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将单细胞转录组研究人类糖尿病患者胰岛功能障碍联系起来

已有 855 次阅读 2020-4-22 09:35 |个人分类:单细胞文献分类|系统分类:论文交流

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序号:2020-074

编者按:

结合电生理学和单细胞技术精细化研究细胞生理功能,这个技术不错,值得一看。


Patch-seq将单细胞转录组研究人类糖尿病患者胰岛功能障碍联系起来

【文献类别】技术方法-Patch-seq

【研究手段】scRAN-seq、电生理学

【技术平台】SmartSeq-2

【发表期刊】Cell Metabolism

【影响因子】 22.4

【发表时间】2020.04.13

【PMID】32302527

【文章摘要】胰岛细胞功能紊乱是人类代谢异常和疾病的主要因素之一。然而,直接将胰岛细胞的生理功能紊乱与基因表达的精确改变联系起来仍具有挑战。本文中,研究人员通过单细胞测序结合胞外分泌和通道活性(patch-seq)在单细胞水平下研究内分泌生理和转录组。研究人员收集了来自34名人类患病和未患病捐献者的1369个patch-seq胰腺细胞。通过基因网络和功能分析鉴别出一个β细胞功能异质性相关的基因集,这个基因集可以用来预测电生理学。研究人员同时报导了2型糖尿病患者的转录机制,并将该方法延申到1型糖尿病患者的冻存细胞,为了解健康和疾病人群中胰岛细胞异质性提供了有价值的资源。






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