Sciences：用膳食纤维”钓”出15株缓解糖尿病的细菌！*
- Science综述：利用根际微生物组提高作物抗旱和产量
- Science：肠道菌群又添一大功能，揭示你的真实年龄
- Science：亚硝酸盐氧化细菌在黑暗海洋中的主要作用
- Science：又一明星菌群可以调控肠道免疫？
- Science：固氮（The nitrogen fix）
- Science：比较基因组揭示银边鱼应对捕鱼行为的表型进化机制
- Science评论|只需加一种菌，番茄不仅抗盐胁迫还提高65%产量！
- Science：微生物组“淘金热”，从人体中发现新型抗菌剂
- Science：病原菌激活植物内生菌群的抑病功能
- Science：综述肠道菌群如何影响社交行为
- Science: 微生物组是宿主新兴表型的来源
- Science：充满铵盐的环境依然发生固氮
- Science：基于微生物条形码系统的高分辨率物源追踪技术
- Science：英国Castrillo组揭示微生物群与根内皮的协调支持植物营养平衡！
- Science综述：人类与微生物共进退
- Science：植物和微生物的新途径：与共生微生物和病原微生物的相互作用驱动植物进化！
- Science：大数据揭示野生动物肠道菌群的多样性与功能景观
Cell
- Cell：康奈尔大学郭春君组开发针对非模式肠道细菌的基因编辑工具
- Cell：人体肠道菌群的长期遗传稳定性和个体特异性
- Cell：蜱虫基因组和宏基因组数据
- Cell：一种用基因流定义微生物种群的反向生态学方法 PopCOGenT简介
- Cell：浙大张兴/朱永群组揭示细菌鞭毛马达结构、组装与扭矩传输机制
- Cell：中科院遗传发育所周俭民受邀综述植物免疫激活及信号传导的最新进展
- Cell：土传遗产
- Cell：植物根系如何允许有益微生物定植的
- Cell综述：人类肠道菌群-从关联到调控
- Cell ：根部微生物跨界的互作促进拟南芥生存
- Cell：小基因开启微生物组研究新领域——大规模鉴定微生物基因组编码的小蛋白质
- Cell：绝对异养型生物改造成完全自养型生物
- Cell二连发 | 广东CDC/耶鲁大学利用纳米孔测序揭示中/美新冠病毒基因组流行病学传播规律
Nature综述
- Nature综述：从土壤到临床-微生物次级代谢产物对抗生素耐受性和耐药性的影响
- NRM：肠道微生物在人类代谢健康与疾病中的作用
- 束文圣和黄立南Nature综述极端环境中的微生物多样性
- NRM：人类微生物培养及培养组学
- NRM: 蓝藻水华的形成机理及防治动态
- NRM: 拥抱未知-解析土壤微生物组的复杂性
- NRM: 追“根”溯源：植物根际的微生物生态
- NRM 关键物种对于微生物菌群结构和功能的驱动作用
- NRM：多年冻土的微生物组
- NRM：种内多样性：解释微生物组中的菌株
- Nature综述: 给医生的菌群分析指南上 下
- NRM：微生物的社交网络 - 营养缺陷型如何塑造复杂群落
- NRM：提高作物产量？农作物微生物组是关键
- NRM：未培养微生物的新兴培养技术
- NRM：微生物的衰老与寿命
- NRM：预测生物学：微生物复杂性的解析、模拟与应用
- Nature综述: 微生物与气候变化
- Nature综述：噬菌体的百年研究
- NRGH：优先效应在生命早期肠道微生物组形成中的作用
- NRG：临床宏基因组学的应用与挑战
- NRM：微生物沿着寄生-共生连续体进化和转变！
- NRM：宏基因组测序研究耐药基因的方法和资源
- NRM：菌根共生的独特性和共性
- NRM：如何获得理想的微生物组
- NRM：工程微生物组的通用原则和最佳实践
- NRG：关于RNA-seq，你想知道的都在这
- NRG：宏基因组测序研究耐药基因的方法和资源
- NRM：植物与微生物组的相互作用：从群落装配到植物健康上 下
Nature子刊
- Nature子刊：宏基因组组装基因组实现谱系解析
- Nature子刊：来自人类肠道菌群的189,680种DNA病毒基因组集
- NBT封面：水稻NRT1.1B基因调控根系微生物组参与氮利用*
- NBT：南农沈其荣、韦中团队：番茄细菌性青枯病的噬菌体联合疗法(附视频)*
- NBT：王运浩、区健辉等综述纳米孔测序技术
