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物种内circos图的绘制
苏威 2020-9-10 19:56
分析内容及数据准备(以油菜为例) 1. 基因组共线性分析:数据包括 zs11.all.v0.cds (油菜基因组cds文件), zs11.v0.gff3 (油菜基因组注释文件),所有工具为python版的MCscan( JCVI包 )。 2. Circos图绘制:数据包括染色体核型文件karyotype.txt,需要突出展示genepair文件link.txt,染色体共线性区间文件genome.block ...
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conda安装本地格式为zip包
苏威 2020-5-3 18:19
最近在台式机上安装了windows版本下的Miniconda,遇到了一个问题,如何安装本地的zip格式的包。 从PyPI上下载的包格式为:.zip 第一步:列出虚拟环境 condainfo--envs 第二步:切换到包所在目录 cd路径 第三步:安装包 解压缩包,里面有一个setup.py文件 pythonsetup.py&nbs ...
个人分类: python|6308 次阅读|没有评论
pip批量卸载Python安装包
苏威 2020-4-30 13:33
第一步: 桌面按Shift并右击鼠标,打开命名行模式,输入 c:\Users\asuwei\Desktoppipfreezepackages.txt 这将会创建一个 packages.txt文件,其中包含了当前环境中所有包及各自的版本的简单列表(即pip list 所列出的包列表) 第二步: packages.txt内容显示如下: DateTime==4.3 ...
个人分类: python|3056 次阅读|没有评论

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