张金龙的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/zjlcas 物种适应性、分布与进化

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CRAN Task View: 在R进行系统发育比较分析翻译
2010-10-10 23:33
CRAN Task Views: 在 R 进行系统发育比较分析 进化历史是随着系统发育相关的方法而被逐步揭开的。系统发育比较方法是对物种历史(性状变化、分布区变化和适应性变化等)在进化树上进行的统计分析。这一领域正经历着快速的发展,大量新的研究方法被提出。 祖先状态重建 在 ape 程序 ...
个人分类: 科研笔记|10939 次阅读|没有评论
已知经纬度计算两点间地理距离
热度 5 2010-9-21 14:52
更新日期 20190506 1 问题 已知巴黎的地理坐标为东经2°20'14'',北纬48°50'11'',华盛顿的地理坐标为西经 77°03'56'',北纬 38°55'17'',求两城间的距离(单位千米)。 2 分析: 已知经纬度,求两点间的地理距离,不能直接用经纬度求平面距离, ...
个人分类: 科研笔记|29622 次阅读|19 个评论 热度 5
如何计算两日期相差的天数?
2010-9-21 11:05
如何计算两日期相差天数? 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 今天讲的日期是公历日期,农历日期由于涉及到朔望月等较为高深的内容,暂时已经超出了本人的能力范围,故先不探讨。 现行的公历随月份及年份天数不同,如何计算两个日期之间相隔多少天? 这里,介绍一种天文上常用的儒略日,并介绍儒略日与公历的 ...
个人分类: 科研笔记|10417 次阅读|没有评论
NotePad++:记事本的替代程序
2010-9-18 16:13
Notepad++是开源的文本程序,是用C++编写的。目前只能在Windows上运行。NotePad++是小巧的编辑器,最新版本5.7.1的安装文件仅为3.88M.但是其功能确是十分强大的,占用系统资源很低而运行速度很快。 这个软件的特点,这里简要介绍一下: 首先,NotePad++支持几十种编程语言的高亮显示,如著名的C,C++,C#,Fortr ...
个人分类: 科研笔记|10171 次阅读|5 个评论
R语言:行星运行轨迹的绘制
2010-9-9 13:12
潮俊 前一篇文章中介绍了如何用R绘制行星的周年视运动,这一则介绍如何绘制行星在一段时间的运行轨迹。我对R的moonsun 程序包(参见 http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/web/packages/moonsun/index.html ) 进行了修改,增加了一个track函数,以绘制任意一段时间内的行星在星空背景上的运行轨迹。 废话少说,先上几 ...
个人分类: 科研笔记|10149 次阅读|4 个评论
skyatlas:用R绘制星图和行星的周年视运动
2010-9-6 00:05
skyatlas:用R绘制星图和行星的周年视运动 潮 俊 在一些天文期刊上经常看到赤道坐标星图,不但给出了某一个时刻太阳、月亮的位置,还给出了大行星在一年中相对于星空背景的运行轨迹。今天我们就用R软件绘制这样的星图。 当然,为了绘制星图,我们需要知道恒星的位置和亮度。这就需要引入天文 ...
个人分类: 科研笔记|7648 次阅读|没有评论
计算生态位宽度与生态位重叠的R程序
2010-8-9 01:18
生态位理论是解释生物多样性格局和物种共存的重要理论之一。每个物种对生境的偏好,就确定了其生态位。从1910年至1980年以前,国外生态学家对物种生态位的计算等生态位的宽度和计算进行了大量研究,主要的计算方法都是那时候提出的。从上世纪80年代到现在,我国的生态学界仍然能见到一些计算物种生态位宽度和生态位重叠的 ...
个人分类: 科研笔记|20062 次阅读|2 个评论
怎样运行Lagrange软件
热度 3 2010-8-3 14:32
注意! 运行Lagrange软件的指南随后贴出,现在的版本仅供参考。 How to run Lagrange in Windows XP "Lagrange is a Python package implementing likelihood models for geographic range evolution on phylogenetic trees, with methods for inferring rates of ...
个人分类: 科研笔记|7255 次阅读|5 个评论 热度 3
从DNA序列预测RFLP—seqRFLP软件包简介
2010-7-3 15:24
从 DNA 序列预测 RFLP 和 TRFLP seq R FLP 软件包简介 丁琼 张金龙 中国科学院植物研究所 1. seq R FLP 简介 RFLP 和 TRFLP 等技术在生物多样性研究中十分广泛。随着测序技术的日趋普及,在进行 RFLP 或 TRFLP 之前,用户很可能已经获得了 DNA 序 ...
个人分类: 未分类|6851 次阅读|1 个评论

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