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CCSD in SIESTA
汪海迪 2014-12-1 22:08
siesta: ============================== Begin CCSD Module ...
个人分类: SIESTA|5653 次阅读|没有评论
SIESTA 之结构优化和scf计算
汪海迪 2014-9-25 13:45
刚开始学习siesta的时候曾有过这样的疑问: siesta的计算流程也必须和VASP的“三步走”对应? 即 1 optimize structure 2 obtain charge density 3 calculate band and dos 后来发现,实际上siesta并不需要这样计算,只要要一步计算即可完成所有的计算。但是,在实际计算中,我们还是需要分成两步,之 ...
个人分类: SIESTA|7398 次阅读|没有评论
SIESTA之arch.make
汪海迪 2014-9-21 22:01
# You have to change MKL ,NetCDF and MPI path according to your Linux OS # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996- . # # ...
个人分类: SIESTA|4115 次阅读|没有评论
SIESTA输入文件自动获取程序 cell2fdf.f90
汪海迪 2014-9-21 19:39
program main !------------------------------------------------------------------------------------------- ! This program can be used to convert myfile.cell file (obtained from Material ! Studio software by runing CASTEP modules ) to myfile.fdf ! To run this program ,you have to compile a ...
个人分类: SIESTA|3488 次阅读|没有评论
siesta-NetCDF 编译
汪海迪 2014-9-21 19:26
首先是安装netCDF #--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 出现警告 /share/apps/intel/composerxe-2011.5.220/compiler/lib/intel64/libimf.so: warning: warning: feupdateenv is not implemented and will always fail NetCDF ...
个人分类: SIESTA|5095 次阅读|没有评论
SIESTA结构优化程序修改
汪海迪 2014-9-21 19:12
使用siesta做MD分子结构优化的过程中经常会遇到结构收敛不到指定力精度的问题,通过查看输出文件可以看出,在很多情况下,优化过程中体系的最大力经常会出现一个极小值,虽然这个值还没有达到我们预期的精度,但是这个结构相对原始结构已经有所改观,但是siesta程序只能给出最后的结构(不管是否收敛),所以有必要修改源 ...
个人分类: SIESTA|3397 次阅读|没有评论

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