- Nature子刊 | 翟冰等造血干细胞移植中的肠道真菌菌群动态变化与临床结果分析(招聘博后、助研)
- NBT封面：纳米孔基因组测序快速临床诊断细菌性下呼吸道感染
- NBT：MaPS-seq测序方法揭示肠道微生物空间分布
- NBT：线虫的工程细菌共生体提高对西方玉米根虫的生防潜力
- NBT：利用血液代谢组预测肠道微生物组的多样性
- NBT：Rob Knight团队发表微生物组数据降维新方法
- NBT：利用细胞甘油三酯存储提高链霉菌中聚酮类化合物的效价
- NBT：改进宏基因组的分箱和组装的新方法
- Nature Methods
- Nature Geoscience：到底谁才是限制非共生固氮的幕后主使*
- Nature Medicine：iHMP之“微生物组与早产”
- Nature Medicine：婴儿生命早期肠道病毒组和细菌组的动态
- NEE：不想当化学家的物理学家不是好的生物学家
- NEE综述：微生物系统的功能与功能冗余
- Nature Microbiology：加州大学Banfield组揭示CPR细菌和DPANN古菌多样性及与低温TEM下宿主互作关系
- Nature Microbiology：房刚组揭示细菌表观遗传调节艰难梭菌孢子形成*
- Nature Microbiology：视频解读！铁载体：作物根际稀缺资源保卫战的“秘密武器”
- Nature Microbiology：微生物组数据系统发育分析的方法
- Nature Microbiology：全球污水处理厂细菌群落揭秘！
- Nature Microbiology：王四宝组揭示按蚊肠道共生菌抗疟的分子机制
- Nature Microbiology综述：古菌的多样性、生态功能和进化史
- [Nature Microbiology：古菌基因组的标准化物种分类方法
- Nature Climate Change：周集中团队揭示气候变暖增强了微生物网络的复杂性与稳定性
- Nature Plants：植物根系微生物组中共生细菌的宿主偏好性
- Nature Plants: 可持续农业生态系统中的核心微生物组
- Nature Plants：英属哥伦比亚大学揭示植物塑造根际微生物组新机制
- Nature子刊：Sundaresan组-水稻长期干旱之后持续性的扰乱微生物组构成(宋毅点评)
- Nature Plants：根系微生物可以远程提高植物应对地上部环境胁迫的能力
- Nature Plants: 中科院微生物所郭惠珊研究组揭示土传病原菌逃避寄主免疫的新机制
- Nature Plants：华中农大Kenichi Tsuda组利用植物体内原位细菌转录及蛋白组学鉴定寄主免疫攻击的病原菌蛋白
- Nature Plants：中德合作发现玉米根系与根际有益微生物互惠关键生物学机制
- Nature Plants：浙大王蒙岑组揭示水稻种子内生菌抗病新功能
- Nature Plants：河南大学王学路团队揭示大豆与根瘤菌匹配性的进化及其分子机制
- Nature Protocols：遗传发育所白洋组发表高通量分离培养和鉴定根系细菌的方法
- Nature Protocols：何胜阳组建立拟南芥微生物组研究的标准化生长体系！
- Nature Food综述：墨尔本大学贺纪正组综述土著作物微生物组对可持续农业的潜力！
- NEE：微生物系统中的功能与功能冗余
Nautre Communications
- NC：港大张彤团队-基于组学的耐药基因风险评估框架
- NC：中国药科郝海平和郑啸发现饮食-微生物互作缓解肠损伤
- NC：遗传发育所Speakman组-棕色脂肪是无菌小鼠改善血糖的关键
- NC：宏基因组联合宏蛋白组分析揭示土壤微生物降解多酚
- NC：中科院动物所王关红等综述基因技术防控蚊媒疾病
- NC：王金锋等揭示阴道菌群异位对子宫健康的影响
- NC：中农徐凌/UC伯克利Coleman-Derr-植物与根际微生物在干旱下的互作机制(招博后)
- NC：噬菌体中无机硫辅助代谢基因的生态学研究
- NC：海大张晓华团队发现马里亚纳海沟微生物抵抗高压的新机制
- NC：菌物组构建—-随机性v.确定性、干旱胁迫、宿主筛选、统一动态(郭良栋、杨军点评)*
- NC：南农沈其荣、张瑞福团队揭示多样性激发的确定性细菌装配过程限制群落功能
