许培扬博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xupeiyang 跟踪国际前沿 服务国内科研

博文

国家临床与转化医学研究中心的信息保障

已有 4093 次阅读 2012-7-18 09:03 |个人分类:转化医学|系统分类:科研笔记| 临床医学, 开业

 

   我们的研究团队做了很好的研究工作,对国外转化医学中心的研究工作和信息保障与服务调研比较清晰。这是张燕舞课题组的研究成果,我愿意推荐给大家学习参考。

转化医学(Translational Medicine),又称转化研究(Translational Research)、转化科学(Translational Science),目的是为了打破基础医学与药物研发、临床医学之间固有的屏障,在其间建立起直接关联,从实验室到病床,把基础研究获得的知识、成果快速转化为临床上的治疗新方法,同时将临床归纳出的结论或疑问等再反馈到实验室,促进基础医学研究,最终促进医学的全面发展。1992DW Choi在美国Science杂志首次提出从实验室到病床(Bench to Bedside的概念[[i]]1996年在著名医学杂志Lancet上首次出现转化医学这个新名词[[ii]],目前转化医学已成为国际医学前沿领域之一,特别是美国国立卫生研究院(NIH)前任院长Elias Zerhouni 2003年在Science上发表The NIH Roadmap[[iii]]后,更掀起了国际上对转化研究的高度重视。NIH2006年设立了临床与转化科学研究基金(Clinical and Translational Science AwardCTSA),投入大量经费,支持转化医学研究[[iv]]。我国近年来也开展关注转化医学,从2009年开始成立转化医学中心。然而转化医学是多学科的交叉融合,需要多个学科的支持和协作[[v]],与生物医学信息学也存在密切联系[[vi]]。医学图书馆及信息服务机构可以利用这个契机,积极开展面向转化医学的学科化服务,为转化医学提供多方位信息支撑。


    国外医学图书馆非常重视为转化医学提供学科化服务,开展相关实践工作,支持和研究如何更好的让专业馆员积极参与临床与转化科学研究之中,为其提供高质量的信息服务。如在美国医学图书馆协会(Medical Library AssociationMLA)20105月召开的年会中,明尼苏达大学、北卡罗来纳大学、佛罗里达大学、圣路易斯华盛顿大学、西北大学芬堡医学院、密歇根大学等高校医学图书馆均介绍了如何融入转化医学之中,特别是通过转化医学学科馆员及信息专家,为转化医学开展深层次医学信息服务[[i]] 

 

哈佛大学临床与转化科学研究中心(The Harvard Clinical and Translational Science Center)的一期计划主要由13个项目组成,其中生物医学信息学(Biomedical Informatics)项目排在首位。该项目致力于创建一个覆盖整个哈佛大学的研究网络,以使医院数据仓库之间的点对点通信更加便利,并在临床和转化研究中,对病人进行分类,对病人的信息进行利用;帮助研究人员确认并获取核心信息、专业技能与实验所需试剂,以及促进哈佛大学的跨学科合作,另外就是开发并维护哈佛催化剂的网站[[i]]

加州大学旧金山分校临床与转化科学研究中心(Clinical and Translational Science Institute, CTSI)的生物医学信息项目(Biomedical Informatics Program)主要包括两个组,其中一组帮助研究者处理大规模的数据,进行数据分析;另一组主要负责提供安全、数据与支持服务,进行学术研究[[ii]]

华盛顿大学西雅图分校转化医学研究所(Institute of Translational Health Sciences at the University of Washington)也设置了生物医学信息学中心(Biomedical Informatics Core, BMI)为科研人员提供用于处理和解释复杂数据的生物医学统计工具(包括分析人员和智能分析工具),并允许这些数据在该校网站和核心职能部门以简单明了的方式实现共享。BMI核心部门还进行生物信息数据集成研究、临床试验管理系统研发、本体和生物信息处理工具的设计等工作[[iii]]

哈佛大学和加州大学旧金山分校都建有详实的研究人员档案数据库和核心实验室数据库。同时,建立了虚拟社区workweb等形式不同的信息平台,其功能均是为临床转化研究者提供一个交流的平台,从而加强沟通,鼓励合作,促进原创思想,不断促进临床研究和转化研究的成功实施。

