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很多人问twinspan在R怎么实现,我把代码放这里了。
热度 5 赖江山 2016-3-17 11:33
install.packages ('devtools') devtools::install_github(zdealveindy/twinspanR) install.packages ('devtools') devtools::install_github(zdealveindy/twinspanR) library (twinspanR) library (vegan) data (danube) res - twinspan (danube$spe, modif = TRUE, clusters = ...
10988 次阅读|8 个评论 热度 5
画散点图光滑趋势线的R函数
赖江山 2016-3-5 18:13
require(graphics) plot(cars, main = lowess(cars)) lines(lowess(cars), col = 2)
9355 次阅读|没有评论
GGally包里多变量相关图
热度 1 赖江山 2015-7-2 03:58
require (GGally) hdp - read.csv ( http://www.ats.ucla.edu/stat/data/hdp.csv ) ggpairs (hdp )
5925 次阅读|1 个评论 热度 1
R里面坐标断线的做法
赖江山 2015-6-23 09:41
library(plotrix) twogrp-c(rnorm(10)+4,rnorm(10)+20) gap.barplot(twogrp,gap=c(8,16),xlab=Index,ytics=c(3,6,17,20), ylab=Group values,main=Barplot with gap) gap.barplot(twogrp,gap=c(8,16),xlab=Index,ytics=c(3,6,17,20), ylab=Group values,horiz=TRUE,main= ...
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关于R里面箱线图中去掉异常值的代码
热度 1 赖江山 2015-5-21 23:04
刚有学生问如何去掉箱线图中的 异常值(就是用点表示那些数据),然后求各组的平均值。我简单写个代码,供大家参考! 数据 pixcel.csv pixcel=read.csv(pixcel.csv,header=T) outliers=function(data1) {n=ncol(data1) cmean=vector() for (i in 1:n) { a=na.omit(data1 ) cmean =mean(a ) } box ...
25619 次阅读|2 个评论 热度 1
鉴于众多的CANOCO问题,开一个canoco 5的群377172811。
赖江山 2015-2-6 23:09
每天都能收到关于咨询CANOCO问题的邮件,为了回复的效率。特建立一个CANOCO交流QQ群,欢迎大家如果有相关问题可以加入。 群号:377172811
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计算大样地数据内不同尺度下样方-物种多度矩阵
热度 2 赖江山 2015-1-10 02:30
基于大样地数据的多元尺度分析时候,很多情况基于样方-物种多度矩阵。即以样方为行,以物种名为列,内容是物种在对应样方内多度数据。如果数据结构上CTFS的规格,我简单写了一个生成样方-物种多度矩阵的函数,供参考! 计算样方-物种多度矩阵.txt
7919 次阅读|2 个评论 热度 2
关于无重复的多次观测的数据分析程序包
赖江山 2014-12-15 05:02
生态学家经常需分析重复观测的实验或群落调查。可以使用STI程序包检验空间时间交互作用、空间、时间单独效应的显著性。 程序包这里下载: https://sites.google.com/site/miqueldecaceres/software 也可以这里下载: STI_1.0.2.zip 需要安装在R3.0之前的版本。 原理可以参考Pierre的2010 Ecology文章 09-01 ...
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沈阳生物多样性会议ppt及数据
热度 2 赖江山 2014-8-15 14:30
空间分析-赖江山.pdf 数据: NER-DATA.zip
7021 次阅读|2 个评论 热度 2
《数量生态学-R语言的应用》(赖江山 译)由高等教育出版社出版
热度 7 赖江山 2014-5-18 20:46
亚马逊购书网页 http://www.amazon.cn/%E6%95%B0%E9%87%8F%E7%94%9F%E6%80%81%E5%AD%A6-R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E7%9A%84%E5%BA%94%E7%94%A8-Daniel-Borcard-Fran-ois-Gille/dp/B00K7PWE8O/ref=sr_1_2?ie=UTF8qid=1400416872sr=8-2keywords=%E6%95%B0%E9%87%8F%E7%94%9F%E6%80%81%E5%AD%A6-R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E7 ...
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