- NC：你觉得你吃的是草，其实你还是吃的土(遗传发育所朱峰)
- NC：恢复菌群多样性或能降低耐药性
- NC：蜜蜂肠道微生物的多样性
- NC：应对干旱 细菌崩了 真菌依然很稳（纯网络分析发Nature子刊）
- NC：南土所贾仲君组-稻田甲烷氧化的微生物机制
- NC：沈阳生态所揭示病原真菌和昆虫对温带森林木本植物物种共存的重要作用
- NC：机器学习方法扩展了anti-CRISPR蛋白家族的所有成员
- NC：免疫组库高通量分析工具：IGoR——更精确剖析免疫组库
- NC：微生物所科学家建成小鼠肠道微生物资源库
- NC：南农团队解码并重构微生物群体感应系统
- NC：全球变化因子对土壤微生物多样性和功能的影响
- NC：电缆细菌减少水稻种植土壤中的甲烷排放
- NC：三代测序重构菌株水平宏基因组序列的计算框架iGDA
- NC：刘威/潘玉峰等发现肠道微生物可以影响果蝇的攻击行为
npj期刊
Science子刊
- Science子刊：植物所杨元合组揭示矿物保护和微生物属性对冻土碳动态的关键调控作用
- Science子刊: 长期杀虫剂诱导选择下的宿主基因组与微生物组的共适应
- SA：南农沈其荣团队Science子刊揭示番茄早期微生物组功能决定成年健康*
- Science子刊: 类配对分析法揭示孤独症患者肠道菌群解毒功能受损
为什么Science子刊这么少，因为杂志和文章量最小，比Nature子刊少1个数量级。
Cell子刊
- Cell子刊：源自微生物群的醋酸盐能够在健康和疾病期间促进大脑先天免疫系统的代谢适应性
- Cell子刊：粘上你-细菌生长素介导的植物根部细菌定殖
- CHM：中科院遗传发育所周俭民组发现特异靶向病原菌致病力的植物天然产物并阐明作用机制*
- CHM：微生物来源的细菌素靶向宿主抗早期断奶仔猪腹泻研究
- CHM综述：口腔微生物群的部位特点：微米级生境与生态位
- CHM综述-建立因果关系：合成菌群在植物菌群研究中的机会
- CHM：根瘤菌微生物群落的模块化特征及其与共生根瘤菌的进化关系
- CHM：成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关
- CHM：中山大学李剑峰组揭示植物利用细菌获得真菌抗性
- CM：发现60%的非酒精性脂肪肝与肠道菌有关，携带者体内酒精可达健康人4-6倍
- CM:北大姜长涛组发现HIF-2α通过肠道菌群调控脂肪产热
- TiMM微生物组学研究的突破与瓶颈
- Cell Reports：中大骆观正+上科大季泉江-CRISPR引导的细菌靶向遗传筛选系统
Gut
- Gut：刘星吟/王益超/曹爱华等揭示孤独症患儿肠道菌群发育轨迹图谱(赵方庆点评)
- Gut：粪便病毒组移植减轻2型糖尿病和肥胖症模型小鼠的相关症状
- Gut：人体最初的微生物起源与生殖健康* 孕期健康对孩子至关重要
- Gut：人体口腔菌群的稳定性和动态变化规律* 科普：口腔微生物“你的大能量，超乎我想象”
- Gut-2018-早期肝癌肠道生物标志物鉴定
PNAS
Microbiome
- Microbiome：香港理工李向东组-医院源可吸入耐药基因与宿主群落、临床关联和环境风险
- Microbiome：中科院微生物所蔡磊组揭示病害影响植物微生物组群落构建与功能适应
- Microbiome：西农韦革宏团队简化合成菌群通过激活ISR防治黄芪根腐病
- Microbiome：人类肠道和病原菌的可移动抗性组驱动环境中抗生素抗性增长
- Microbiome：海南大学张家超、Rob Knight等揭示益生菌在宿主肠道内适应性进化规律
- Microbiome：城环所杨军组-小幅盐度变化改变了城市水库微型真核浮游生物群落的构建过程和网络稳定性
- Microbiome：浙大马忠华团队-生防细菌抑制病原真菌新机制
- Microbiome：微生物所刘双江组建立人肠道微生物资源库（hGMB）
- Microbiome | 中科院张惠明团队揭示RNA介导的DNA甲基化影响植物根部微生物群落
- Microbiome：南土所梁玉婷组-稻田土壤产甲烷菌的共存模式
- Microbiome: 乡村环境微生物组成及功能基因或对呼吸道及过敏疾病具有保护性
- Microbiome：中国人群宿主遗传、肠道菌群与复杂疾病的关系
