张金龙的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/zjlcas 物种适应性、分布与进化

博文

按标题搜索
用RAxML构建极大似然进化树
热度 1 2010-3-24 21:28
用 RAxML 构建极大似然进化树 RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一,可以处理超大规模的序列数据,包括上千至上万个物种,几百至上万个已经比对好的碱基序列。作者是德国慕尼黑大学的 A. Stamatak 博士。 性能在一定程度上超越了PHYML,GARLI等著名软件,由于算法的优势, ...
个人分类: 科研笔记|18329 次阅读|2 个评论 热度 1
R语言入门幻灯片
热度 3 2010-3-24 20:38
R语言入门 R语言在自然科学和社会科学的统计和绘图领域正发挥着越来越重要的作用,但由于其需要输入命令,让很多读者望而生畏,其实R语言本身并没有看起来复杂,只要想清楚自己究竟要做什么,你会发现,用R实现十分简洁而清晰。 R ...
个人分类: 科研笔记|14934 次阅读|6 个评论 热度 3
进化时间的估算:r8s软件使用指南
热度 2 2010-3-24 20:15
本文所附PDF文件中在Windows编译r8s部分已经过时,请参考博文: 《 怎样在Windows10系统中编译和运行r8s 》 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1144730.html r8s是美国加利福尼亚大学戴维斯分校的进化生物学家Mike Sanderson编写的用于估算进化树分化时间的软件,在进化生物学、分子生物地理 ...
个人分类: 科研笔记|15514 次阅读|3 个评论 热度 2
在windows中创建R程序包简明指南(2016年8月15日修订)
热度 4 2009-8-5 16:18
在 Windows 下创建 R 程序包简明指南 ( 2016 年 8 月 15 日修订) 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com R 软件中 CRAN 镜像已经有 8957 个程序包在线发表(截至 2016 年 8 月 15 日),几乎涉及统计编程的所有领域。 CRAN 上每个程序包都包含源代码以及编译好的 Windo ...
个人分类: 科研笔记|21599 次阅读|16 个评论 热度 4

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2022-6-28 08:59

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部