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数据整理中怎样去掉各组的异常值?
热度 1 张金龙 2019-2-21 10:18
假设500人中有男女若干,现要比较饭前(before)和饭后(after)某生理指标的变化。由于数据誊写错误,测量指标中出现了一些异常值(outlier)。 问,如果 按照性别以及饭前饭后分组, 怎样去掉各组内的异常值? 思路:先定义识别和转换异常值的函数, 将一个向量中的异常值转换为NA。 再用dplyr程序包将该函数应用于各组数据。 ...
个人分类: 统计分析|10744 次阅读|3 个评论 热度 1
过年
热度 1 张金龙 2019-2-11 20:23
中国人最看重的,就是过年。纵然是离家万里之遥的游子,也都想着回家过年,想着和一家人吃团圆饭。一年的酸甜苦辣,喜怒哀乐,就在这年夜饭里。不过老家宝坻没有吃年夜饭的习俗,过年这天最丰盛的一顿饭是在中午。除夕夜,宝坻俗称“五月黑下”,吃的是素饺子,全家一起守岁。 很多民间习俗的由来很难知晓,也渐渐消失 ...
个人分类: 生活点滴|3586 次阅读|1 个评论 热度 1
群落系统发育分析常见问题合集
热度 5 张金龙 2019-1-6 16:16
PDF: 群落系统发育常见问题合集 张金龙.pdf R Markdown 源代码 https://github.com/helixcn/comphylo_faq 入门 群落系统发育入门资料 提问 : 能不能介绍些phylogenetic方面的入门资料及其在生态学方面的应用呢? 回复 : 系统发育分析入门最好的教材,我觉得是 The phylogenetic h ...
个人分类: 科研笔记|57018 次阅读|7 个评论 热度 5
那些生态学可能会用到的工具软件
张金龙 2018-12-30 14:14
本文列出部分工具软件,涵盖论文写作、 排版、图片编辑、编程、文件管理、数据整理等方面,以开源软件为主,供感兴趣的老师同学参考。 文献检索 SciHub https://sci-hub.tw/ 其实本来是个网站,可根据文档的DOI获取 PDF 全文。不过由于该网站经常不能访问,国内有高手开发了单机版,所以这里列出来: ...
个人分类: 软件介绍|12481 次阅读|没有评论
从基因组到物种的时空变化:2018生物多样性大数据青年论坛见闻
热度 1 张金龙 2018-12-20 22:09
12月18、19日两天,深圳国家基因库举办了“2018生物多样性大数据青年论坛”。我本人有幸作为报告人,参加了此次论坛。 会议规模很小,共16个报告。据召集人杨拓博士说,这是考虑到小型会议更有利于参会者交流。国内从事生物多样性大数据处理的专家很多,但这次邀请的大多数报告人是博士毕业几年内的青年科学家,他们大 ...
个人分类: 随笔|8121 次阅读|3 个评论 热度 1
黑龙江畔的森林
张金龙 2018-10-26 10:37
黑龙江畔的森林 --收到王洪峰博士赠书有感 题记:22日晚,收到东北林业大学王洪峰博士的著作《东北主要森林植物及其解剖图谱》,非常感动。回想多年前在黑龙江哈尔滨、尚志帽儿山、平山、七台河桃山、勃利县西大圈、庆安、伊春凉水、五营、牡丹江镜泊湖等地拍照片、采标本,不由得想起那时候的人和事。时 ...
个人分类: 潮俊的诗|3147 次阅读|没有评论

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