- Microbiome：地球上有多大比例的原核生物已经被测序了基因组？
- Microbiome: 微生物组的定义重新审视:旧概念和新挑战
- Microbiome：Kraken2进行16S物种注释又快又准，秒杀QIIME2
- Microbiome：捕食性细菌新类群-慢生单胞菌目细菌独特的生境适应性
- Microbiome：微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式
- Microbiome：华中农大谢卡斌组利用CRISPR系统减少16S rRNA基因测序宿主污染*
- Microbiome：南土所孙波组揭示间作重塑根际微生物组并促进生长的机制
- Microbiome：南京农大团队在粘细菌捕食的生态学功能方面取得重要进展
- Microbiome：中外合作揭示微生物群落降解复杂微生物聚合物的酶(视频导读)
- Microbiome：环境过滤驱动农田生态系统土壤古菌独特的空间分布*
- Microbiome：土壤微生物驱动退耕还林系统土壤剖面的养分循环*
- Microbiome：40年施肥处理后固氮菌及氮固定受抑制 新闻稿:南土所褚海燕组揭示长期施肥抑制根际微生物固氮的作用机制*
- Microbiome：根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物病原菌*
- Microbiome：马铃薯疮痂病与土壤微生物组关系新进展*
- Microbiome：所谓的“富集培养”获得的微生物真的都是被“富集”出来的吗？*
- Microbiome：鸡肠道微生物宏基因集(张和平、魏泓、秦楠点评)*
- Microbiome：应用多维宏组学方法协同揭示复杂细菌群落对目标底物代谢的菌间相互关*
- Microbiome：利用Nanopore高通量测序技术解析污水处理体系可移动抗性基因组*
- Microbiome：随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建*
- Microbiome：扩增子16S分析苏铁类植物微生物组*
- Microbiome：韦中组揭示根际原生动物群落是决定植物健康的关键因素*
- Microbiome：野生哺乳动物的皮肤和肠道微生物对核污染的反应
- Microbiome：微生物在植物世代之间的旅程
- Microbiome：南农张瑞福团队揭示放牧引起草原微生物组变化驱动土壤有机碳的转化和生产力的提升
- Microbiome：中科院遗传发育所揭示植物发育和氮肥共同作用下的小麦根系微生物组
- Microbiome：土壤微生物群落对有机和无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力
- Microbiome：NGLess语言实现快速可重复分析宏基因组的流程NG-meta-profiler
- Microbiome：首个地球微生物“社会关系”网络在浙大绘制！
- Microbiome：再论扩增子功能预测分析(Picrust)的效果
- Microbiome：使用16S rRNA基因数据集实现种水平的分类
- Microbime：微生物组学领域的标准制定
- Microbiome：稻种的驯化在生态进化上塑造水稻种子的细菌与真菌群落
- Microbiome：长江中浮游和底栖硅藻的生物地理模式
- Microbiome：生态中心张丽梅组-植物发育时期驱动玉米微生物组生态角色的分化
- Microbiome：宏基因组揭示冻土带、温带草原和热带土壤抗性的特征
ISME
- ISME：林科院袁志林等-冷杉优势真菌共生发育的基因家族趋同演化及平衡选择机制
- ISME：胡锋/朱永官等揭示土壤噬菌体-宿主菌协同应对有机氯农药胁迫机制
- ISME：南农张瑞福组揭示芽孢杆菌通过代谢互作刺激常驻根际微生物促进植物生长！
- ISME：南农韦中等消减土壤青枯菌生物障碍新策略
- ISME：微生物网络构建与分析面临的挑战
- ISME：土壤微生物对硫的短期及长期利用的决定因素-基于13C,15N,14C和35S多同位素标记结果
- ISME：西农沈锡辉+韦革宏+王瑶揭示细菌铁获取和外膜囊泡招募新机制
- ISME：根系招募特异型菌群增强植物对盐胁迫的抗性
