博文
- 置顶 · 薛良交-南京林业大学林学院
- http://linxue.njfu.edu.cn/sz/ShowJs.asp?id=358 http://linxue.njfu.edu.cn/info.php?cid=117 姓名： 薛良交 系别： 林木遗传育种系 职务： 教师 类别： 教授 最终学历： 博士研究生 最终学位： 理学博士 办公电话： 电子邮箱： lxue@njfu.edu.cn 教育经历： ...
- JC10: SNPlice, SNP and alternative splicing
- Bioinformatics. 2015 Apr 15;31(8):1191-8. doi: 10.1093/bioinformatics/btu804. Epub 2014 Dec 6. SNPlice: variants that modulate Intron retention from RNA-sequencing data. Mudvari P1, Movassagh M1, Kowsari K1, Seyfi A1, Kokkinaki M2, Edwards NJ2, Golestaneh N3, Horvath A1. Author information Abst ...
- Independent filtering & high-throughput experiments
- http://www.pnas.org/content/107/21/9546.long Independent filtering increases detection power for high-throughput experiments We all may know this during the practice of data analysis. They got it published, on PNAS.
- 文本文件分行
- 众口难调。 简单个分行符，各个操作系统都个不相同。Windows: rn, Unix: n Old version of Mac: r. 写个程序要让各个系统都适用，也挺折腾。 ## 小文件可以这样，都读进来，再拆分 local $/ = undef; my $content = DESIGN; my @lines = split /\r\n|\n|\r/, $content; ## 大文 ...
- 冬季看雨
- 很久之前，听过一首歌，叫《冬季到台北来看雨》，心里总有一些纳闷，为什么是看雨不是看雪。后来渐渐明白很多地方冬季是下雨而不下雪的。雅典市，这个亚特兰大附近的小镇也是这样。 公历里冬季是从12月到2月，虽然春节已过，可季节还是在冬季的范畴。天冷冷的，时而有些冰粒飘过，但大都是象征性的，雨还是多数。 有人 ...
- Two Packages for network analysis: Bipartite and qgraph
- http://sachaepskamp.com/qgraph https://solomonmessing.wordpress.com/2012/09/30/working-with-bipartiteaffiliation-network-data-in-r/ http://www.inside-r.org/packages/cran/bipartite/docs/czvalues
- JC9: dN/dS and scaled selection coefficients
- 目前，有许多计算方法来评估蛋白质编码序列上的自然选择模式和强度，但是，这些方法之间的关联在很大程度上是未知的。 这里， 我们阐明了两个广泛应用的系统发生模型框架之间的关系：dN/dS 模型和mutation-selection (MutSel)模型。 我们推导了dN/dS 和 scaled selection coefficients的数学关系，并应用于研究这两个模型 ...
- 美国高中 生物学教材一例
- CK_12_Biology_I https://archive.org/stream/ost-biology-ck_12_biology_i/CK_12_Biology_I#page/n1/mode/2up CK_12 是个提供免费教材的非营利组织 http://www.ck12.org/ 在全球化的现在，科学教学中专业术语是用母语还是英语？ 要培养科学家，貌似是用英语好，因为科学家学习的最终目的是输出 ...
- 科学研究从写长文开始
- 热度 1
- 科学研究从写长文开始 科学网上是很喜欢长博客的。君不见精选或置顶的博文都很长很长，字少的博客肯定有大量精美的图片。 这一点在科研领域也一样，写的少基金本子是不怎么让人待见的。 之前收到一些教授的email，洋洋洒洒，娓娓道来；只让人觉得，就那么点事儿，有那点功夫，还不如写点更有意义的东西。 不过，可 ...
- 科研选题与叶公好龙
- 叶公子高好龙，钩以写龙，凿以写龙，屋室雕文以写龙。于是天龙闻而下之，窥头于牖，施尾于堂。 叶公见之，弃而还走，失其魂魄，五色无主。是叶公非好龙也，好夫似龙而非龙者也。 （此文选自【汉】刘向《新序·杂事五》） Question 1: Why Dr. Ye claim that he likes Dragon so much? Question 2: Does ...
- Linux rename file names by batch
- rename _namecounts.txt .txt *.txt for f in *.txt; do mv $f ${f/${f:4:8}/1}; done This is the correct version: sed function sed s/^@RG.*/@RGtID:717tSM:sample1tPL:illuminatLB:lib1tPU:unit1/g 717RsRII_WGA_old.sam & ...
