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生物医学语义技术

已有 6535 次阅读 2012-8-30 23:27 |个人分类:科海拾贝|系统分类:科研笔记| 医学, 生物, 语义技术

     近几十年来,计算机与信息科学领域最重大的科学进展之一就是万维网的诞生与普及。它深刻地影响了整个人类社会的发展进程,同时也给各个领域的科学研究带来了一个全新的信息和知识环境。语义网及其语义技术的发展为处理万维网上的浩瀚的信息和知识资源提供了一个全新的技术,已经在诸多领域得到了广泛的应用。医学及其生命科学的研究成为了语义技术发展与应用最为活跃也最富有成效的领域之一。近十多年来,在计算机科学家与医学与生命科学的领域专家的共同努力下,它已经取得了丰硕的研究成果,极大地丰富了现代医学与生命科学研究的信息资源整合与知识分析管理的手段,促进了现代医学与生命科学的研究发展。



     在这样一个以万维网为主要信息与知识资源的研究环境下,系统地介绍语义技术及其在生物医学领域的发展与应用,具有特别重大的意义。为此,我们特意组织了国内医学与生命科学领域的语义技术研究的著名学者与专家撰写了《生物医学语义技术》一书。这本书最近由浙江大学出版社出版。



      本书主要的设计目标之一是作为医学信息专业与生物信息学专业的研究生教材。但是由于本书涉及的内容极其广泛,不仅涉及到语义技术的基础理论,而且还覆盖了语义技术在生物医学应用的方方面面,故本书对于医学及其生命科学,计算机科学与工程,信息技术等领域的学生,教师和研究人员都将具有一定的参考价值。全书共分十二章。各章节由各位学者专家相对独立完成的,每一章都反映了语义技术以及在生物医学某一方面的最新成果与发展趋势。由于时间有限,及其各个章节相对独立完成等因素,本书的内容安排与描述上纰漏与瑕疵在所难免,敬请各位同行与师生不吝赐教,以便于使本书能够不断完善,与时俱进,以满足研究与教学上的现代化发展的需要。





目录

第一章 语义技术导论
第一节 语义技术概述
第二节 语义万维网
第三节 元数据与本体
第四节 Web 3.0
第五节 关联开放数据
参考文献
第二章 生物医学语义技术概述
第一节 生物医学与语义技术
第二节 医学概念的标准化
第三节 生物医学元数据与本体
第四节 医学语义技术应用案例
参考文献
第三章 元数据语言
第一节 元数据
第二节 元数据语言概貌
第三节 RDF
第四节 RDFS
第五节 SPARQL语言及其实例
参考文献
第四章 本体与逻辑
第一节 本体的主要特征
第二节 逻辑与推理
第三节 描述逻辑基础
第四节 描述逻辑与知识表示
参考文献
第五章 网络本体语言OWL
第一节 OWL概述
第二节 OWL DL
第三节 OWL Lite
第四节 OWL Full
第五节 OWL 2
第六节 OWL本体构建
参考文献
第六章 生物医学元数据与本体
第一节 一体化医学语言系统
第二节 MeSH
第三节 RxNorm
第四节 SNOMED
第五节 基因本体
第六节 UniProt
第七节 MEDLINE
参考文献
第七章 关联生命数据集
第一节 关联生命数据集概况
第二节 关联生命数据集的组成
第三节 关联生命数据集的使用
第四节 分析的结论
参考文献
第八章 生物医学语义检索技术
第一节 语义检索概述
第二节 语义检索的技术方法
第三节 医学检索的问题特征
第四节 医学语义检索的基本技术
第五节 PubMed的语义检索
参考文献
第九章 基于语义的医疗信息技术
第一节 医疗信息系统概论
第二节 语义技术与医疗信息系统
第三节 语义支撑的临床路径
参考文献
第十章 语义技术与生命科学研究
第一节 生命科学中的语义技术应用概述
第二节 语义技术用于基因分析
第三节 语义数据处理平台与GwAS研究
第四节 结论
参考文献
第十一章 中医本体学探索
第一节 中医本体学研究策略思考
第二节 中医顶层本体研究
第三节 建立证候本体的探索
第四节 肺痨病阴虚证的本体
第五节 治则治法本体
第六节 方剂本体的探索
第七节 中医古代文献的概念和术语的语义学整理
第八节 中医维度的六阈值分析法
参考文献
第十二章 医学语义技术深层应用与展望
第一节 语义技术与转化医学
第二节 语义技术与辅助诊疗系统
第三节 基于语义技术的电子病历
第四节 基于语义技术的电子健康档案
第五节 基于语义技术的临床数据交换
参考文献


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