- ISME：中国林科院亚林所袁志林组揭示盐碱地根系深色有隔内生真菌种群基因岛的正向选择机制
- ISME：南土所梁玉婷组-不同气候条件下微生物代谢及残体介导施肥对土壤有机碳的影响
- ISME：中大李文均组在放线菌生命暗物质的生态功能与进化上取得进展
- ISME：昆士兰大学郭建华组-人造甜味剂会促进细菌耐药性的传播
- ISME：多组学揭示低氧环境下的汞甲基化细菌
- ISME：中科院微生物所揭示细菌利用光能新机制！
- ISME: 中科院南京土壤所褚海燕组揭示关键菌群的生物多样性决定作物产量
- ISME: 北大吴晓磊组发现囊泡为细菌利用环境血红素提供全新途径
- ISME：南农沈其荣团队基于大数据准确预测土壤的枯萎病发生 纯生信发ISME
- ISME: 近海沉积物中古菌群落的时空动态：群落构建机制和共现关系
- ISME：海洋氨氧化古菌的营养能量策略决定其生物地理学分布格局(秦玮组招聘博士/博后)
- ISME：中科院动物所张知彬组揭示肠道微生物介导了降雨变化对布氏田鼠种群的上行效应*
- ISME：群落构建过程的平衡介导农田土壤微生物群落物种共存*
- ISME：污水厂抗性组受细菌组成和基因交换驱动且出水中抗性表达活跃*
- ISME：城环所杨军组揭示水库蓝藻影响真核浮游生物的群落演替和物种共存*
- ISME：宿主性别可以决定肠道微生物对寄生虫感染的响应*
- ISME：整合分析揭示塑料圈微生物组的全球多样性
- ISME：二型糖尿病患者中与牙周炎相关的龈下菌群
- ISME：华中农大李霞组发现大豆根际微生物组变化与根瘤菌共生效率的关系
- ISME：病原菌介导植物根际有益微生物群落组装
- ISME：菌根真菌菌丝分泌物中的果糖作为信号激发解磷细菌活化植酸
- ISME：微生物生态学中的挑战：建立对于群落功能与动态的预测性认识
- ISME：高手开杠-‘1%的微生物可培养’到底为哪般？
- ISME：相关分析在微生物生态学中的应用与误用
- ISME：沈农栾军波组揭示水平转移基因的功能
- ISME：二氧化碳和氮水平对植物根表菌群和功能的影响
- ISME：比较基因组学揭示蓝藻进化和生境适应性特征
- ISME Commun: 华中农业大学在菌群收敛机制方面取得新进展
Genome Biology
Cell Research
Protein & Cell
Molecular Plant
- MP: 王二涛组及合作者揭示丛枝菌根共生与根瘤共生的协同进化机制*
- MP综述：植物-微生物互作的系统生物学
- MP：微生物跨界平衡维持植物健康
- MP：中科院微生物所郭惠珊组和中科院上海植物逆境中心段成国组合作揭示油菜生长与免疫动态调节的新机制
- Plant Com：绝对定量检测宿主微生物组的HA-QAP技术简介* 全文解读
Bioinformatics
- BiB：王秀杰/裴小兵合作开发单细胞组学细胞标记基因鉴定算法COSG
- BiB: 电子科大邹权组构建基于肠道菌群平衡的疾病预测模型及微生物生物标志物发掘平台
- GPB：农业生产活动对水体微生态的重要影响
- GPB：菊粉改善糖脂代谢紊乱作用的机制
- GPB：葛根芩连汤调节肠道菌群治疗糖尿病的关键活性成分鉴定及机制研究
- GPB: MicroPhenoDB量化关联宏基因组与病原微生物、核心基因和人类疾病表型
- Bioinformatics：吉林大学刘富组-深度学习从宏基因组序列中识别短病毒序列Virtifier
美国微生物学会mSystems/mBio/AEM
- mSystems：“地球第四极”马里亚纳海沟极端环境中神秘的底栖病毒群落及其生态功能
- mSystems：生物地球化学进入病毒时代-采用多样的方法研究病毒和生物地球化学循环
- mSystems：华中农大郝秀丽组发现稀有/丰富微生物类群对镉污染土壤改良剂的不同反应！
- mSystems：青大苏晓泉阐述微生物组的Beta多样性-从全局比对到局部比对
- mSystem：西农韦革宏组细菌-真菌互作影响微生物多样性-土壤养分循环关系
- mSystems：苏晓泉、徐健等发布全球微生物组结构和功能搜索平台2.0
- mSystems：苏晓泉、徐健-基于大数据引擎的全球微生物组转化网络
- mSystems：华南农大揭示水稻SST基因调控根际微生物协同耐盐机制
- mSystems: 中科院动物所王德华组揭示低温下野生动物肠道菌群提高存活率的机制
