博文
- 2-数量遗传学课程介绍
- 1, 课程的目的 http://animalbiosciences.uoguelph.ca/~lrs/ABModels/NOTES/INTRO.pdf 这个课程的主要目的, 是使用线性模型分析畜牧育种数据的遗传评估 2, 课程的结构 这个课程比较简单, 主要是介绍数量遗传的骨架, 相关的问题以及解决方法会通过示例和代码的形式予以展示, 代码使用的是R语言. 课后还有一些联系, ...
- 为什么要学习数量遗传学--序言
- ## 自序 昨天公司以张沅老师编写的《家畜育种学》为教材，从老总到销售讲解了各自学习的心得体会，以及各种知识点，我想这应该是扎根产业最鲜明的决心了。理解客户，然后服务客户。 这个自序我想从两句名言开始： 1， 学然后知不足，教然后知困 原文是： 《礼记·学记》原文： 虽有嘉肴，弗食，不知其旨也；虽有至 ...
- 育种中一般配合力和特殊配合力的计算方法
- 研究生期间，学习数量遗传学时，对配合力的概念感到很神奇，曾经和同学讨论过，按道理说曹操的一般配合力很高，几个孩子都很出色。 那么问题来了，什么是一般配合力？一般配合力就是可以稳定遗传的因素，即曹操和不同女性生育的孩子，都很出色，这表明这种出色不因为不同女性的差异而变化，说明这种出色是遗传自父亲， ...
- DMU软件 语法高亮 vim设置--学习笔记6
- 用vim编程时, DMU的关键词没有语法高亮, 看着不舒服, 就进行一下设置, 并记录过程. 设置的效果如下 设置流程 本次设置的比较简单, 将关键词分为: 模型model, 比如DMU1, DMU2… 不同组成part, 比如DATA, VARIATE, MODEL… 不同结构类型type, 比如PED, COR…. 新建DIR.vim文件, 里面设置相关 ...
- DMU-单性状动物模型-母体效应--学习笔记5
- 单性状动物模型-母体效应 本次主要是演示如何使用DMU分析单性状动物模型-母体效应. 数据使用learnasreml包中的数据 learnasreml是我编写的辅助学习asreml的R包, 里面有相关的数据和代码, 这里我们用其中的animalmodel.dat和animalmodel.ped的数据. 如果没有软件包, 首先安装: setwd(d:/dmu-test/) library ...
- DMU-多性状动物模型-学习笔记4
- 多性状动物模型 本次主要是演示如何使用DMU分析多性状动物模型. 数据使用learnasreml包中的数据 learnasreml是我编写的辅助学习asreml的R包, 里面有相关的数据和代码, 这里我们用其中的animalmodel.dat和animalmodel.ped的数据. 如果没有软件包, 首先安装: setwd(d:/dmu-test/) library(devtools) # inst ...
- DMU-单性状重复力模型-学习笔记3
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- 单性状重复力模型 本次主要是演示如何使用DMU分析单性状重复力模型. 重复力模型和动物模型的区别: 不是所有的性状都可以分析重复力模型, 首先重复力模型是动物模型的拓展, 它适合一个个体多个观测值的情况. 比如猪的产仔数, 一个母猪有多个胎次 比如鸡的产蛋, 不同时间段, 鸡都有产蛋量 牛的产奶量, 不同的测 ...
- Python学生物统计-数据可视化-学习笔记5
- 5.1 作图的重要性 在分析一个数据之前, 我们首先要对数据进行检查, 在统计上看一下汇总统计, 比如最大值, 最小值, 中位数, 平均值, 方差, 标准差, 变异系数等等. 直方图, 看一下数据的分布情况 箱线图, 看一下数据的分布, 有无异常值 所谓一图胜千言. python中的作图工具 plot.ly bokeh是交互式的包 ...
- DMU-个体动物模型-学习笔记2
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- 单性状动物模型 本次主要是演示如何使用DMU分析单性状动物模型. 数据使用learnasreml包中的数据 learnasreml是我编写的辅助学习asreml的R包, 里面有相关的数据和代码, 这里我们用其中的animalmodel.dat和animalmodel.ped的数据. 如果没有软件包, 首先安装: library(devtools) install_github(dengfei2013/learn ...
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