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科学杂志代价沉重的论文,六名作者发文前身亡 精选

已有 6188 次阅读 2014-8-31 20:34 |个人分类:学术研究|系统分类:海外观察| 流行病, 埃博拉, 病毒, 基因分析

八月二十八日,在最新一期美国Science杂志网上发表了一篇有关今年爆发的埃博拉病毒基因组测序分析的论文,题为 Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmissionduring the 2014 outbreak : SCIENCE: "埃博拉病毒的基因组测序揭示流行规律"

http://www.sciencemag.org/content/early/2014/08/27/science.1259657.full

这篇由59名作者组成的科学家和医学界队伍,得到美国NIH的资助,并有塞拉利昂国家卫生部的支持.在埃博拉病毒基因组测序和病毒变异分析方面给与非常及时而详尽的数据和结论.对医学界研究,诊断和治疗病毒感染,和应对或预防未来这类疾病爆发提供了第一手资料.

在著名的科学杂志, 发表一篇重要论文,本来是一项很高的荣誉和成就, 但从来没有像这篇分析测序埃博拉病毒株这篇文章这么悲壮,这么代价沉重, 这篇分析测序埃博拉病毒株的论文还没发表,六位作者已经不幸身亡,其中五位死于埃博拉病毒感染,他(她)们中,三名是护士,两名是实验室技术人员和医生, 另一位死于中风,多少与从事埃博拉病毒研究所引起的恐惧和工作压力有些关系

来自哈佛大学的遗传学家,系统生物学中心的副教授Pardis Sabeti,是这篇论文的通讯作者.她同时也是哈佛大学和麻省理工学院Broad研究所的副研究员.她告诉媒体,这些已故的作者都是她们过去七年合作研究拉沙热疾病的同事, 她的研究中心,一直在与塞拉利昂的科学家们, 对遗传变异的拉沙热病毒的遗传变异,进行研究跟踪。其中包括像埃博拉病毒,这样极度危险的引起出血热的病毒。

死去的作者中,Mbalu Fonnie, Alice Kovoma 和 Alex Moigboi都是护士,她们在照顾自己的同伴护士,一位孕妇时, 感染上埃博拉病毒,Mohamed Fullah是拉沙热疾病实验室中的一位技术员, 他估计是从其家庭成员中感染上埃博拉病毒. 另一位技术员 Sidiki Saffa, 死于中风.Pardis Sabeti,博士认为他的不幸去世,与他连续工作的压力,不无关系.

作者中还包括 一名医生,Sheik Humarr Khan博士, 他是塞拉利昂的一名顶级医生,他帮助领导他的国家的应对埃博拉疫情,其死亡引来全球关注和争论,其中焦点就是他是否应该被接受ZMapp治疗。这是一种尚未批准的实验性药物,只能提供给极少数的患者,其中包括两名美国传教士和三个利比里亚的医护人员。Sheik Humarr Khan博士和其他人原先计划在今年夏天访问波士顿,探讨一个新的合作计划,Sabeti告诉媒体。遗憾的是论文还未发表,他已走了.

这项研究对历史上最大的埃博拉疫情爆发初期的实况及来源有了清晰的描述和分析。研究人员一共从9978例感染埃博拉病毒的患者身上取得在塞拉利昂疫情爆发最初三周的病人的埃博拉病毒样本,分别进行基因组测序。分析基因的变化,他们的结论是,这种病毒或许在过去十年,就已经引入到西非中部非洲。

病毒感染疫情爆发最初是由一个人,一个来源,或一个库源的病毒所引发的,研究人员说,病毒从一个人迅速传播到另一个,再传给家人,而救护患者的医护人员在抢救患者时,无意中感染自己,她们当时都没有意识到这种致命性疾病的病因是感染力极强的埃博拉病毒。

研究人员解释说,该病毒是今年五月先从几内亚进入塞拉利昂, 最初感染者是一位传统的医护工作者,他在治疗几内亚疑似埃博拉感染的患者时不幸被感染上病毒, 死后被安葬在塞拉利昂。死者的埋葬很快在塞拉利昂国内引起连锁感染反应,最后触发流行病大爆发,因为参加了葬礼的13名妇女都感染了这种病。研究人员还发现显著变异病毒,并表示需要更多的研究来弄清楚这些变化的影响,以及可能影响到诊断性测试的准确性。

本文根据华尔街日报 Pharmalot博文编译,

A Tragic Toll: Several Authors of an Ebola Study Died From… Ebola

By  BETSY MCKAY


文章摘要  

研究人员已经对来自西非病人的99个埃博拉病毒基因组进行了测序,西非是有记录以来发生最大规模埃博拉病毒感染爆发的地方。他们的结果对埃博拉病毒(EBOV)在2014年爆发时是如何及何时进入人群的提供了见解,它们可能会指导控制埃博拉病毒的传播及了解治疗标靶的方法。过去的埃博拉病毒感染的爆发局限于中非地区,但2014年的爆发则是从西非国家的几内亚开始的,并接着蔓延至塞拉利昂、利比里亚和尼日利亚。与所有其它EBOV的爆发一样,有关的病毒株带有独特的基因变异。

为了对它们进行描述,Stephen Gire等人应用深度测序技术对来自塞拉利昂某医院的78名患者的99个埃博拉病毒基因组进行了评估。通过将2014年EBOV的测序数据与早些时候的EBOV爆发的20个基因组进行比较,Gire等人确定,今年的爆发可能是在过去的10年内从非洲中部地区传播而来的。研究人员说,与过去的爆发——在这些爆发中,对如感染的狐蝠等病毒储库的持续接触促成了爆发的发展——相比,此次的病毒爆发始于某单一人储库的交换。它接着通过持续的人与人的相互交往而传播,它可能是通过将来自几内亚的2个EBOV病毒世系引入塞拉利昂而传播到那里的。(Gire等指向在几内亚的一个与埃博拉病毒有接触的治疗师的葬礼可能是这些病毒世系传播的源头。)考虑到目前疫情中的高死亡率,像那些在此获得的EBOV样本的演化是有限的。这些样本对了解独特的病毒突变是如何能够影响2014年爆发的严重性提供了一个起点。

这些结果还表明,在疾病流行期间对病毒基因组进行快速测序如何能对疾病监控及指导有关治疗标靶的研究提供见解。尽管知道这些病毒序列没有即刻的治疗上的意义,但这一资讯对那些正在努力了解该疾病的科学家们是至关重要的。

引自丁香园  http://news.dxy.cn/bbs/topic/29016414





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