- mSystems：南京土壤所褚海燕组受邀发表微生物生物地理学综述(官方配视频简介)
- mSystems： 南土所褚海燕组揭示了大空间尺度下空间比季节对土壤微生物群落的影响大
- mSystems：土壤化学计量特性影响土壤C、N和P循环微生物丰度及其对全球变化的抵抗力
- mSystems：南昌大学徐振江团队发现微生物预测年龄皮肤比肠道更准确
- mSystems：从铁载体窥根际菌群互作大局，可见一斑！
- mSystems：相对丰度会歪曲实际丰度，联合16S扩增子测序和总菌qPCR获得的绝对丰度可靠吗？
- mBio：微生物组学研究的可再现性、可重现性、稳定性与普适性
- AEM：众里寻他千百度，用了SIP不迷路-识别污水处理单元中砷氧化细菌的多样性及代谢潜力
Frontier系列
- FiM | 牧医所奶业创新团队建立瘤胃微生物脲酶的靶向宏蛋白质组方法
- FM：西南民大朱英等-肠道菌群研究促进了朱鹮的迁地保护
- FPS综述：植物次生代谢物与微生物组互作研究进展
- FM：大熊猫的肠道菌群可能并没有特化出发酵纤维素的能力
土壤SBB/SEL/Geoderma
- EJSS: 南土所梁玉婷组-生境决定了土壤植物系统中细菌、抗性基因和可移动元件间的关系
- Geoderma：南土所梁玉婷组-施用粪肥土壤中抗生素抗性基因和金属抗性基因的共存机制
- SBB：南土所梁玉婷、孙波等跨气候带土壤移置揭示了气候变暖及施肥对土壤固氮微生物递增的环境过滤作用
- SEL重磅：重新认识菌根：菌根真的如普遍认为的那样重要吗？
- SEL | 植物通过根系分泌物招募假单孢菌协助抵抗地上部病原菌侵染
- SBB：石油污染土壤微生物群落构建与生物多样性研究*
- SBB：增温掩盖不同形态氮素对青藏高原草地微生物群落的作用*
- SEL：力争成为土壤生态学界的“Cell”
- SBB：南土所褚海燕组-pH主导土壤中固氮群落的共存与装配
- SBB：土壤微生物群落的特征究竟由什么决定
- SBB：替代固氮酶对非共生固氮可能的贡献
Current Opinion系列
- COM：重组菌群体系在根系微生物组研究中应用*
- COM：下一代微生物组技术在作物生产中的应用——局限性以及基于知识的解决方案的需求
- COM：病原体之外-微生物组与植物免疫系统的相互作用
- COM：根系-土壤-微生物互作
- COB：自然界的循环利用-厌氧微生物群落推动着自然生物质的降解
- COPB：Current综述：中农宋春旭等为植物有益微生物组构建一个美好家园
Communications Biology
Nature出版社新开源期刊，目标是承接Nature Communications拒稿的优秀文章。今年获首个影响因子，预计2-3年后将稳定在8分左右(Nature Communicates和Scientific Reports的平均水平)。
- CB: 浙工大钱海丰组等发现浮丝藻水华促进抗性基因传播转移
- CB：南土所梁玉婷组-细菌群落的高稳定性和代谢能力促进了土壤中易分解碳的快速减少
- CB：中国农大胡永飞组构建整合的鸡肠道微生物组的参考基因和基因组集
环境EST/EM/EP/EI/JHM/STE
- JHM：原生动物对酸性矿山废水侵蚀土壤的生态响应机制
- JHM：中科大盛国平组揭示蚯蚓堆肥降低污泥耐药基因ARG的传播
- EST：西湖大学鞠峰组-污水厂病原菌与土著反硝化细菌是多重抗生素耐药基因的活跃表达者
- EST：广东生态所孙蔚旻团队发表尾矿微生态调查两部曲
- EST：李芳柏团队揭示微生物介导的砷氧化耦合硝酸还原
- EI：南土所褚海燕组发现农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能
- EI：西湖大学吴连锋&鞠峰团队饮用水中的二甲双胍氯化副产物的潜在健康隐患
- EI：天大王灿+昆士兰郭建华揭示生物气溶胶是猪场耐药基因的重要传播途径
- EP：广东省生态环境技术研究所孙蔚旻团队: 梯田土壤微生物对不同酸性矿山废水侵蚀作用的响应机制*
- EM： 生而为菌，自强不息-嗜酸杆菌在重金属污染土壤中的生态适应性机制
- EM: 土壤pH和温度调节农业生态系统中丰富和稀有细菌群落的构建过程
- EM：不同气候条件下土壤稀有与丰富微生物类群的分化策略
