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关于SNP在染色体上的分布图怎么做

已有 9685 次阅读 2017-3-10 08:58 |个人分类:便捷操作|系统分类:科研笔记

经典图


当然这个图,代码比较复杂,今天来看另一个图

染色体图


这个图的数据是三列,snp | chr | Location,数据很简单,但是如果我没有发现这个包,那么实现的过程很麻烦。

OK,上代码
install.packages("synbreed")
library(synbreed)
library(synbreedData)
data(maize)
map <- maize$map
## look the format of the data
head(map)
# chr   pos
# M1   1  1.02
# M2   1  4.13
# M3   1  4.73
# M4   1 10.37
# M5   1 11.70
# M6   1 13.97
plot(map)

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