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- 为什么大象不容易得癌症？
- 这不是脑经急转弯。除了大象，还有鲸鱼。 http://en.wikipedia.org/wiki/Peto's_paradox 原因还不很清楚。其中的一种解释是：巨型动物体内细胞的供氧程度比小型动物要低，从而降低了活性氧化物导致 DNA 损伤的几率
- 重启基因组
- 像吾等“电脑土帽”在遇到电脑变慢或者某些地方不对劲的时候，就会把电脑重启一下，通常电脑的状态就会变得好一些。如果每天要重启两次以上，那就说明换电脑的时候到了。 重启电脑的道理很简单：把之前的错误或者不良循环抹掉，让状态变好。我们的基因组每时每刻都受到刺激或者攻击，某些细胞的编码信息会变乱。如果能 ...
- 个体内细胞的基因组演化
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- 在我上大学所用的教科书告诉我 : 一个动物体内除了极少数细胞 ( 例如免疫细胞或癌细胞 ) 的基因组会变化以外，别的细胞的基因组是一样的，细胞的形状和功能的不同取决于基因表达的调节。不知道现在关于个体的基因组的保真性是如何描述的。 我们都不喜欢“盲人摸象”的研究模式，但不幸的是，在研究新事物的时候 ...
- 两篇结果有矛盾的论文的不对称引用
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- 最近看了一些溶酶体酸化与 mTOR 方面的论文，以下两篇论文分别发表在 2011 年 Science 和 2012 年 JBC ，时间相差 7 个月。从 google 的结果来看， Science 那篇被引用了 163 次，而 JBC 那篇只被引用了 4 次。 JBC 的论文后发表，他们用了一定篇幅质疑 Science 论文的主要结果： V-ATPase ...
- 研究转录因子靶基因的两种方法
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- 转录因子可以影响很多基因的表达，可以指导很多不同的生物学过程，包括细胞分化、细胞分裂、大小、代谢等等。研究转录因子的功能需要多种生物学方法，比较容易给研究者带来希望的技术，我认为，有两种：检测 mRNA 变化的 DNA 芯片（ chipor microarray ）和检测转录因子的 DNA 结合的染色体免疫共沉淀 +DNA 芯 ...
- 信号途径中的负反馈
- 细胞内的信号途径用于联系和指挥从单个分子到整个细胞的活动，其重要性可以类比于人类社会的法律、政府和意识形态等等加在一起。所以，信号途径乱则细胞乱。 从人类社会来看，人民希望建立法治公平的社会，防止滥用权力。可能还没有任何一个国家做得很好。做得相对较好的国家有一个共同的特点，那就是基层的声音能发出 ...
- 生物体内的量变到质变
- 动物体内有很多种细胞，有“大不同”的，例如神经元和皮肤细胞，也有“小不同”的，例如神经元也分很多种。这种“小不同”在于形态或者功能上的一些细微区别，而这些“小不同”的细胞有比较近的起源。如果我们看看细胞内部，“小不同”可能反映在某些大分子或者细胞器（线粒体、内质网、溶酶体等）的数目或规模不一样。有 ...
- 癌症为何难治？（发育的鲁棒性）
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- 癌症与退行性疾病（ degeneration ）属于目前最难治的疾病。从成因上来看，两者是相反的：前者产生了人体不想要的东西，后者失去了人体必需的东西。但从机理上来说，两者是很类似的：改变了细胞的正常发育程序。 鲁棒性（ Robustness ）是很重要的科学名词，从数学，生物到社会学都或多或少地出现。因为鲁棒性描述 ...
- 不一致的一半与全部（遗传学）
- 在遗传学研究中，很重要的一种实验是设计筛选模型来研究基因之间的相互作用。为了简化实验复杂度，很多时候研究者看 heterozygous interactions ，就是把两个等位基因的其中一个突变，而另一个是正常的，这样基本可以认为这个基因的表达量缺失了一半。因为这一类实验做起来相对简单，研究者发表了很多论文，也有一些重 ...
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