序列比对相关文件

张洪磊 2016-10-20 10:52

ENSEMBL: les marked with .dna.primary.assembly, such as: ftp://ftp.ensembl.org/ pub/release-77/fasta/homo_sapiens/dna/Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assembly. fa.gz  NCBI: no alternative - analysis set: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/ Eukaryotes/vertebrates_mammals ...

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标准测序样本数据

张洪磊 2016-10-13 21:53

http://www.illumina.com/platinumgenomes/

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methylation ratio

张洪磊 2016-7-28 10:18

#!/usr/bin/Rscript load(/home/zhanghl/workshop/paper1/methylation/anno/fullannotInd.rda) # fullannot # colnames rownames # TSS1500Ind # TSS1500Ind$SID names(TSS1500Ind$SID) TSS1500Ind$SID ] TSS1500Ind$SID ] # TSS200Ind # UTR5Ind ...

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