- STE：环境菌群代谢产物可预防炎症症状
- STE：华南农大曾振灵/熊文广-猪粪介导抗生素耐药基因向农场工人和周边环境传播
- 提高社会的微生物素养：势在必行！
Journal of Genetics and Genomics(遗传学报)
- JGG：青岛大学苏晓泉团队利用条件致病菌指数评估环境微生物风险
- JGG：微生物组学专刊(赵方庆、白洋、张志刚、王军、郑钜圣、魏泓、沈伟、刘永鑫等）
- JGG：我国多民族间宿主—微生物基因多样性及微观共进化研究
- JGG：北大陈峰+陈宁揭示维生素A缺陷小鼠中多因素对肠道菌群的调节作用
- JGG：EVenn: 3分钟在线轻松绘制5种Venn图和Venn网络
- JGG：肠道微生物研究助力穿山甲圈养保护
- JGG：肠道细菌加重小分子量卡拉胶诱发的直肠炎症
- JGG：微生物所王军-综述固有免疫细胞在胃肠道疾病中研究进展
- JGG：华中师大蒋兴鹏组-不同稀疏水平信号的微生物组关联检验方法
- JGG: 赵方庆、赵翔等开发高效捕获RNA病毒基因组的宏转录组建库测序新技术
- JGG：遗传发育所白洋组和曹晓风组-水稻组蛋白甲基化调控根系核心菌群
- JGG：赵方庆组综述菌群-肠-脑轴与自闭症谱系障碍的研究进展
- JGG：口腔微生物组助力妊娠糖尿病识别
- JGG：肠道菌群与COVID -19重症风险密切关联
- JGG：Microbiome 专刊征稿
- 遗传：细菌、真菌和动植物的泛基因组研究进展
中国科学
- SCLS：水稻微生物组时间序列分析*
- SCLS：拟南芥二半萜类化合物调控根系微生物组*
- SCLS：微生物所方荣祥/张莉莉团队开发植物内生细菌特异16S引物
- 中国科学：植物免疫研究与抗病虫绿色防控：进展、机遇与挑战
- 科学通报：合成微生物群落的构建与应用
- Science Bulletin：崔杰组发表了深浅海软甲纲动物比较病毒组学分析成果
综述
- TiP：湖大于峰组综述病原体分泌的宿主模拟物在植物病害发展中的新作用！
- 刘双江：微生物对经济社会发展的影响研究
- 近9分的生信杂志发了一篇Venn图工具大比拼
- 微生物组学大数据：如何挖掘与利用？
- TM综述：低微生物量微生物组研究中的污染：问题和建议
- 南土所褚海燕组综述微生物组学的技术和方法及其应用
- TM：微生物稀有生物圈群落装配过程
- TM：rDNA拷贝数的种内变化影响微生物群落分析吗?
- TM: 微生物入侵：过程、模式与机制
- TiM：清华杨云锋-微生物功能性状的新兴模式
- BA：根际微生物组提高植物耐盐性的研究进展*
- FEMS综述: 如何从微生物网络中的“毛线球”理出头绪
- TEE综述：植物—土壤反馈(PSF)：自然和农业科学间的桥梁
- MER：系统了解宏组学实验与分析
- 淡水：21世纪的分子微生物生态学
- ARM：植物微生物组的生态学与进化
- Ecology&Evolution|微生物功能多样性从概念到应用
- BA综述：微生物群落的生物技术潜力及应用
其它
- 微生物组数据揭示中国稻谷产毒真菌分布及仓储动态变化
- BFS：南土所梁玉婷组综述促进土壤植物生态系统健康的微生物共存理论
- 中大李文均团队在氮循环功能基因的生物地理学分布格局研究中取得进展
- IJMS：牧医所奶业创新团队在瘤胃微生物新型脲酶抑制剂开发方面取得新进展
- ME：环境DNA（eDNA）宏条形码技术正在转变我们考察动植物群落的方法
- ESTL：郭建华等新型多重扩增子测序法可实现污水中 SARS-CoV-2 RNA 的精确定量和病毒溯源
- Aquaculture：天津农科院谢凤行团队揭示菌群预测功能与实际代谢特性的相关性
- Water Research：南土所褚海燕组揭示冰川源水体和沉积物细菌群落显著分异
- Engineering：王军和张发明组发表人体肠道菌群的原位重建及昼夜节律的研究
- EBioMedicine：西湖大学郑钜圣组-乳制品摄入与肠道微生态、心血管代谢健康的关系
- PCE：南农张瑞福组揭示微生物肥料菌种芽孢杆菌应对植物免疫防卫实现根际定殖的新策略
- 【新疆棉花】合成生物学驱动第四次工业革命，生物技术促进新疆棉花健康绿色发展
- 土壤学报：张福锁院士等提出根际生命共同体新概念
- GEB：中科院南土所梁玉婷组-大陆尺度下稻田土壤微生物β多样性的纬度分布特征