哈佛大学临床与转化科学研究中心网站上还提供了语义检索平台,它不同于普通的Web检索,其主要目的和特色有两个:(1)揭示哈佛催化剂的工具和数据库(Harvard Catalyst's tools & databases)的内容;(2)整合有关人员、研究成果、设施等信息,包括在某个研究领域最杰出的哈佛大学的研究人员信息、该人员在某一领域的主要研究成果以及掌握某一技术的核心实验室(A core facility with a certain technology)。此外,还建立了研究人员档案数据库(Harvard Catalyst Profiles),这是哈佛催化剂的社交网络站点,不仅可以显示研究人员的个人信息,还可以显示在一个较宽的研究团队内人与人之间的社交(如合作、咨询、被咨询)信息,主要由基本信息和社会网络组成。其中,基本信息主要是指哈佛大学教师和博士后的研究概况,包括姓名,职称,工作单位,电话号码和电子邮件地址,研究人员可以自己进行编辑,如加入自己的研究成果(publications)、奖项、履历和照片等信息。社会网络(Social Network)包括被动网络和主动网络两种。被动网络是指当研究人员共同具备某些特征时自动形成的网络,如在同一个院系、在同一座科研楼,论文中合作,或开展同一主题的研究。主动网络是指当某一研究人员登陆“研究人员档案数据库”浏览其他人员的档案时,主动将其标注为合作者、咨询者或被咨询者而形成的一种关系网。另外,还提供了核心实验室数据库(Harvard Catalyst Core Facilities Database),通过提供高度专业化的服务、设备和人员来支持哈佛大学的创新性研究,尽管相对于一般的实验室或研究机构,提供这样的支持费用非常昂贵,但哈佛催化剂强调建立核心实验室的意义是提高科学研究的效率。研究人员可通过机构名称(institution)和服务类别(service category)进行检索,也可应用关键词对整个核心实验室的信息进行搜索。每一个核心实验室都由哈佛大学临床与转化科学研究中心相应的分支机构负责、支持并管理。尽管大部分的数据可以开放获取,但是还有一些被相应的机构设置了访问权限或进行了区别定价(differentiate pricing)

加州大学旧金山分校(UCSF)临床与转化科学研究中心(CTSI)的“虚拟社区”为处于不同地理位置的研究机构和研究人员提供一个共同交流、学习、合作和制定计划的平台。通过创新性的在线服务和通信服务,它为研究人员提供了统一的标准和研究工具,以利于研究人员的交流和合作。这个基于网络的知识管理系统还为CTSI成员提供了专业的协作工具,包括临床转化研究设施、服务和资源;设备信息;专业的数据库;软件资源;研究人员信息;培训资源;实验室网站的链接;CTSI最新动态的新闻和信息;各种公告,包括公告研讨会公告、监管更新、资助机会以及一些研究人员可能感兴趣的信息。通过“虚拟社区”还可以招募研究人员、吸引合作伙伴和公布即将举行的公开讲座,同时还可以用来衡量和评价整个临床转化研究取得的进展。

加州大学CTSI运行主要依赖于“虚拟社区”这个平台。这个平台除了提供一般的信息外,如各种公告、消息。“虚拟社区”最具特色、最核心的功能主要有四个:咨询服务(Consultation Services)、研究人员档案数据库(UCSF Profiles)、核心实验室及服务数据库(UCSF Core Facilities and Services)和国际数据库(UCFS International Database)。其中咨询服务分为CTSI成员服务和社区合作者服务,而前者又分为UCSF人员服务和非UCSF人员服务。用户可以根据自己的情况进行选择。首次使用时,用户初次使用时可以获得15个小时的免费咨询服务,但局限于生物统计学、伦理学、设计和数据管理方面的咨询[[i]]。咨询服务分为生物统计学、研究设计与实施、数据管理等10个方面的服务,每个方面根据各自特点开展相应的服务。

 

 

临床医学与转化医学研究中心的信息保障.doc

 



https://wap.sciencenet.cn/blog-280034-593251.html

上一篇:国际转化医学研究发展与现状分析
下一篇:NCRR战略计划与我国转化医学发展现状研究
收藏 IP: 118.195.65.*| 热度|

1 李升伟

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-19 23:24

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部