博文
- 我重新下载了R语言，我首先要安装的软件包
- 经常用到的包： 1，tidyverse tidyverse. 是一个经常使用包的集合，包含 ggplot2(数据可视化), dplyr（数据处理）, tidyr（数据清洗）, readr（数据导入）等，具体可见： 2，data.table 读取数据比较快，fread函数比较智能，能够自动识别分隔符和有无表头 3，shiny 可以构建可视化的交互界面 ...
- 怎么快速学习GWAS？
- https://www.researchgate.net/post/What_is_the_fastest_way_to_learn_how_to_perform_GWAS_Association_mapping_in_plants_using_GAPIT_an_R_package_What_are_the_available_resources2 What is the fastest way to learn how to perform GWAS (Association mapping) in plants, using GAPIT (an R package )? W ...
- GWAS分析中表型值是使用BLUE值还是BLUP值？
- GWAS分析中表型值是使用BLUE值还是BLUP值？ https://www.researchgate.net/post/Does_any_one_have_an_idea_of_which_one_BLUE_or_BLUP_to_use_for_a_GWAS_analysis_of_a_trait_in_wheat_eg_resistance_to_rust 问题 Does any one have an idea of which one, BLUE or BLUP, to use for a GWAS analysis of a tra ...
- 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值
- 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction， 简称BLUP)，又音译为“布拉普” ，是统计学上用于线性混合模型对随机效应进行预测的一种方法。最佳线性无偏预测由C.R. Henderson提出。随机效应的最佳线性无偏预测（BLUP）等同于固定效应的最佳线性无偏估计（best linear unbiased ...
- 如何计算遗传相关（How to）
- Q1 植物或林木育种中，我的数据类型包括基因型（品种），地点（环境），重复（或者无重复），还有一系列性状，比如株高、产量等等，我怎么计算性状间的遗传相关，并且给出显著性？ 示例数据 数据描述：location为地点，Genotype为基因型，Rep为重复，DWKPlant, DWKEar, TW, KDM, ...
- R bug
- 本来R语言这个函数，t（）是转置函数，但是不知道是不是改了默认，结果不是默认的转置。 1，建立一个a矩阵 2，转置t（）函数，结果发现错误 3，用base包里的t（）函数，结果正确 解决方法：R重启。
- putty不能登录本地电脑里面的虚拟机ubuntu-解决方法
- 1，主要是ubuntu没有开通sshd服务，安装即可。 Ubuntu 下安装 OpenSSH Server 是无比轻松的一件事情，需要的命令只有一条： sudo apt-get install openssh-server 2，然后再putty中输入ip和port，即可以登录。 特此记录
- 如何根据系谱计算共祖系数和近交系数以及亲缘关系系数
- 《线性模型在动物育种值预测中的应用》 第二章：亲属间的遗传协方差，P19 概念定义 共祖系数： 共祖系数为概率fAB，表示一个来自个体A，另一个来自个体B的两个同源基因（或等位基因）在系谱上是一致或相同的概率，也就是说来自同一祖先基因的概率， 相关系数： 是2倍的共祖系数 近交系数： 近交系数（inbre ...
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