用herblabel程序包打印不同风格的植物标本标签

张金龙 2016-11-15 21:12

关于herblabel程序包的介绍， 请参考 http://www.biodiversity-science.net/CN/abstract/abstract10290.shtml herblabel程序包输出不同的标签样式, 目前支持四种 KUN, PE, KFBG以及HU, 效果如下 herblabel程序包的安装 install.packages(herblabel, repos=http://R-Forge.R-project.org) ...

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Rmarkdown与R的动态统计报告 (2019-02-19)

张金龙 2016-9-21 14:49

R的Sweave函数是用来生成动态统计报告的函数：如果将R代码包括在统计结果的Latex源代码中，用Sweave处理后， 就可以生成包含相应代码以及统计结果的统计报告， 十分方便。不过Latex的各种标记比较零碎，除非经常使用，否则各种标记很容易忘记。此外用Sweave通过Latex源代码编译非英文的文档极容易出错， 又很难解决， 同时 ...

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生态学和进化的重要链接EcoEvoLinks

热度 1 张金龙 2016-6-7 00:44

网址 https://github.com/helixcn/EcoEvoLinks Journals Research Groups/Network Macroecology and Biogeography Biodiversity and Global Change Lab Phylogenetic Comparative Methods ans Evolutionary Ecology Biodiversity and the determinants Theoretical Ecology Funct ...

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R系统发育比较分析快速参考V1.0.1

热度 2 张金龙 2016-5-30 01:03

R语言系统发育比较分析快速参考V1.0.1 R_phylogenetics_Reference.zip Latex 源代码和PDF最新版本参见 https://github.com/helixcn/R_phylo_refcard

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那一刻之后 汶川大地震八周年祭

张金龙 2016-5-12 08:45

《那一刻之后》 -- 汶川大地震八周年祭 八年了， 这世界有了多少改变？ 多少生命定格在那一刻？ 那一刻之后， 我们关注， 我们哭泣， 我们倾自己的能力去挽救。 那一刻之后， 大地揭开了多少善与恶？ 大地的伤痕， 把最纯粹的展示给你。 那之后不久， 大地再次愈合， 而人心却难以 ...

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《R编程与进化分析》幻灯片（2016年5月9日 北京）

热度 2 张金龙 2016-5-8 00:52

受中国科学院植物研究所赖江山博士邀请， 本人于2016年5月9日在北京昌平讲解《R编程与进化分析》。 幻灯片如下 PCM_00.pdf PCM_01.pdf PCM_02.pdf PCM_03.pdf 主要内容 R开发平台的搭建 R脚本 R的编程习惯 编写R函数 程序包的结构 S3与S4 Methods 程序包的安装和检查 结合Rcpp编写程序包 从gith ...

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个人简历的Latex模板

热度 1 张金龙 2016-4-21 00:19

用Latex制作的简历 风格 清爽 。 这里给出本人中文简历的源代码。 请将 代码拷贝到纯文本文件中，并用UTF8 编码。 在Linux Mint下， 完整安装TexLive， 以及TexWorks， 通过TexWorks界面的pdflatex编译为pdf。 也可以在Windows 下的 Miktex所提供的TexWorks下编译为pdf。 编译时需要在文件夹中包含 resum ...

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在R中绘制进化树：ggtree学习笔记

热度 1 张金龙 2016-4-10 23:21

在R中绘制进化树：ggtree学习笔记 ggtree （https://guangchuangyu.github.io/software/ggtree/）是香港大学余光创博士编写的R程序包。ggtree是ggplot2程序包的扩展 (http://www.ggplot2-exts.org/)，能够像ggplot2一样，用图层化的语法绘制进化树。这与APE用参数控制绘图明显不同。与ggplot2一样，在ggtree中，通过不 ...

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