博文
- 研究所和大学对于高引和热点文章不同的态度
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- 7月份的时候，有个朋友告诉我，我们4月份在MEE发表的文章成为 1%高引文章和0.1%的热点文章（hot paper），特别是后面这个热点文章特别不容易，是指在最近两个月内被引用次数进入世界前同领域0.1%的论文。如果在大学里面，估计得宣传一下。说来惭愧，再此之前，我对hot paper根本就没什么概念。因为在植物所 ...
- 赞一下植物生态学报投稿系统
- 差不多有十几年没有投稿《植物生态学报》了，最近投了一篇。感觉投稿系统流程图很人性化，到哪一步了一目了然，而且编辑和编委都很负责，处理很及时，圈内口碑一直很好，没有自夸意思（好像刊物跟我也没啥直接关系，也不是编委，顶多就是在同一个院子里，也谈不上自夸）。良好的信誉靠的是坚持少而精、不随波逐流的办刊理 ...
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阅读申请指南还是蛮重要的（2022年面上基金申请有感）
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- 论阅读申请指南的重要性 ——（2022年面上基金申请有感） 今年面上基金申报的题目还是延续去年没中的内容，只是题目直接改为“生态学典范分析解释变量相对重要性的研究”，去掉前面的限定词，然后根据去年的评审专家意见重新整了整。在四类问题中，还是继续选D类属性“共性导向，交叉融通”。尽管很多人认为 ...
- 消除共线性并不是我们拟合模型的目标（回答某老师的问题）
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- 赖老师好， 有个问题一直困扰自己很久，我看到现在很多文献（其中不乏子刊一类的文章）还是在用CCA分析和VIF分析来判定环境变量是否存在共线性的问题，尤其很多CCA分析的解释率其实非常低（不足30%），所以想问下您，基于这两种方法是否能获得独立的环境变量对物种分布的贡献？因为很多时候确实看单一变量的贡献率是显著 ...
- glmm.hp函数中输入的模型，一定不能带有对变量处理的运算
- glmm.hp函数输入只有一个参数mod， 需要的注意的是，mod是lme4或是nlme包给出的广义混合效应模型。glmm.hp的工作流程是从mod里面提取公式和变量，以及原始数据，然后再进一步进行共性分析。如果mod里面带有别的运算，会导致提取变量的名称出现错误，就会导致后面的错误。如下案例，比如对变量进行scale标准化, 或是转化为 ...
- rdacca.hp的文章入选ESI热点论文（前1‰）
- 根据2022年7月web of science最新发布的基本科学指标（Essential Science Indicators，简称ESI）统 计数据，我们今年发表4月份正式发表在MEE的论文(Methods in Ecology and Evolution, 2022 ,13(4): 782-788 ) 被评为“ Hot Papers （热点论文） ” 。 Wob of Science网站对“热点论文” ...
- [转载]架起生态统计学应用新“桥梁”
- https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482963.shtm 随着生态学进入大数据时代，先进的数据分析技术和生态统计模型成为整合生态大数据、发现有价值的生态学规律的重要“桥梁”。 但生态学家经常会在模型使用过程中遇到各种统计学方法的问题。例如典范分析中共线性解释变量的相对重要性评估就是其中之一。 对此， ...
- 把定性变量变为0/1数据的哑变量函数model.matrix
- 有时候，我们必须把定性的变量转为0/1数据才能进行数量分析，定性的变量转为0/1数据函数为model.matrix。 案例 library(vegan) data(dune.env) dune.env #例如把dune.env$Management定性变量变为0-1数据，那个-1表示从第一个变量名字开始，如果没有-1就变为第一项为intercept model.matrix(~dune.env$Ma ...
- 物种聚类的结果验证环境因子的差异的结果（mantel相关）
- 刚有一个学员问一个问题，就是怎么用物种聚类分析的f分组结果，来回答组间环境因子（具有定性环境因子）是否有差异？ 回答：如果环境因子全部是定量，那可以将环境因子标准化后再进行多元方差分析（Manova)。如果是含有定性环境因子，那就麻烦一点，只能拿分组结果的做样方之间的0-1数据（在同一组为1，不同组为0）的Jacc ...
