作者：小强

这篇教程继续和大家分享Materials Studio和CSD联用。同时将实验粉末X射线光谱与CSD中收录的包含实验结构化学名称的化合物自动生成的光谱进行比较。下面开始教程。

建立一个新的“Project”。打开“New Project”对话框，输入“crystal_ID”作为项目名，单击“OK”按钮。

搜索ConQuest数据库。

载入实验谱图。在“Project Explorer”中单击“crystal_ID”项目根目录。选择“File | Import...”从菜单栏打开“Import Document”对话框。选择“Examples/reflection/Experimental Data”，从文件类型下拉列表中选择“Chart Files”作为文件名。选择“indigo_1.3cam”并单击“Open”按钮。

从菜单栏选择“Modules | Reflex | Pattern Processing”，打开“Reflex Pattern Processing”对话框。在“Pattern Preparation”选项卡上，将“Number of iterations”更改为300。单击“Calculate”按钮，然后单击“Subtract”按钮。创建了一个名为“indigo_1(Background Removed).xsd”。放大到10.5处的第一个峰值，并确定FWHM大约为0.4。

从菜单栏中选择“Modules | CCDC | ConQuest Search”以打开“ConQuest Search”对话框。在“Setup”选项卡上，将“Task”更改为“Chemical name search”，并输入“indigo”作为“Chemical name”。单击“Search”按钮并关闭对话框。

将实验粉末X射线衍射图与CSD中可用的结构进行比较

确保“indigo.std”是活动文档，请选择标记为“Structures”的列。单击“QSAR Models”工具栏上的“Models”按钮。双击“Figure of merit(Powder Comparison)”行以编辑此模型的输入文件。

在“Model Editor - Powder Comparison”对话框中，选择“Inputs”选项卡，并将“Experimental data”的“Value”列更改为“indigo_1(Background Removed).xcd”。将“Max.2-Theta”更改为80，并将“Profile FWHM U”和“Profile FWHM V”更改为0。将“Profile FWHM W”设置为0.16。

将“Profile NA”和“Profile NB”更改为0。单击“Save”按钮并关闭此对话框。单击“Run”按钮并关闭“Model Editor”对话框。

确保“indigo.std”是活动文档，请选择标记为“Rwp(Powder Comparison) ”的列，然后单击“Study Table Viewer”工具栏上的“Sort Ascending”按钮。

在的“Structure”列中双击“indigo.std(INDIGO02)”打开“Detail View”。从菜单栏中选择“Modules | Reflection | Powder Refinement”，打开“Reflection”粉末精炼对话框。在“Setup”选项卡上，将“Range”部分中的“2-Theta Max”更改为80。

在“Exp.Data”选项卡上，选择“Document”列中“indigo_1.xcd”和“Pattern”列中具有1的行。

在“Pattern”选项卡上，选中“Refine”列中的所有框。在“Lattice”选项卡上，选中“Refine”区域中的所有复选框。在“Display”选项卡上，选中“Display simulation/experiment difference”复选框，然后单击“Refine”按钮。关闭“Reflex Powder Refinement”对话框。

Rwp应在9和12之间。可以通过包括不对称校正和/或晶体尺寸效应来进一步降低Rwp。但是需要通过Rwp值来确定实验结构确实是数据库中收录的晶体结构。

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