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QIIME 2教程. 28社区Community(2020.11)

已有 454 次阅读 2021-2-4 23:11 |个人分类:QIIME2|系统分类:科研笔记

社区 Community

https://docs.qiime2.org/2020.11/community/

与QIIME 2社区保持联系并保持最新状态的方法有多种。

论坛 QIIME 2 Forum

访问QIIME 2论坛(https://forum.qiime2.org/ )以获得QIIME 2支持,并与其他用户和开发人员讨论与QIIME 2相关的所有事情。

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详者注:论坛有非常多的版块,可以帮助我们解决学习和使用中的诸多问题。

用户支持 User Support

如果需要帮助您了解在运行QIIME 2时产生的输出,请发布到此类别。其中的示例包括帮助您理解图标签,QIIME 2中使用的技术等。该类别的帖子将由QIIME 2管理员进行分类,并及时作出反馈。

技术支持 Technical Support

如果您在运行QIIME 2时遇到技术困难,则发布到该类别中。常见的困难包括安装错误,帮助解读错误消息等。此类别中的帖子将由QIIME 2管理员进行分类,并迅速做出响应。

社区插件支持 Community Plugin Support

如果您对社区插件有疑问(错误报告,技术细节等),请发布到此类别。 社区插件是未在QIIME 2 Core Distribution中分发的插件。 请注意,将来我们计划不再使用“核心发行版”的概念,在核心发行版中,所有插件均为“社区插件”。 QIIME 2管理员不会回复此类别的帖子。

一般讨论 General Discussion

如果您对微生物组科学,生物信息学或其他一般性问题,想法或主题有一般性疑问,请发布到此类别。 帖子示例包括研究设计,论文讨论等。QIIME2管理员不会对此类别的帖子进行分类。

开发人员讨论 Developer Discussion

如果您是开发人员并且有疑问,想法或建议,请发布到此类别。 此类别中的帖子将由QIIME 2主持人进行分类,并及时做出回复。

社区贡献 Community Contributions

如果您有与QIIME 2相关的贡献,请发布到此类别。示例包括教程,插件,文档翻译等。QIIME2管理员不会对该类别的帖子进行分类。 请不要在此类别中发布任何问题。

主要包括4类资源:插件(Plugins)、教程(Tutorials)、翻译(Translations)和数据资源(Data resources)。我们的中文教程就属于翻译类别。最新的分类学数据库,也可在这里查找。

公告内容 Announcements

与QIIME 2版本,出版物,研讨会等相关的公告。

其他生物信息学工具 Other Bioinformatics Tools

如果您对与QIIME 2不相关的生物信息学工具有疑问,请发布到此类别。示例包括phyloseq,mothur等。QIIME2管理员不会对该类别的帖子进行分类。

想法和建议 Ideas and Suggestions

如果您有想法或建议来更改或改进QIIME 2,请发布到此类别。QIIME 2管理员将对该类别的帖子进行分类并进行回复。

杂项 Misc

此类别包含杂项子类别,这些子类别不适用于论坛上的其他任何地方。 QIIME 2管理员不会对此类别的帖子进行分类。 请不要在此类别中发布任何问题。

保持更新 Staying updated¶

有关QIIME 2的更新,请在Twitter上关注 @qiime2 https://twitter.com/qiime2

请求功能,报告错误,提供反馈

Requesting features, reporting bugs, providing feedback

如果您想在QIIME 2中看到某些特定功能,或者发现了一个错误,或者想留下反馈,请发布到QIIME 2论坛上。在努力使QIIME 2成为微生物组分析的有用且可访问的工具时,我们感谢所有反馈。

译者简介

刘永鑫,博士,中科院青促会会员,QIIME 2项目参与人。2008年毕业于东北农业大学微生物学专业,2014年于中国科学院大学获生物信息学博士,2016年遗传学博士后出站留所工作,任工程师。目前主要研究方向为宏基因组数据分析。目前在Science、Nature Biotechnology、Protein & Cell、Current Opinion in Microbiology等杂志发表论文30余篇,被引2千余次。2017年7月创办“宏基因组”公众号,目前分享宏基因组、扩增子原创文章2400余篇,代表作有《扩增子图表解读、分析流程和统计绘图三部曲(21篇)》《微生物组实验手册》《微生物组数据分析》等,关注人数11万+,累计阅读2100万+。

Reference

https://docs.qiime2.org/2020.11

Evan Bolyen, Jai Ram Rideout, Matthew R. Dillon, Nicholas A. Bokulich, Christian C. Abnet, Gabriel A. Al-Ghalith, Harriet Alexander, Eric J. Alm, Manimozhiyan Arumugam, Francesco Asnicar, Yang Bai, Jordan E. Bisanz, Kyle Bittinger, Asker Brejnrod, Colin J. Brislawn, C. Titus Brown, Benjamin J. Callahan, Andrés Mauricio Caraballo-Rodríguez, John Chase, Emily K. Cope, Ricardo Da Silva, Christian Diener, Pieter C. Dorrestein, Gavin M. Douglas, Daniel M. Durall, Claire Duvallet, Christian F. Edwardson, Madeleine Ernst, Mehrbod Estaki, Jennifer Fouquier, Julia M. Gauglitz, Sean M. Gibbons, Deanna L. Gibson, Antonio Gonzalez, Kestrel Gorlick, Jiarong Guo, Benjamin Hillmann, Susan Holmes, Hannes Holste, Curtis Huttenhower, Gavin A. Huttley, Stefan Janssen, Alan K. Jarmusch, Lingjing Jiang, Benjamin D. Kaehler, Kyo Bin Kang, Christopher R. Keefe, Paul Keim, Scott T. Kelley, Dan Knights, Irina Koester, Tomasz Kosciolek, Jorden Kreps, Morgan G. I. Langille, Joslynn Lee, Ruth Ley, Yong-Xin Liu, Erikka Loftfield, Catherine Lozupone, Massoud Maher, Clarisse Marotz, Bryan D. Martin, Daniel McDonald, Lauren J. McIver, Alexey V. Melnik, Jessica L. Metcalf, Sydney C. Morgan, Jamie T. Morton, Ahmad Turan Naimey, Jose A. Navas-Molina, Louis Felix Nothias, Stephanie B. Orchanian, Talima Pearson, Samuel L. Peoples, Daniel Petras, Mary Lai Preuss, Elmar Pruesse, Lasse Buur Rasmussen, Adam Rivers, Michael S. Robeson, Patrick Rosenthal, Nicola Segata, Michael Shaffer, Arron Shiffer, Rashmi Sinha, Se Jin Song, John R. Spear, Austin D. Swafford, Luke R. Thompson, Pedro J. Torres, Pauline Trinh, Anupriya Tripathi, Peter J. Turnbaugh, Sabah Ul-Hasan, Justin J. J. van der Hooft, Fernando Vargas, Yoshiki Vázquez-Baeza, Emily Vogtmann, Max von Hippel, William Walters, Yunhu Wan, Mingxun Wang, Jonathan Warren, Kyle C. Weber, Charles H. D. Williamson, Amy D. Willis, Zhenjiang Zech Xu, Jesse R. Zaneveld, Yilong Zhang, Qiyun Zhu, Rob Knight & J. Gregory Caporaso#. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nature Biotechnology. 2019, 37: 852-857. doi:10.1038/s41587-019-0209-9



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