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请安装最新版glmm.hp(0.0-9),将lm,glm的R2分解纳入glmm.hp,基本涵盖了整套线性回归

已有 2373 次阅读 2023-4-13 08:14 |个人分类:glmm|系统分类:科研笔记

glmm.hp包在0.0-7版本之前,glmm.hp函数输入对象为lme4、nlme和glmmTMB包得到的GLMM模型,最近,我又把lm和glm也纳入glmm.hp。之前没有纳入lm和glm是因为rdacca.hp可以做lm的分解,而glm则是有常用的hier.part包可以分解。现在glmm.hp可以直接分解lm和glm了,且比hier.part和rdacca.hp输入对象更简单,直接可以是模型对象即可,而不是响应变量和解释变量要分别输入,但有个要求是原来lm或glm模型里面是必须带有data的公式表达式,否则glmm.hp就无法从模型对象中提取data,无法data就无法基于各种亚模型进行分解。

我们以R自带mtcars数据作为案例进行glmm.hp分解lm和glm的演示。lm默认是分解校正R2,glm是没有R2,或者说R2的版本很多,我们用的是MuMIn包里面r.squaredGLMM函数获得的R2
lm的案例

屏幕截图 2023-04-12 213244.png

glm的案例(R2版本太多,选个高的即可)

屏幕截图 2023-04-12 213423.png

顺便做个各种模型使用我开发的包的总结,实现基本模型全覆盖了:

glmm.hp的文章已经在Journal of Plant Ecology2022年最后一期上正式发表,请各位及时重新安装,(install.packages("glmm.hp"))即可。另外,请各位使用glmm.hp的用户在文章中务必使用如下的引用:Jiangshan Lai, Yi Zou, Shuang Zhang, Xiaoguang Zhang,Lingfeng Mao(2022). glmm.hp: an R package for computing individual effect of predictors in generalized linear mixed models. Journal of Plant Ecology,15(6):1302-1307image.png

glmm.hp的文章已经在Journal of Plant Ecology2022年最后一期上正式发表,请各位及时重新安装,(install.packages("glmm.hp"))即可。另外,请各位使用glmm.hp的用户在文章中务必使用如下的引用:Jiangshan Lai, Yi Zou, Shuang Zhang, Xiaoguang Zhang,Lingfeng Mao(2022). glmm.hp: an R package for computing individual effect of predictors in generalized linear mixed models. Journal of Plant Ecology,15(6):1302-1307



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