生态位理论是解释生物多样性格局和物种共存的重要理论之一。每个物种对生境的偏好，就确定了其生态位。从1910年至1980年以前，国外生态学家对物种生态位的计算等生态位的宽度和计算进行了大量研究，主要的计算方法都是那时候提出的。从上世纪80年代到现在，我国的生态学界仍然能见到一些计算物种生态位宽度和生态位重叠的论文。

张金屯老师的《数量生态学》更是对生态位和生态位重叠的计量方法进行了详细介绍。

为了方便的完成这些指数的计算，本人粗略编写了一些R程序，完成相应指数的计算.还增加了Bootstrap检验，从而获得生态位重叠的置信区间估计。

输入数据的格式是标准的群落物种矩阵格式。即每一行代表每一个样方，每一列代表每一个物种。

下面就是相应的R程序，可供下载。

 由于当前代买还存在很多冗余，欢迎各位同行提出宝贵意见。以便修订之后整合到进行种间关联度分析的spaa 程序包中。

 

有任何意见或建议，均可发邮件至 jinlongzhang01@gmail.com 来信必复。

种间关联度及生态位重叠的R程序包

转载本文请联系原作者获取授权，同时请注明本文来自张金龙科学网博客。
链接地址：https://wap.sciencenet.cn/blog-255662-351195.html

上一篇：怎样运行Lagrange软件
下一篇：skyatlas:用R绘制星图和行星的周年视运动