- JGG：口腔微生物组助力妊娠糖尿病识别
- Diabetes Care：西湖大学郑钜圣等机器学习揭示影响2型糖尿病的肠道菌群特征
- Arthritis Rheumatology：张烜+王军发表系统性红斑狼疮患者的肠道菌群变化
- Horticulture Research：植物界的“投之以桃，报之以李”的合作共赢典范 模式图的手稿
- FEMS: 砷锑污染土壤剖面的微生物世界
- FEMS：广东生态所孙蔚旻组利用DNA-SIP宏基因组揭示锑氧化微生物及其代谢途径
- CSBJ综述：微生物组数据挖掘方法的挑战与机遇
- GCB：生态中心邓晔组-增温改变了微生物相互作用关系
- GCB：农田土壤丰富真菌比稀有真菌适应更广(一作解读+主图重现)
- GCB：西农韦革宏团队-土壤多营养级网络的复杂度增强农田系统生物多样性和多功能性的联系
- GEB：焦硕等发表生态位的系统发育保守性决定土壤古菌地理格局
- 青岛大学苏晓泉组-微生物组16S扩增子功能校正算法Meta-Apo
- BMC Biology：香港城市大学孙燕妮组发表高准确度预测病毒宿主的工具
- BMC：幼儿关节炎患儿肠道菌群的特征*
- WR：微生物污染源解析中宿主特异性标记物在中国的表现特征*
- Water Research：南科大夏雨+唐圆圆-台风对深圳沿海微塑料和微塑圈的影响
- WR：城环所杨军组揭示亚热带水库浮游有壳虫群落构建受随机性过程影响比确定性过程更强
- Science Bulletin：上海植生所王二涛组发表基于绝对定量丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型*
- JCP：曝气生物滤池处理焦化废水过程中N2O和NO的产生机理与群落功能研究*
- Fungal Diversity：70位作者共同修订真菌界担子菌门分类系统
- PCE：南农沈其荣团队根系分泌物驱动土壤-微生物-养分之间的反馈作用以响应植物的生长
- PB：玉米气生根分泌物支持的高效生物固氮
- EL：谁说N素含量高就不固氮了(本研究反而“多多益善”)
- EL：固氮能力主要取决于物种分类而不是土壤养分
- BT：关键胞外酶触发了细菌群落演替偶联的高效堆肥
- BT：大豆皮堆肥过程中的物质转化、微生物群落组成和代谢功能演替
- Viruses：病毒宏基因组学揭示马来亚穿山甲受仙台病毒和冠状病毒的侵染
- NewPhy.-揭秘优势种dominant species
- Gut Microbes：南医大刘星吟团队揭示肠道微生物与孤独症相关*
- Gut Microbes：南医大刘星吟组-孤独症的基因变异与肠道微生物群、代谢物和细胞因子的改变有关
- 中国微生物组计划—农作物微生物组*
- 应用生态学报：东北黑土区不同纬度农田土壤真菌分子生态网络的比较*
- EID：宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用*
- Current Biology: 微生物所白逢彦组段守富揭示酿酒酵母通过基因网络的逆向进化适应环境的新机制*
- 中国人是否对新冠病毒更易感？*
- 遗传：从遗传力到肠菌力：概念及研究进展
- 遗传：基因组时代线粒体基因组拼装策略及软件应用现状
- NAR：RiboFR-Seq将16S rRNA与宏基因组连接的方法
- NAR：浙大陈云/马忠华团队揭示病原真菌组蛋白H3K27甲基化识别新机制
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期刊介绍
- 微生物学综合性英文期刊mLife入选高起点新刊
- The Innovation | 中科院青促会主办精品英文期刊视频简介，定位IF 20+国际顶刊
- Applied and Environmental Microbiology (AEM)
- Soil Biology and Biochemistry(SBB)
- Bioresource Technology
- FEMS Microbiology Ecology
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其它
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