许培扬博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xupeiyang 跟踪国际前沿 服务国内科研

博文

癌症基因组大数据分析平台GSCA

已有 1065 次阅读 2022-12-25 06:45 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记

  12月22日,国际权威学术期刊《生物信息学简报》(Briefings in Bioinformatics)在线发表了生命学院郭安源教授团队开发的癌症基因组大数据分析平台。该论文题目为《GSCA: an integrated platform for gene set cancer analysis at genomic, pharmacogenomic and immunogenomic levels》。郭安源教授及武汉科技大学曾燕教授为共同通讯作者,生命学院博士后柳纯洁、武汉科技大学胡斐斐和生命学院博士生谢贵燕为共同第一作者。

随着癌症基因组大数据的产生,准确分析和解读海量的组学数据成为新的挑战。针对这一需求,郭安源教授团队在2018年开发了多合一癌症基因集分析平台GSCALite(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/web/GSCALite/),揭示癌症基因集的表达、突变、拷贝数变异和甲基化,及其与药物敏感性和临床特征的关联性,使得没有任何编程技能的实验生物学家也可使用癌症组学大数据,极大地方便了癌症研究。GSCALite自2018年发表在《生物信息学》(Bioinformatics)杂志以来,受到了广泛的使用和引用,截至目前已累积被使用了超过50万次,被引用了454次(谷歌学术),是Web of Science高被引论文。

https://www.ebiotrade.com/newsf/2022-12/20221225063623919.htm


http://www.pubmedplus.cn/P/SearchQuickResult?wd=4717be78-e4e6-4c82-a9f4-03918cd8b607


01.20229 篇9.184%
02.202113 篇13.265%
03.202015 篇15.306%
04.201915 篇15.306%
05.20187 篇7.143%
06.201714 篇14.286%
07.20169 篇9.184%
08.20156 篇6.122%
09.20143 篇3.061%
10.20132 篇2.041%
11.20121 篇1.020%
12.20091 篇1.020%
13.20081 篇1.020%
14.20062 篇2.041%
01.methods mol biol6 篇6.122%
02.bioinformatics5 篇5.102%
03.bmc genomics4 篇4.082%
04.cancer res3 篇3.061%
05.biomed res int2 篇2.041%
06.brief bioinform2 篇2.041%
07.expert opin drug discov2 篇2.041%
08.genomics proteomics bioinformatics2 篇2.041%
09.hum genet2 篇2.041%
10.nat commun2 篇2.041%
01.美国45 篇45.918%
02.中国33 篇33.673%
03.英国17 篇17.347%
04.法国6 篇6.122%
05.芬兰6 篇6.122%
06.奥地利5 篇5.102%
07.德国4 篇4.082%
08.瑞典4 篇4.082%
09.意大利4 篇4.082%
10.澳大利亚3 篇3.061%
01.中国北京10 篇10.204%
02.中国上海8 篇8.163%
03.中国南京5 篇5.102%
04.中国杭州5 篇5.102%
05.中国深圳4 篇4.082%
06.中国成都2 篇2.041%
07.中国长春1 篇1.020%
08.中国哈尔滨1 篇1.020%
09.中国温州1 篇1.020%
10.中国赣州1 篇1.020%
01.Genomics98 篇100.000%
02.Humans91 篇92.857%
03.Neoplasms35 篇35.714%
04.Computational Biology20 篇20.408%
05.Databases, Genetic19 篇19.388%
06.Precision Medicine18 篇18.367%
07.Female17 篇17.347%
08.Software16 篇16.327%
09.Biomarkers, Tumor15 篇15.306%
10.Male14 篇14.286%




https://wap.sciencenet.cn/blog-280034-1369045.html

上一篇:心力衰竭合并肌肉萎缩
下一篇:海马小胶质细胞非对称性激活参与慢性痛和抑郁的共病
收藏 IP: 223.72.69.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-6 14:56

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部