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RDA| glmm| beta多样性| rdacca.hp| 常规统计| 基金| 刊物| 转载| 水杉统计讲坛|

2022年的中国生态学大会，希望能如期举办（8月26-29日，贵阳）: 赖江山 2022-8-17 15:30; 1803 次阅读|没有评论

rdacca.hp的文章入选ESI热点论文（前1‰）: 赖江山 2022-8-11 11:25; 根据2022年7月web of science最新发布的基本科学指标（Essential Science Indicators，简称ESI）统计数据，我们今年发表4月份正式发表在MEE的论文(Methods in Ecology and Evolution, 2022 ,13(4): 782-788 ) 被评为“ Hot Papers （热点论文） ” 。 Wob of Science网站对“热点论文” ...; 个人分类: rdacca.hp|2146 次阅读|没有评论

把定性变量变为0/1数据的哑变量函数model.matrix: 赖江山 2022-7-16 15:00; 有时候，我们必须把定性的变量转为0/1数据才能进行数量分析，定性的变量转为0/1数据函数为model.matrix。案例 library(vegan) data(dune.env) dune.env #例如把dune.env$Management定性变量变为0-1数据，那个-1表示从第一个变量名字开始，如果没有-1就变为第一项为intercept model.matrix(~dune.env$Ma ...; 个人分类: 常规统计|2756 次阅读|没有评论

物种聚类的结果验证环境因子的差异的结果（mantel相关）: 赖江山 2022-7-6 22:21; 刚有一个学员问一个问题，就是怎么用物种聚类分析的f分组结果，来回答组间环境因子（具有定性环境因子）是否有差异？回答：如果环境因子全部是定量，那可以将环境因子标准化后再进行多元方差分析（Manova)。如果是含有定性环境因子，那就麻烦一点，只能拿分组结果的做样方之间的0-1数据（在同一组为1，不同组为0）的Jacc ...; 个人分类: 常规统计|2132 次阅读|没有评论

rdacca.hp包第一次被外国人的研究(Diversity and Distribution)使用: 赖江山 2022-6-17 08:19; rdacca.hp包第一次被外国人（挪威）的研究员人员使用，文章里面对HP在典范分析的英文描述值得大家借鉴，特别是这个unordered assessment of importance的作用很重要。 We used a hierarchical partitioning to estimate the importance o ...; 个人分类: rdacca.hp|2859 次阅读|没有评论

基于R语言的科学数据分析讲座（在线）通知（2022.6.20-7.1, 工作日晚7-10点，共10次）: 赖江山 2022-6-9 08:00; 基于R语言的科学数据分析讲座（在线）通知（2022.6.20-7.1, 工作日晚7-10点，共10次）培训时间►2022年6月20-7月1日，工作日晚7-10点；上课方式► 腾讯会议。培训内容 1► R语言基本操作和统计（描述统计、分布拟合、统计检验）； 2► R语言基本操作和统计（相关、方差分析、回归）； ...; 个人分类: 常规统计|2026 次阅读|没有评论

关于rdacca.hp和glmm.hp含有定量变量交互作用项的问题: 赖江山 2022-5-27 22:38; rdacca.hp和glmm.hp包分别是用来做典范对应分析和广义混合效应模型的R2层次分割的包，可以获得每个预测变量（解释变量）的分配的R2, 目前函数并不支持含星号的交互作用项。但如果用户有时候确需要加上交互作用项，也想获得交互项解释的比例也可以，对于两个定量解释变量交互项其实就是这个两个变量的乘积，因此在原始数据 ...; 个人分类: rdacca.hp|2916 次阅读|没有评论

关于rdacca.hp包如果做dbRDA的R2分解，总R2大于1，一定要在rdacca.hp函数里面参数add=T: 热度 1 赖江山 2022-5-26 17:00; 刚有个学生问：我用rdacca.hp分析环境对beta多样性解释度时（dbRDA)，得出来的总解释度为1.5多？这样肯定不对，这是在做PcoA的过程产生负的特征根导致的。这种情况，可以在rdacca.hp函数里面设置add=T，即校正负的特征根即可。刚才案例加上add=T,总R2立马变为0.71; 个人分类: rdacca.hp|2769 次阅读|2 个评论热度 1

Mantel相关和典范相关的区别: 赖江山 2022-4-24 23:12; 在生态学上，如果要研究两个矩阵（比如植物群落和微生物群落，或是群落与环境因子，以及两组不同类别环境因子之间）的相关性，通常由两种分析方案：mantel 相关和典范相关 (canonical correlation)。但这两种方法的算法有本质的区别，所回答的问题也不一样，下面简单阐述一下这两种方法的差异。 1. &nb ...; 个人分类: 常规统计|4840 次阅读|没有评论

如何判断简单回归的斜率是否有显著差异？: 赖江山 2022-4-23 21:38; 刚有人问，想检验这几条线的斜率是否有显著差异，该用什么方法呀？回答：如果检验两两之间是否有显著差异，可以用直接用diffslope函数 library(simba) diffslope(x1,y1,x2,y2) 上面这个相当于做单因素方差分析后的多重比较，但如果要直接回答全局是否有显著差异，可以将所有点混在一起，然后做分组 ...; 个人分类: 常规统计|5185 次阅读|没有评论

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