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2014届生物信息学暑期研习班 7月22-26日 上海

已有 2444 次阅读 2014-7-4 10:51 |个人分类:生物信息|系统分类:教学心得


尊敬的老师: 
      您好!
      上海生咨生物科技有限公司盛情邀请您参加2014届生物信息学暑期研习班。本次研习班将在2014年7月22日至7月26日在上海举办。
      本次研习班从基因组学(基因组高通量测序数据分析),转录组(RNAseq数据分析、miRNA数据分析、表达谱芯片分析)、蛋白质组(iTRAQ数据分析)、进化分析等多个方面讲解各种组学数据的分析方法。研习班将由多年从事生物信息学分析研究的科研专家和技术工程师共同授课,通过深入浅出的理论讲解和上机操作,帮助学员深入了解从基因组-转录组-蛋白质组的研究思路和数据分析方法,帮助学员拓展研究思路,掌握一些数据分析的方法。


本次研习班适合:
  1. 零生物信息学知识但想要了解生物信息学的学员;

  2. 正在或者将进行组学研究的科研人员;

  3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员;

  4. 想要将来从事生物信息学方向工作的学生或者工作人员。

主办单位:上海生咨生物科技有限公司
协办单位:上海产业技术研究院药物转化创新中心
支持单位:杭州谷禾信息技术有限公司
时       间:2014年7月22日-2014年7月26日
地       点:海荷欧风酒店,上海市闸北区共和新路1301号 
课程安排:2014年7月22日-7月26日,报到时间2014年7月21日下午14:30- 17:30。

日期

时间

课程内容

注册
7月21日 12:30 - 17:30
7月22日 8:30 - 9:30
会议注册
第一天(7月22日)
(基础知识和数据库)
9:30-11:45
生物信息学导论
13:30-16:45
Linux基础和软件安装
常用数据资源介绍(NCBI、 UCSC、UniProt等介绍)
第二天(7月23日)
(基因组测序数据分析)
9:30-16:45
基因组组装策略及方法
三代pacbio测序数据分析
基因组重测序及数据分析
微生物基因组功能注释
真菌基因组功能注释
上机操作:tablet,snpeff,velvet,BWA, samtools, annovar,GATK等
第三天(7月24日)
(转录组测序数据分析)
9:30-16:45
RNAseq数据分析
miRNA数据分析
上机操作:BWA,samtools,cufflinks等
第四天(7月25日)
(进化分析和基因芯片)
9:30-16:45
进化分析
上机操作(clustalx,MEGA, phylip, Mrbayes等)
基于表达谱芯片的临床数据分析
基因表达谱芯片数据分析及其基本处理流程
(上机操作:R分析)
第五天 (7月26日)
(蛋白质组)
9:30-16:45
蛋白质鉴定和质量控制
提高蛋白鉴定覆盖度
蛋白质搜库上机
蛋白质组数据分析(GO功能分类和富集分析通路分析,网络构建)
上机操作:DAVID, Cytoscape+ BiNGO, GSEA, CateGOrizer,Cluster+Treeview,Mev,MotifX等。
注:
1.课程具体安排以报名当天的课程表为准。
2.应需要上机练习,请携带笔记本电脑,建议配置为4G内存,10G空余硬盘空间。

联系人:
李博文 18302158776     E-mail:Proteome@126.com
 
会议通知及回执下载:2014届生物信息学暑期研习班通知 .doc      报名回执单.doc
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