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转录组学与蛋白质组学培训班 8月12-15日 上海

已有 3104 次阅读 2015-7-20 16:38 |个人分类:基因组学|系统分类:科研笔记

 

 

多组学实验及数据分析系列研习会(第三期)
之转录组学、蛋白质组学和代谢组学
在后基因组时代,生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小RNA测序、蛋白质组定量实验和代谢组学被组合应用到同一个课题研究中,在原先单个平台产出数据分析挖掘的的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列研习会将深入探讨不同平台的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析,并介绍多组学实验整合研究的案例,研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解和带领数据分析的实际上机操作(查阅详情..)。
主办单位:上海研数数据科技有限公司 上海生咨生物科技有限公司
协办单位:上海市药物转化工程技术研究中心
支持单位:上海维基生物科技有限公司
举办时间:2015年8月11日-8月15日
举办地点:上海良友饭店,静安区南苏州路1455号
具体内容:

811日(周下午14301730 812日上午8:30-9:30注册。

812日(周

上午(930-1200

1. 蛋白质组学常用实验方法

1.1 基于凝胶技术的定量蛋白质组学

1.2 基于质谱技术的蛋白质组学研究

812日(周

下午(13:30-17:30

2.蛋白质搜库和差异蛋白筛选

2.1 蛋白质组学数据分析搜索引擎

2.2 如何提高蛋白鉴定覆盖度

2.3 质谱搜库软件演示和maxquant上机实习

2.4 差异蛋白筛选方法

813日(周

上午(9:00-12:00

3.转录组实验设计和数据分析

3.1 转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究

813日(周

下午(13:30-17:30

4.蛋白质组数据分析

4.1 NCBIUNIRPOT数据库资源介绍

4.2 Gene Ontology介绍

4.3 KEGG网站介绍

4.4 蛋白质组学数据分析

814(周五)

上午(9:00-12:00

5.蛋白相互作用网络分析功能介绍和上机操作

5.1 cytoscape

5.2 pajek

5.3 STRING

814(周五)

下午(13:30-17:30

6.常用分析上机练习包括:

6.1 维恩分析

6.2 层次聚类和热图

6.3 k-means聚类

6.4 主成分分析

6.5 GO功能分析和富集分析

6.6 KEGG通路分析

6.7 DESeq

815(周六)

上午(9001200

7. 代谢组学研究方法

7.1 代谢组学实验设计及样本处理

7.2 代谢组学数据处理-多维统计分析

815(周六)

下午(13301730

8. 多组学整合分析案例介绍

9. 科研工作中的专利挖掘和专利保护

自由上机和交流

 

 



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