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IP: 114.251.216.*   [11]chenye54007   2016-4-1 20:38
龚老师您好,请问一下,你加载的文件“chrome”里面的内容是怎么样的啊?我最近刚好要学习这个,麻烦老师了
IP: 61.190.88.*   [10]陆泽橼   2014-9-24 13:40
龚老师您好,期待有机会到您那边访学!
IP: 123.135.121.*   [9]chunxiage   2014-5-7 11:27
龚老师,
你好,我是刚开始学习SNP-calling的工作,参照您的方法使用GATK和SAMtools进行SNP-calling,遇到问题,我进行到第6.1,$ samtools mpileup -DSugf genome.fasta sample.realn.bam | \  bcftools view -Ncvg - > sample.samtools.raw1.vcf,我得的结果没有出现sample01.samtools.raw.vcf.dix这个文件。
接着做6.2时就出现了错误:##### ERROR MESSAGE: Your input file has a malformed header: Count < 0 for fixed size VCF header field PL。
您能帮忙看看是什么原因造成的,怎么解决吗?
非常感谢您百忙之中的帮忙
IP: 67.249.198.*   [8]gaoshannankai   2014-5-6 07:03
兄弟,我刚写了一本书,r语言与bioconductor生物信息学应用。你是否加入我的合作群,一起搞点项目
IP: 202.112.90.*   [7]王东   2014-3-14 19:20
你好,看了您整理的ggplot2的帖子,非常详细,不过我目前有个关于gggplot2的 的问题希望您能帮我看一下 感激不尽
IP: 124.205.76.*   [6]xinjiesun   2013-11-19 23:10
您好 我是一名研二的学生
最近在做RNAseq分析 老遇到一个问题是 cuffdiff分析出来的文件夹里CDS ,tss打头的文件是空的 最开始以为是由于fa基因组在UCSC上下载的和gtf在ensembl上下载的不兼容,后来改过来之后还是一样的情况 请问下您知道这是咋回事吗?谢谢
IP: 132.236.156.*   [5]gaoshannankai   2013-9-24 02:08
龚老师,您好,我是高山,很高兴认识您
看了您的博文,特别是基因组的,言简意赅,一看就是高手,
我下月底回天津大学任教,准备搞个高通量数据分析平台,
手头有几个项目,如果有兴趣可进一步合作。
我组建了国内最专业的生物信息群,qq 154712987
IP: 139.52.147.*   [4]龚云国   2013-9-21 05:09
愿此博客能帮助更多的人!
IP: 139.52.147.*   [2]龚云国   2013-8-24 01:12
在科学面前,我永远是菜鸟!我们是上帝的孩子!
IP: 129.106.142.*   [1]龚云国   2013-8-20 23:46
购买credential  干什么用的啊,我以前没听说过

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