A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution

摘要

We report the first annotated chromosome-level reference genome assembly for pea, Gregor Mendel’s original genetic model. 

在此我们报道孟德尔遗传理论的原始模式生物-豌豆的第一个组装到染色体层面的注释基因组。

Phylogenetics and paleogenomics show genomic rearrangements across legumes and suggest a major role for repetitive elements in pea genome evolution. 

系统发育学和古基因组学显示，豆科植物的基因组经历了重组事件，其中重复片段起到了主要作用。

Compared to other sequenced Leguminosae genomes, the pea genome shows intense gene dynamics, most likely associated with genome size expansion when the Fabeae diverged from its sister tribes. 

与其他已有的豆科基因组相比，豌豆基因组内的基因动态更强，这很可能是因为野豌豆族（Fabeae)在与它的姐妹族们分道扬镳时基因组扩大了。

During Pisum evolution, translocation and transposition differentially occurred across lineages. 

在豌豆属（Pisum）的进化过程中，染色体的易位和移位在不同谱系中发生的频率和位置不同。

This reference sequence will accelerate our understanding of the molecular basis of agronomically important traits and support crop improvement.

有了参考基因组之后，我们能更快的揭开豌豆身上具有重要经济价值的特征的分子机制，从而帮助我们改良新的品种。

与其他已有豆科基因组（苜蓿，大豆，光叶百脉根）相比，豌豆基因组很大（这次装了3.92G, C值估计是4.45G），工作辛苦。基因组文章发NG可能是因为各个染色体还原的好，能做出很多染色体尺度上的比较基因组学分析（易位、移位等）。